SprD - SprD - Wikipedia
| SprD | |
|---|---|
 Zachovaná sekundární struktura SprD. | |
| Identifikátory | |
| Symbol | SprD |
| Rfam | RF01828 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen |
| Domény | Zlatý stafylokok |
| PDB struktur | PDBe |
v molekulární biologie SprD (Snákupní centrum postrov athogenicity RNA D) je nekódující RNA vyjádřeno dne ostrovy patogenity v Zlatý stafylokok.[1] Bylo to identifikováno in silico spolu s řadou dalších sRNA (SprA-G) microarray analýza, která byla potvrzena pomocí a Northern blot.[2] Bylo zjištěno, že SprD významně přispívá k příčině choroba v zvířecí model.[1]
Funkce
SprD se nachází mezi geny scn a chp v vrozený imunitní únik klastr (IEC) S. aureus genom. Jeho umístění v tomto regionu bylo první známkou a virulence -faktorová regulační funkce.[1]
SprD se váže s sbi (Zlatý stafylokok pořadač IgG )[3] mRNA který kóduje imunní únikový protein. Uzavírá to Sekvence Shine-Dalgarno a iniciační kodon z sbi, tvořící a sbi mRNA-SprD duplex potlačující překlad mRNA.[1]
sbi protein narušuje vrozenou imunitní odpověď hostitele vazbou Faktor H, Doplňte komponentu 3 a IgG.[3][4]
Viz také
Reference
- ^ A b C d Chabelskaya S, Gaillot O, Felden B (červen 2010). „Malá bakterie Staphylococcus aureus je nutná pro bakteriální virulenci a reguluje expresi molekuly imunitního úniku“. PLoS Pathog. 6 (6): e1000927. doi:10.1371 / journal.ppat.1000927. PMC 2880579. PMID 20532214.
- ^ Pichon C, Felden B (říjen 2005). „Malé geny RNA exprimované z genomových a patogenních ostrovů Staphylococcus aureus se specifickou expresí mezi patogenními kmeny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (40): 14249–14254. doi:10.1073 / pnas.0503838102. PMC 1242290. PMID 16183745.
- ^ A b Haupt K, Reuter M, van den Elsen J a kol. (Prosinec 2008). „Protein Staphylococcus aureus Sbi působí jako inhibitor komplementu a tvoří tripartitní komplex s hostitelským komplementem, faktorem H a C3b“. PLoS Pathog. 4 (12): e1000250. doi:10.1371 / journal.ppat.1000250. PMC 2602735. PMID 19112495.
- ^ Zhang L, Jacobsson K, Vasi J, Lindberg M, Frykberg L (duben 1998). „Druhý protein vázající IgG u Staphylococcus aureus“. Mikrobiologie. 144 (4): 985–991. doi:10.1099/00221287-144-4-985. PMID 9579072. Citováno 2010-08-09.
Další čtení
- Upadhyay A, Burman JD, Clark EA a kol. (Srpen 2008). "Strukturně-funkční analýza vazebné oblasti C3 proteinu Sbi imunitní subverze Staphylococcus aureus". J. Biol. Chem. 283 (32): 22113–22120. doi:10,1074 / jbc.M802636200. PMC 2494919. PMID 18550524.
- Burman JD, Leung E, Atkins KL a kol. (Červen 2008). „Interakce lidského komplementu s Sbi, proteinem vázajícím stafylokokové imunoglobuliny: náznaky nového mechanismu úniku komplementu Staphylococcus aureus“. J. Biol. Chem. 283 (25): 17579–17593. doi:10,1074 / jbc.M800265200. PMC 2649420. PMID 18434316.
- Atkins KL, Burman JD, Chamberlain ES a kol. (Březen 2008). "S. aureus IgG-vazebné proteiny SpA a Sbi: specificita hostitele a mechanismy tvorby imunitního komplexu". Mol. Immunol. 45 (6): 1600–1611. doi:10.1016 / j.molimm.2007.10.021. PMID 18061675.
- Chabelskaya S, Bordeau V, Felden B (1. dubna 2014). "Regulační kontrola duální RNA faktoru virulence Staphylococcus aureus". Výzkum nukleových kyselin. 42 (8): 4847–4858. doi:10.1093 / nar / gku119. PMC 4005698. PMID 24510101.