SSU rRNA - SSU rRNA
Malá podjednotka ribozomální ribonukleová kyselina (SSU rRNA) je nejmenší ze dvou hlavních RNA součásti ribozom.Associated with a number of ribozomální proteiny, SSU rRNA tvoří malou podjednotku ribozomu. Je kódován SSU-rDNA.
| SSU rRNA | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Symbol | SSU |
| Rfam | CL00111 |
| Další údaje | |
| PDB struktur | PDBe |
Vlastnosti
| Typ | Velikost SSR rRNA | Druh | Délka | Přistoupení | Odkaz |
|---|---|---|---|---|---|
| Bakteriální (prokaryotický) | 16S | Escherichia coli | 1541 nt | J01859.1 | [1] |
| Archaeal (prokaryotický) | 16S | Halobacterium salinarum | 1473 nt | M38280.1 | [2] |
| Eukaryotický | 18S | Homo sapiens | 1 969 nt | M10098.1 | [3] |
| Mitochondriální | 12S | Homo sapiens | 954 nt | NC_012920.1 | [4],[5] |
| Plastid | 16S | Arabidopsis thaliana | 1491 nt | NC_000932.1 | [6] |
Použití ve fylogenetice
SSU rRNA sekvence jsou široce používány pro zpracování evoluční vztahy mezi organismy, protože jsou starodávného původu a nacházejí se ve všech známých formách života.[7]
Viz také
- LSU rRNA: large subunit ribozomální ribonukleová kyselina.
Reference
- ^ "Escherichia coli 16S ribozomální RNA ".
- ^ "Halobacterium salinarum 16S ribozomální RNA ".
- ^ "Homo sapiens 18S ribozomální RNA (jaderná) ".
- ^ Homo sapiens mitochondrie, kompletní genom. „Revised Cambridge Reference Sequence (rCRS): access NC_012920“, Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno dne 20. února 2017.
- ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J a kol. (Duben 1981). "Pořadí a organizace lidského mitochondriálního genomu". Příroda. 290 (5806): 457–465. Bibcode:1981 Natur.290..457A. doi:10.1038 / 290457a0. PMID 7219534.
- ^ "Arabidopsis thaliana 16S ribozomální RNA (chloroplast) ".
- ^ Woese CR Kandler O, Wheelis ML (červen 1990). „Směrem k přirozenému systému organismů: návrh domén Archaea, Bacteria a Eucarya“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (12): 4576–4579. Bibcode:1990PNAS ... 87,4576 W.. doi:10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744.