Senzorický rhodopsin II - Sensory rhodopsin II

Tento článek obsahuje a seznam doporučení, související čtení nebo externí odkazy, ale jeho zdroje zůstávají nejasné, protože mu chybí vložené citace. Prosím pomozte zlepšit tento článek představuji přesnější citace. (Září 2018) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)

Krystalová struktura komplexního dimeru NpSRII-HtrII. SRII je modře. Pohled je podél membrány, extracelulární prostor je nahoře. Jsou vyřešeny pouze transmembránové šroubovice HtrII.

Senzorický rhodopsin II (SRII), také známý jako pharaonis phoborhodopsin (strpR), je membránový protein z archaea, odpovědný za generování fototaxe signál. Senzorický rhodopsin II se nachází v Halobacterium salinarum a Natronomonas pharaonis.

Struktura

Struktura senzorického rhodopsinu II je typická pro mikrobiální rhodopsin. Skládá se ze sedmi transmembránový a-helixy s sítnice molekula připojena přes Schiffova základna na K. 205. Pozoruhodným rysem senzorického rhodopsinu II je přítomnost nabitého zbytek Y 199 na povrchu hydrofobní kraj. Tento zbytek je odpovědný za vazbu senzorického proteinu rodopsinu II - HtrII. HtrII se skládá ze dvou transmembránových šroubovic, dvou HAMP domény a signální doménu přijímající methyl. V případě Halobacterium salinarum HtrII také zahrnuje extracelulární chemosenzorovou oblast, za kterou je zodpovědný serin snímání.

Funkce

SRII v plazmatická membrána váže svůj snímač prostřednictvím řady vazby. Foton absorpce vyvolává strukturální změny v SRII, které, když jsou vedeny k HtrII. HtrII zase reguluje úroveň nevázaného kinázy v cytoplazma. Kinázy regulují rotaci bičíky fosforilací. Signál fototaxe je tedy konvertován v pohybu bakterií.

Další čtení

• Klare, J .; Chizhov, I .; Engelhard, M. (2008). „Microbial Rhodopsins: Scaffolds for Ion Pumps, Channels, and Sensors“. Bioenergetika. Výsledky a problémy v diferenciaci buněk. 45. str. 73–122. doi:10.1007/400_2007_041. ISBN  978-3-540-78621-4. PMID  17898961.
• Sasaki, J .; Spudich, J. (2008). "Přenos signálu v komplexech haloarchaeal senzorických rhodopsin-převodník". Fotochemie a fotobiologie. 84 (4): 863–868. doi:10.1111 / j.1751-1097.2008.00314.x. PMID  18346091.