SMTN - SMTN

SMTN
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D87
Identifikátory
Aliasy	SMTNsmoothelin
Externí ID	OMIM: 602127 MGI: 1354727 HomoloGene: 8482 Genové karty: SMTN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	31,104,757 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	3,540,612 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktinová vazba; • strukturní složka svalu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytoskelet; • aktinový cytoskelet; • organizační centrum mikrotubulů; • vláknitý aktin; • nukleoplazma;
Biologický proces	• kontrakce hladkého svalstva; • vývoj svalových orgánů; • organizace aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6525
	29856
	ENSG00000183963
	ENSMUSG00000020439
	P53814
	Q921U8
	NM_001207017; NM_001207018; NM_006932; NM_134269; NM_134270
	NM_001159284; NM_001284427; NM_001284428; NM_001284429; NM_013870
NP_001193946; NP_001193947; NP_008863; NP_599031; NP_599032;
	NP_001369567; NP_001369568; NP_001369569; NP_001369570; NP_001369571; NP_001369572; NP_001369573; NP_001369574; NP_001369575; NP_001369576; NP_001369577
	NP_001152756; NP_001271356; NP_001271357; NP_001271358; NP_038898
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Smoothelin je protein že u lidí je kódován SMTN gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje a strukturní protein který se nachází výhradně v kontraktilitě hladký sval buňky. Sdružuje se se stresovými vlákny a je součástí cytoskelet. Tento gen je lokalizován na chromozom 22q12.3, distálně od lokusu TUPLE1 a mimo DiGeorgeův syndrom vymazání. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke třem variantám transkriptu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183963 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020439 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Engelen JJ, Esterling LE, Albrechts JC, Detera-Wadleigh SD, van Eys GJ (září 1997). "Přiřazení lidského genu pro smoothelinu (SMTN) k chromozomu 22q12 pomocí fluorescenční in situ hybridizace a radiačního hybridního mapování". Genomika. 43 (2): 245–7. doi:10.1006 / geno.1997.9999. PMID 9244445.
^ van der Loop FT, Schaart G, Timmer ED, Ramaekers FC, van Eys GJ (září 1996). „Smoothelin, nový cytoskeletální protein specifický pro buňky hladkého svalstva“. J Cell Biol. 134 (2): 401–11. doi:10.1083 / jcb.134.2.401. PMC 2120883. PMID 8707825.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SMTN smoothelin“.

Další čtení

Luft FC (1999). Msgstr "Rozlišování jednoho hladkého operátoru od druhého". J. Mol. Med. 77 (2): 255–7. doi:10,1007 / s001090050347. PMID 10023778.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
van Eys GJ, Völler MC, Timmer ED a kol. (1997). "Charakteristické vlastnosti smoothelinu: vývoj in vitro systému buněk hladkého svalstva a identifikace vaskulární varianty". Struktura buněk. Funct. 22 (1): 65–72. doi:10.1247 / csf.22.65. PMID 9113392.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Krämer J, Aguirre-Arteta AM, Thiel C a kol. (1999). "Nová izoforma diferenciačního markeru buněk hladkého svalstva smoothelinu". J. Mol. Med. 77 (2): 294–8. doi:10,1007 / s001090050352. PMID 10023782.
Johansson B, Eriksson A, Ramaekers F, Thornell L (2000). "Smoothelin u dospělých a vyvíjející se lidské tepny a myokard". Histochem. Cell Biol. 112 (4): 291–9. doi:10,1007 / s004180050450. PMID 10550614.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Gsell S, Eschenhagen T, Kaspareit G a kol. (2000). „Zdánlivá up-regulace stimulačních podjednotek alfa-proteinu G-proteinu v myometriu těhotných lidí je napodobena zvýšenou expresí smoothelinu“. FASEB J.. 14 (1): 17–26. doi:10.1096 / fasebj.14.1.17. PMID 10627276.
Krämer J, Quensel C, Meding J a kol. (2001). „Identifikace a charakterizace nových izoforem smoothelinu v hladkém svalstvu cév“. J. Vasc. Res. 38 (2): 120–32. doi:10.1159/000051039. PMID 11316948.
Rensen SS, Thijssen VL, De Vries CJ a kol. (2002). „Exprese genu pro smoothelin je zprostředkována alternativními promotory“. Cardiovasc. Res. 55 (4): 850–63. doi:10.1016 / S0008-6363 (02) 00491-1. PMID 12176134.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183963 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020439 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9244445-5] Engelen JJ, Esterling LE, Albrechts JC, Detera-Wadleigh SD, van Eys GJ (září 1997). "Přiřazení lidského genu pro smoothelinu (SMTN) k chromozomu 22q12 pomocí fluorescenční in situ hybridizace a radiačního hybridního mapování". Genomika. 43 (2): 245–7. doi:10.1006 / geno.1997.9999. PMID 9244445.

[pmid8707825-6] van der Loop FT, Schaart G, Timmer ED, Ramaekers FC, van Eys GJ (září 1996). „Smoothelin, nový cytoskeletální protein specifický pro buňky hladkého svalstva“. J Cell Biol. 134 (2): 401–11. doi:10.1083 / jcb.134.2.401. PMC 2120883. PMID 8707825.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SMTN smoothelin“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]