SYCP3 - SYCP3

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Doména XLR / SYCP3 / FAM9
Identifikátory
Symbol	Cor1
Pfam	PF04803
InterPro	IPR006888
KOCOUR	4cpc
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

SYCP3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4CPC
Identifikátory
Aliasy	SYCP3, COR1, SCP3, SPGF4, RPRGL4, synaptonemální komplexní protein 3
Externí ID	OMIM: 604759 MGI: 109542 HomoloGene: 7964 Genové karty: SYCP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	101,739,472 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	88,473,236 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • chromozóm; • synaptonemální komplex; • boční prvek; • chromozom, centromerická oblast;
Biologický proces	• buněčný cyklus; • mužská meióza I; • spermatogeneze, výměna chromozomálních proteinů; • buněčné dělení; • GO: 0007126 meiotický buněčný cyklus; • spermatogeneze; • vývoj spermatidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	50511
	20962
	ENSG00000139351
	ENSMUSG00000020059
	Q8IZU3
	P70281
	NM_001177948; NM_001177949; NM_153694
	NM_011517
	NP_001171419; NP_001171420; NP_710161
	NP_035647
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synaptonemální komplexní protein 3 je protein že u lidí je kódován SYCP3 gen.^[5]^[6]^[7] Je to součást synaptonemální komplex vytvořené mezi homologními chromozomy během profáze z redukční dělení buněk.^[8]

Genová rodina

SYCP3 je také známý jako COR1. Obsahuje konzervovanou doménu coiled-coil, která se také nachází ve FAM9 (FAM9A, FAM9B ) rodina proteinů nalezená na lidském X chromozomu.^[5]

Několik proteinů podobných SYCP3 se nachází na pohlavních chromozomech myší. Jsou jim přiřazena jména začínající Slx nebo Sly v závislosti na chromozomu, ke kterému jsou spojeny. Slx / Slxl1 a Sly jsou nefunkční, které mají opačné účinky na genovou expresi a epigenetické modifikace a každý gen snižuje životaschopnost a mobilitu (prostřednictvím spindlin vazba) spermií obsahujících druhý pohlavní chromozom, čímž se nakloní poměr pohlaví k jejich vlastnímu prospěchu.^[9] Postupem času jsou duplikovány, aby se vyvážily vzájemné efekty.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139351 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020059 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Martinez-Garay I, Jablonka S, Sutajova M, Steuernagel P, Gal A, Kutsche K (září 2002). „Nová genová rodina (FAM9) opakování s nízkou kopií v Xp22.3 exprimovaná výlučně ve varlatech: důsledky pro rekombinace v této oblasti“. Genomika. 80 (3): 259–67. doi:10.1006 / geno.2002.6834. PMID 12213195.
^ Mallon AM, Platzer M, Bate R, Gloeckner G, Botcherby MR, Nordsiek G a kol. (Červen 2000). "Srovnávací analýza genomové sekvence oblasti Bpa / Str u myší a člověka". Výzkum genomu. 10 (6): 758–75. doi:10,1101 / gr.10.6.758. PMC 310879. PMID 10854409.
^ „Entrez Gene: SYCP3 synaptonemální komplexní protein 3“.
^ Syrjänen JL, Pellegrini L, Davies OR (červen 2014). „Molekulární model role SYCP3 v organizaci meiotických chromozomů“. eLife. 3. doi:10,7554 / eLife.02963. PMC 4102245. PMID 24950965.
^ Cocquet J, Ellis PJ, Mahadevaiah SK, Affara NA, Vaiman D, Burgoyne PS (září 2012). „Genetický základ pro postmeiotický intragenomický konflikt chromozomu X proti Y“ u myši. Genetika PLOS. 8 (9): e1002900. doi:10.1371 / journal.pgen.1002900. PMC 3441658. PMID 23028340.
^ Kruger AN, Brogley MA, Huizinga JL, Kidd JM, de Rooij DG, Hu YC, Mueller JL (říjen 2019). „Nefunkcionalizovaná rodina X-vázaných amplikonových genů je nezbytná pro mužskou plodnost a poměr stejného pohlaví u myší“. Aktuální biologie. 29 (21): 3699–3706.e5. doi:10.1016 / j.cub.2019.08.057. PMC 7012382. PMID 31630956.

Další čtení

Yuan L, Liu JG, Zhao J, Brundell E, Daneholt B, Höög C (leden 2000). „Myší gen SCP3 je vyžadován pro sestavení synaptonemálního komplexu, synapsu chromozomů a mužskou plodnost.“ Molekulární buňka. 5 (1): 73–83. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80404-9. PMID 10678170.
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T a kol. (Říjen 2001). „Panel interakce protein-protein využívající myší plné délky cDNA“. Výzkum genomu. 11 (10): 1758–65. doi:10,1101 / gr. 180101. PMC 311163. PMID 11591653.
Lee J, Iwai T, Yokota T, Yamashita M (červenec 2003). „Dočasně a prostorově selektivní ztráta proteinu Rec8 z meiotických chromozomů během meiózy savců“. Journal of Cell Science. 116 (Pt 13): 2781–90. doi:10.1242 / jcs.00495. PMID 12759374.
Miyamoto T, Hasuike S, Yogev L, Maduro MR, Ishikawa M, Westphal H, Lamb DJ (listopad 2003). "Azoospermie u pacientů heterozygotních pro mutaci v SYCP3". Lanceta. 362 (9397): 1714–9. doi:10.1016 / S0140-6736 (03) 14845-3. PMID 14643120. S2CID 44513816.
de Boer P, Giele M, Lock MT, de Rooij DG, Giltay J, Hochstenbach R, te Velde ER (2004). „Kinetika meiózy u azoospermatických mužů: společný histologický a cytologický přístup“. Cytogenetický a genomový výzkum. 105 (1): 36–46. doi:10.1159/000078007. hdl:1874/11543. PMID 15218256. S2CID 26325415.
Stouffs K, Lissens W, Tournaye H, Van Steirteghem A, Liebaers I (říjen 2005). „Mutace SYCP3 jsou u pacientů s azoospermií neobvyklé“. Plodnost a sterilita. 84 (4): 1019–20. doi:10.1016 / j.fertnstert.2005.04.033. PMID 16213863.
Aarabi M, Modarressi MH, Soltanghoraee H, Behjati R, Amirjannati N, Akhondi MM (srpen 2006). "Testikulární exprese synaptonemálního komplexního proteinu 3 (SYCP3) messenger ribonukleové kyseliny u 110 pacientů s neobstrukční azoospermií". Plodnost a sterilita. 86 (2): 325–31. doi:10.1016 / j.fertnstert.2005.12.070. PMID 16824523.
Sapkota G, Knockaert M, Alarcón C, Montalvo E, Brivanlou AH, Massagué J (prosinec 2006). „Defosforylace spojovacích oblastí Smad1 a Smad2 / 3 malými fosfatázami na C-terminální doméně má odlišné výsledky pro kostní morfogenetický protein a cesty transformujícího růstového faktoru-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (52): 40412–9. doi:10,1074 / jbc.M610172200. PMID 17085434.
Martínez J, Bonache S, Carvajal A, Bassas L, Larriba S (říjen 2007). „Mutace SYCP3 jsou vzácné u neplodných španělských mužů s meiotickou zástavou“. Plodnost a sterilita. 88 (4): 988–9. doi:10.1016 / j.fertnstert.2006.11.163. PMID 17434513.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8IZU3 (Protein lidského synaptonemálního komplexu 3) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P70281 (Myší synaptonemální komplexní protein 3) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139351 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020059 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12213195-5] A ^b Martinez-Garay I, Jablonka S, Sutajova M, Steuernagel P, Gal A, Kutsche K (září 2002). „Nová genová rodina (FAM9) opakování s nízkou kopií v Xp22.3 exprimovaná výlučně ve varlatech: důsledky pro rekombinace v této oblasti“. Genomika. 80 (3): 259–67. doi:10.1006 / geno.2002.6834. PMID 12213195.

[pmid10854409-6] Mallon AM, Platzer M, Bate R, Gloeckner G, Botcherby MR, Nordsiek G a kol. (Červen 2000). "Srovnávací analýza genomové sekvence oblasti Bpa / Str u myší a člověka". Výzkum genomu. 10 (6): 758–75. doi:10,1101 / gr.10.6.758. PMC 310879. PMID 10854409.

[entrez-7] „Entrez Gene: SYCP3 synaptonemální komplexní protein 3“.

[pmid24950965-8] Syrjänen JL, Pellegrini L, Davies OR (červen 2014). „Molekulární model role SYCP3 v organizaci meiotických chromozomů“. eLife. 3. doi:10,7554 / eLife.02963. PMC 4102245. PMID 24950965.

[9] Cocquet J, Ellis PJ, Mahadevaiah SK, Affara NA, Vaiman D, Burgoyne PS (září 2012). „Genetický základ pro postmeiotický intragenomický konflikt chromozomu X proti Y“ u myši. Genetika PLOS. 8 (9): e1002900. doi:10.1371 / journal.pgen.1002900. PMC 3441658. PMID 23028340.

[10] Kruger AN, Brogley MA, Huizinga JL, Kidd JM, de Rooij DG, Hu YC, Mueller JL (říjen 2019). „Nefunkcionalizovaná rodina X-vázaných amplikonových genů je nezbytná pro mužskou plodnost a poměr stejného pohlaví u myší“. Aktuální biologie. 29 (21): 3699–3706.e5. doi:10.1016 / j.cub.2019.08.057. PMC 7012382. PMID 31630956.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]