SH3KBP1 - SH3KBP1

SH3KBP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2BZ8, 2K6D, 2K9G, 2O2O, 2YDL, 5ABS, 2N64
Identifikátory
Aliasy	SH3KBP1, CD2BP3, CIN85, GIG10, HSB-1, HSB1, MIG18, SH3 doména obsahující protein vázající kinázu 1, IMD61, AGMX2
Externí ID	OMIM: 300374 MGI: 1889583 HomoloGene: 10971 Genové karty: SH3KBP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	19,887,600 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	159,978,069 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba domény SH3; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytosol; • membrána; • mezibuněčné spojení; • ohnisková adheze; • buněčná membrána; • endocytický váček; • synapse; • buněčné spojení; • neuronová projekce; • cytoskelet; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • cytoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace signální dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru; • endocytóza; • signalizace buňka-buňka; • organizace cytoskeletu; • regulace tvaru buňky; • migrace buněk; • apoptotický proces; • membránová organizace; • axonové vedení; • organizace aktinových vláken;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	30011
	58194
	ENSG00000147010
	ENSMUSG00000040990
	Q96B97; Q5JPT2
	Q8R550
NM_001024666; NM_001184960; NM_031892; NM_001353890; NM_001353891;
	NM_001353892; NM_001353893; NM_001353894; NM_001353895; NM_001353897
NM_001135727; NM_001135728; NM_001290661; NM_001290664; NM_021389;
	NM_001374701
NP_001019837; NP_001171889; NP_114098; NP_001340819; NP_001340820;
	NP_001340821; NP_001340822; NP_001340823; NP_001340824; NP_001340826
NP_001129199; NP_001129200; NP_001277590; NP_001277593; NP_067364;
	NP_001361630
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající kinázu SH3 na doménu 1 (synonyma - CIN85^[5], u hlodavců - Ruk^[6]) je adaptační protein že u lidí je kódován SH3KBP1 gen.^[7]^[8]

Funkce

CBL (MIM 165360) konstitutivně interaguje s proteiny obsahujícími doménu SH3 a po fosforylaci tyrosinu s proteiny obsahujícími doménu SH2. Gen SH3KBP1 kóduje protein interagující s CBL o hmotnosti 85 kD, který zvyšuje apoptotickou buněčnou smrt zprostředkovanou faktorem nekrotizujícím tumor (MIM 191160) (Narita et al., 2001). [Dodáno společností OMIM]^[9]

Interakce

SH3KBP1 bylo prokázáno komunikovat s Linker B-buněk,^[10] Grb2,^[11]^[12] SH3GLB2,^[13]^[14] SH3GL3,^[13] SH3GL2,^[14] BCAR1,^[10] Receptor epidermálního růstového faktoru,^[14]^[15] CBLB,^[15] Gen Cbl,^[10]^[12]^[13]^[14]^[15] SOS1,^[10] CRK^[10] a PAK2.^[16]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147010 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040990 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Databáze, GeneCards Human Gene. "SH3KBP1 Gene - GeneCards | SH3K1 Protein | SH3K1 Antibody". www.genecards.org. Citováno 2017-12-28.
^ Dna I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL (srpen 2000). „Negativní regulace PI 3-kinázy Ruk, nový adaptační protein“. Časopis EMBO. 19 (15): 4015–25. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4015. PMC 306608. PMID 10921882.
^ Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S a kol. (Září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
^ Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
^ "Entrez Gene: SH3KBP1 SH3-doména kinázový vazebný protein 1".
^ ^A ^b ^C ^d ^E Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (listopad 2000). „Charakterizace adaptorového proteinu CIN85 a identifikace komponent obsažených v komplexech CIN85“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 278 (1): 167–74. doi:10,1006 / bbrc.2000.3760. PMID 11071869.
^ Dna I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL (srpen 2000). „Negativní regulace PI 3-kinázy Ruk, nový adaptační protein“. Časopis EMBO. 19 (15): 4015–25. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4015. PMC 306608. PMID 10921882.
^ ^A ^b Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O (prosinec 2000). „SETA je multifunkční adaptační protein se třemi doménami SH3, který váže Grb2, Cbl a nové proteiny SB1“. Mobilní signalizace. 12 (11–12): 769–79. doi:10.1016 / S0898-6568 (00) 00129-7. PMID 11152963.
^ ^A ^b ^C Petrelli A, Gilestro GF, Lanzardo S, Comoglio PM, Migone N, Giordano S (březen 2002). „Komplex endofilin-CIN85-Cbl zprostředkovává ligandově závislou downregulaci c-Met“. Příroda. 416 (6877): 187–90. doi:10.1038 / 416187a. PMID 11894096.
^ ^A ^b ^C ^d Soubeyran P, Kowanetz K, Szymkiewicz I, Langdon WY, Dikic I (březen 2002). „Komplex Cbl-CIN85-endofilin zprostředkovává ligandem indukovanou downregulaci receptorů EGF“. Příroda. 416 (6877): 183–7. doi:10.1038 / 416183a. PMID 11894095.
^ ^A ^b ^C Szymkiewicz I, Kowanetz K, Soubeyran P, Dinarina A, Lipkowitz S, Dikic I (říjen 2002). "CIN85 se účastní Cbl-b zprostředkované down-regulace receptorových tyrosin kináz". The Journal of Biological Chemistry. 277 (42): 39666–72. doi:10,1074 / jbc.M205535200. PMID 12177062.
^ Kurakin AV, Wu S, Bredesen DE (září 2003). „Atypické rozpoznávání shody domén CIN85 / SETA / Ruk SH3 odhalené iteračním screeningem s asistencí cíle“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (36): 34102–9. doi:10,1074 / jbc.M305264200. PMID 12829691.

Další čtení

Salvatore P, Hanash CR, Kido Y, Imai Y, Accili D (březen 1998). „Identifikace sirmu, nového inzulínem regulovaného proteinu vázajícího SH3, který se asociuje s Grb-2 a FYN“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (12): 6989–97. doi:10.1074 / jbc.273.12.6989. PMID 9507006.
Li J, Nishizawa K, An W, Hussey RE, Lialios FE, Salgia R, Sunder-Plassmann R, Reinherz EL (prosinec 1998). „Adaptérový protein podobný cdc15 (CD2BP1) interaguje s cytoplazmatickou doménou CD2 a reguluje adhezi vyvolanou CD2“. Časopis EMBO. 17 (24): 7320–36. doi:10.1093 / emboj / 17.24.7320. PMC 1171078. PMID 9857189.
Vezměte H, Watanabe S, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (únor 2000). „Klonování a charakterizace nového adaptorového proteinu, CIN85, který interaguje s c-Cbl“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 268 (2): 321–8. doi:10,1006 / bbrc.2000.2147. PMID 10679202.
Chen B, Borinstein SC, Gillis J, Sykes VW, Bogler O (červen 2000). „Protein SETA spojený s gliomem interaguje s AIP1 / Alix a ALG-2 a moduluje apoptózu v astrocytech“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (25): 19275–81. doi:10,1074 / jbc.M908994199. PMID 10858458.
Dna I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL (srpen 2000). „Negativní regulace PI 3-kinázy Ruk, nový adaptační protein“. Časopis EMBO. 19 (15): 4015–25. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4015. PMC 306608. PMID 10921882.
Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (listopad 2000). „Charakterizace adaptorového proteinu CIN85 a identifikace komponent obsažených v komplexech CIN85“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 278 (1): 167–74. doi:10,1006 / bbrc.2000.3760. PMID 11071869.
Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O (prosinec 2000). „SETA je multifunkční adaptační protein se třemi doménami SH3, který váže Grb2, Cbl a nové proteiny SB1“. Mobilní signalizace. 12 (11–12): 769–79. doi:10.1016 / S0898-6568 (00) 00129-7. PMID 11152963.
Narita T, Amano F, Yoshizaki K, Nishimoto N, Nishimura T, Tajima T, Namiki H, Taniyama T (2001). "Přiřazení SH3KBP1 k lidskému chromozomovému pásmu Xp22.1 -> p21.3 hybridizací in situ". Cytogenetika a buněčná genetika. 93 (1–2): 133–4. doi:10.1159/000056966. PMID 11474197.
Soubeyran P, Kowanetz K, Szymkiewicz I, Langdon WY, Dikic I (březen 2002). „Komplex Cbl-CIN85-endofilin zprostředkovává ligandem indukovanou downregulaci receptorů EGF“. Příroda. 416 (6877): 183–7. doi:10.1038 / 416183a. PMID 11894095.
Petrelli A, Gilestro GF, Lanzardo S, Comoglio PM, Migone N, Giordano S (březen 2002). „Komplex endofilin-CIN85-Cbl zprostředkovává ligandově závislou downregulaci c-Met“. Příroda. 416 (6877): 187–90. doi:10.1038 / 416187a. PMID 11894096.
Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, Annan RS, Miller WT (srpen 2002). "Identifikace nových ligandů domény SH3 pro kinázu rodiny Src Hck. Protein syndromu Wiskott-Aldrich (WASP), protein interagující s WASP (WIP) a ELMO1". The Journal of Biological Chemistry. 277 (31): 28238–46. doi:10,1074 / jbc.M202783200. PMID 12029088.
Verdier F, Valovka T, Zhyvoloup A, Drobot LB, Buchman V, Waterfield M, Dna I (červenec 2002). „Ruk je ubikvitinován, ale proteazom se nezhoršuje“. European Journal of Biochemistry. 269 (14): 3402–8. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03031.x. PMID 12135478.
Szymkiewicz I, Kowanetz K, Soubeyran P, Dinarina A, Lipkowitz S, Dikic I (říjen 2002). "CIN85 se účastní Cbl-b zprostředkované down-regulace receptorových tyrosin kináz". The Journal of Biological Chemistry. 277 (42): 39666–72. doi:10,1074 / jbc.M205535200. PMID 12177062.
Haglund K, Shimokawa N, Szymkiewicz I, Dikic I (září 2002). "Monobikvitinace CIN85 zaměřená na Cbl se podílí na regulaci degradace receptorů EGF vyvolané ligandem". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (19): 12191–6. doi:10.1073 / pnas.192462299. PMC 129420. PMID 12218189.
Buchman VL, Luke C, Borthwick EB, Gout I, Ninkina N (červenec 2002). "Organizace myšího lokusu Ruk a exprese izoforem v myších tkáních". Gen. 295 (1): 13–17. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00821-1. PMID 12242006.
Tibaldi EV, Reinherz EL (březen 2003). „CD2BP3, CIN85 a strukturně příbuzný adaptační protein CMS se váží na stejný cytoplazmatický segment CD2, ale vyvolávají odlišné funkční aktivity“. Mezinárodní imunologie. 15 (3): 313–29. doi:10.1093 / intimm / dxg032. PMID 12618476.
Hutchings NJ, Clarkson N, Chalkley R, Barclay AN, Brown MH (červen 2003). „Spojení povrchového proteinu T buněk CD2 s proteinem CAPZ omezujícím aktin prostřednictvím CMS a CIN85“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (25): 22396–403. doi:10,1074 / jbc.M302540200. PMID 12690097.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147010 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040990 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Databáze, GeneCards Human Gene. "SH3KBP1 Gene - GeneCards | SH3K1 Protein | SH3K1 Antibody". www.genecards.org. Citováno 2017-12-28.

[6] Dna I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL (srpen 2000). „Negativní regulace PI 3-kinázy Ruk, nový adaptační protein“. Časopis EMBO. 19 (15): 4015–25. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4015. PMC 306608. PMID 10921882.

[pmid8889549-7] Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S a kol. (Září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.

[pmid7566098-8] Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.

[entrez-9] "Entrez Gene: SH3KBP1 SH3-doména kinázový vazebný protein 1".

[pmid11071869-10] A ^b ^C ^d ^E Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (listopad 2000). „Charakterizace adaptorového proteinu CIN85 a identifikace komponent obsažených v komplexech CIN85“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 278 (1): 167–74. doi:10,1006 / bbrc.2000.3760. PMID 11071869.

[pmid10921882-11] Dna I, Middleton G, Adu J, Ninkina NN, Drobot LB, Filonenko V, Matsuka G, Davies AM, Waterfield M, Buchman VL (srpen 2000). „Negativní regulace PI 3-kinázy Ruk, nový adaptační protein“. Časopis EMBO. 19 (15): 4015–25. doi:10.1093 / emboj / 19.15.4015. PMC 306608. PMID 10921882.

[pmid11152963-12] A ^b Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O (prosinec 2000). „SETA je multifunkční adaptační protein se třemi doménami SH3, který váže Grb2, Cbl a nové proteiny SB1“. Mobilní signalizace. 12 (11–12): 769–79. doi:10.1016 / S0898-6568 (00) 00129-7. PMID 11152963.

[pmid11894096-13] A ^b ^C Petrelli A, Gilestro GF, Lanzardo S, Comoglio PM, Migone N, Giordano S (březen 2002). „Komplex endofilin-CIN85-Cbl zprostředkovává ligandově závislou downregulaci c-Met“. Příroda. 416 (6877): 187–90. doi:10.1038 / 416187a. PMID 11894096.

[pmid11894095-14] A ^b ^C ^d Soubeyran P, Kowanetz K, Szymkiewicz I, Langdon WY, Dikic I (březen 2002). „Komplex Cbl-CIN85-endofilin zprostředkovává ligandem indukovanou downregulaci receptorů EGF“. Příroda. 416 (6877): 183–7. doi:10.1038 / 416183a. PMID 11894095.

[pmid12177062-15] A ^b ^C Szymkiewicz I, Kowanetz K, Soubeyran P, Dinarina A, Lipkowitz S, Dikic I (říjen 2002). "CIN85 se účastní Cbl-b zprostředkované down-regulace receptorových tyrosin kináz". The Journal of Biological Chemistry. 277 (42): 39666–72. doi:10,1074 / jbc.M205535200. PMID 12177062.

[pmid12829691-16] Kurakin AV, Wu S, Bredesen DE (září 2003). „Atypické rozpoznávání shody domén CIN85 / SETA / Ruk SH3 odhalené iteračním screeningem s asistencí cíle“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (36): 34102–9. doi:10,1074 / jbc.M305264200. PMID 12829691.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]