LSU rRNA - LSU rRNA
Velká podjednotka ribozomální ribonukleová kyselina (LSU rRNA) je největší ze dvou hlavních RNA součásti ribozom.Associated with a number of ribozomální proteiny, LSU rRNA tvoří velkou podjednotku ribozomu. LSU rRNA působí jako a ribozym katalyzující tvorba peptidové vazby.
| LSU rRNA | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Symbol | LSU |
| Rfam | CL00112 |
| Další údaje | |
| PDB struktur | PDBe |
Vlastnosti
| Typ | Velikost LSU rRNA | Druh | Délka | Přistoupení | Odkaz |
|---|---|---|---|---|---|
| Bakteriální (prokaryotický) | 23S | Escherichia coli | 2,905 nt | NR_076322.1 | [1] |
| Archaeal (prokaryotický) | 23S | Halobacterium salinarum | 2,906 nt | NR_076247.1 | [2] |
| Eukaryotický | 5,8S & 28S | Homo sapiens | 157 + 5 025 nt | NR_145821.1; M11167.1 | [3][4] |
| Mitochondriální | 16S | Homo sapiens | 1559 nt | NC_012920.1 | [5][6] |
| Plastid | 23S | Arabidopsis thaliana | 2 810 nt | NC_000932.1 | [7] |
Použití ve fylogenetice
Pro zpracování jsou široce používány LSU rRNA sekvence evoluční vztahy mezi organismy, protože jsou starodávného původu a nacházejí se ve všech známých formách života.
Viz také
- SSU rRNA: snákupní centrum subunit ribozomální ribonukleová kyselina.
Reference
- ^ "Escherichia coli 23S ribozomální RNA ".
- ^ "Halobacterium salinarum 23S ribozomální RNA ".
- ^ „Homo sapiens RNA, 5,8S ribozomální N1 (RNA5-8SN1), ribozomální RNA“. 3. července 2020.
- ^ "Homo sapiens 28S ribozomální RNA (jaderná) ".
- ^ Homo sapiens mitochondrie, kompletní genom. „Revised Cambridge Reference Sequence (rCRS): access NC_012920“, Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno dne 20. února 2017.
- ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, Eperon IC, Nierlich DP, Roe BA, Sanger F, Schreier PH, Smith AJ, Staden R, Young IG (duben 1981). "Pořadí a organizace lidského mitochondriálního genomu". Příroda. 290 (5806): 457–465. doi:10.1038 / 290457a0. PMID 7219534.
- ^ "Arabidopsis thaliana 23S ribozomální RNA (chloroplast) ".