RuvB-like 1 - RuvB-like 1

RUVBL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2C9O, 2XSZ
Identifikátory
Aliasy	RUVBL1, ECP54, INO80H, NMP238, PONTIN, Pontin52, RVB1, TIH1, TIP49, TIP49A, ECP-54, NMP 238, RuvB jako AAA ATPáza 1
Externí ID	OMIM: 603449 MGI: 1928760 HomoloGene: 37839 Genové karty: RUVBL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	128,153,914 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	88,497,572 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0043141 5'-3 'aktivita DNA helikázy; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • GO: 0004003 aktivita DNA helikázy; • Aktivita ATPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • kadherinová vazba; • Vazba transkripčního faktoru třídy TFIID; • Vazba ADP; • Vazba ATPázy;
Buněčná složka	• membrána; • jaderná matice; • Komplex NuA4 histon-acetyltransferáza; • nukleoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • MLL1 komplex; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • buněčné jádro; • Komplex SWR1; • Komplex R2TP; • cytoplazma; • cytosol; • Komplex Ino80;
Biologický proces	• DNA rekombinace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie; • acetylace histonu H2A; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Sestava nukleosomů obsahující CENP-A; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • buněčné dělení; • regulace autofagie mitochondrií; • spermatogeneze; • pozitivní regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • acetylace histonu H4; • buněčný cyklus; • regulace růstu; • komplexní sestava beta-katenin-TCF; • Odvíjení duplexu DNA; • kovalentní modifikace chromatinu; • deubikvitinace bílkovin; • Oprava DNA; • sestava snoRNP krabice C / D; • remodelace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8607
	56505
	ENSG00000175792; ENSG00000284901
	ENSMUSG00000030079
	Q9Y265
	P60122
	NM_003707; NM_001319084; NM_001319086
	NM_019685
	NP_001306013; NP_001306015; NP_003698
	NP_062659
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

RuvB-like 1 (E. coli), také známý jako RUVBL1 a TIP49 je člověk gen.^[5] RUVBL1 může tvořit hexamer. Hexamer může tvořit dodecamer s RUVBL2 protein.^[6]Má aktivitu jednořetězcové DNA stimulované ATPázy a ATP-dependentní DNA helikázy (3 'až 5'); hexamerizace je považována za rozhodující pro hydrolýzu ATP a sousední podjednotky v kruhové struktuře přispívají k aktivitě ATPázy.

Interakce

Bylo prokázáno, že RuvB-like 1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000284901 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175792, ENSG00000284901 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030079 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: RUVBL1 RuvB-like 1 (E. coli)“.
^ Puri T, Wendler P, Sigala B, Saibil H, Tsaneva IR (únor 2007). "Dodekamerická struktura a aktivita ATPázy lidského komplexu TIP48 / TIP49". J. Mol. Biol. 366 (1): 179–92. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.030. PMID 17157868.
^ ^A ^b Park J, Wood MA, Cole MD (březen 2002). „BAF53 tvoří odlišné jaderné komplexy a funguje jako kritický nukleární kofaktor interagující s C-Myc pro onkogenní transformaci“. Mol. Buňka. Biol. 22 (5): 1307–16. doi:10.1128 / mcb.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID 11839798.
^ Bauer A, Huber O, Kemler R (prosinec 1998). „Pontin52, interakční partner beta-kateninu, se váže na protein vázající TATA box“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (25): 14787–92. doi:10.1073 / pnas.95.25.14787. PMC 24527. PMID 9843967.
^ ^A ^b Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (srpen 2001). "Komplex p400 je základním cílem transformace E1A". Buňka. 106 (3): 297–307. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00450-0. PMID 11509179. S2CID 15634637.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Další čtení

Doyon Y, Côté J (2004). "Vysoce konzervativní a multifunkční komplex NuA4 HAT". Curr. Opin. Genet. Dev. 14 (2): 147–54. doi:10.1016 / j.gde.2004.02.009. PMID 15196461.
Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Kanemaki M, Makino Y, Yoshida T, Kishimoto T, Koga A, Yamamoto K, Yamamoto M, Moncollin V, Egly JM, Muramatsu M, Tamura T (1997). „Molekulární klonování krysího proteinu interagujícího s TBP 49 kDa (TIP49), který je vysoce homologní s bakteriálním RuvB“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235 (1): 64–8. doi:10.1006 / bbrc.1997.6729. PMID 9196036.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Makino Y, Mimori T, Koike C, Kanemaki M, Kurokawa Y, Inoue S, Kishimoto T, Tamura T (1998). „TIP49, homologní s bakteriální DNA helikázou RuvB, působí jako autoantigen u člověka“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 245 (3): 819–23. doi:10.1006 / bbrc.1998.8504. PMID 9588198.
Qiu XB, Lin YL, Thome KC, Pian P, Schlegel BP, Weremowicz S, Parvin JD, Dutta A (1998). „Eukaryotický protein podobný RuvB (RUVBL1) nezbytný pro růst“. J. Biol. Chem. 273 (43): 27786–93. doi:10.1074 / jbc.273.43.27786. PMID 9774387.
Holzmann K, Gerner C, Korosec T, Pöltl A, Grimm R, Sauermann G (1998). "Identifikace a charakterizace všudypřítomně se vyskytujícího proteinu jaderné matrice NMP 238". Biochem. Biophys. Res. Commun. 252 (1): 39–45. doi:10.1006 / bbrc.1998.9604. PMID 9813143.
Bauer A, Huber O, Kemler R (1999). „Pontin52, interakční partner beta-kateninu, se váže na protein vázající TATA box“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (25): 14787–92. doi:10.1073 / pnas.95.25.14787. PMC 24527. PMID 9843967.
Kanemaki M, Kurokawa Y, Matsu-ura T, Makino Y, Masani A, Okazaki K, Morishita T, Tamura TA (1999). „TIP49b, nová RuvB podobná DNA helikáza, je součástí komplexu spolu s další RuvB podobnou DNA helikázou, TIP49a“. J. Biol. Chem. 274 (32): 22437–44. doi:10.1074 / jbc.274.32.22437. PMID 10428817.
Salzer U, Kubíček M, Prohaska R (1999). „Izolace, molekulární charakterizace a tkáňově specifická exprese ECP-51 a ECP-54 (TIP49), dvou homologních, interagujících erytroidních cytosolických proteinů“. Biochim. Biophys. Acta. 1446 (3): 365–70. doi:10.1016 / S0167-4781 (99) 00104-9. PMID 10524211.
Wood MA, McMahon SB, Cole MD (2000). „Komplex ATPáza / helikáza je nezbytným kofaktorem pro onkogenní transformaci pomocí c-Myc.“ Mol. Buňka. 5 (2): 321–30. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80427-X. PMID 10882073.
Makino Y, Kanemaki M, Koga A, Osano K, Matsu-Ura T, Kurokawa Y, Kishimoto T, Tamura T (2000). "Chromozomové mapování a exprese lidských genů rodiny tip49". DNA sekv. 11 (1–2): 145–8. doi:10.3109/10425170009033982. PMID 10902922. S2CID 24646215.
Ikura T, Ogryzko VV, Grigoriev M, Groisman R, Wang J, Horikoshi M, Scully R, Qin J, Nakatani Y (2000). "Zapojení komplexu histonacetylázy TIP60 do opravy DNA a apoptózy". Buňka. 102 (4): 463–73. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00051-9. PMID 10966108. S2CID 18047169.
Hawley SB, Tamura T, Miles LA (2001). "Čištění, klonování a charakterizace proteinu vázajícího profibrinolytický plazminogen, TIP49a". J. Biol. Chem. 276 (1): 179–86. doi:10.1074 / jbc.M004919200. PMID 11027681.
Bauer A, Chauvet S, Huber O, Usseglio F, Rothbächer U, Aragnol D, Kemler R, Pradel J (2001). „Pontin52 a reptin52 fungují jako antagonistické regulátory signální aktivity beta-kateninu“. EMBO J.. 19 (22): 6121–30. doi:10.1093 / emboj / 19.22.6121. PMC 305835. PMID 11080158.
Park J, Wood MA, Cole MD (2002). „BAF53 tvoří odlišné jaderné komplexy a funguje jako kritický nukleární kofaktor interagující s C-Myc pro onkogenní transformaci“. Mol. Buňka. Biol. 22 (5): 1307–16. doi:10.1128 / MCB.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID 11839798.
Watkins NJ, Dickmanns A, Lührmann R (2003). „Konzervovaný kmen II motivu C / D boxu je nezbytný pro nukleolární lokalizaci a je vyžadován spolu s proteinem 15,5K pro hierarchické sestavení box C / D snoRNP“ (PDF). Mol. Buňka. Biol. 22 (23): 8342–52. doi:10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002. PMC 134055. PMID 12417735.
Cai Y, Jin J, Tomomori-Sato C, Sato S, Sorokina I, Parmely TJ, Conaway RC, Conaway JW (2003). "Identifikace nových podjednotek multproteinového savčího komplexu histon-acetyltransferázy obsahujícího TRRAP / TIP60". J. Biol. Chem. 278 (44): 42733–6. doi:10,1074 / jbc.C300389200. PMID 12963728.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000284901 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175792, ENSG00000284901 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030079 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: RUVBL1 RuvB-like 1 (E. coli)“.

[6] Puri T, Wendler P, Sigala B, Saibil H, Tsaneva IR (únor 2007). "Dodekamerická struktura a aktivita ATPázy lidského komplexu TIP48 / TIP49". J. Mol. Biol. 366 (1): 179–92. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.030. PMID 17157868.

[pmid11839798-7] A ^b Park J, Wood MA, Cole MD (březen 2002). „BAF53 tvoří odlišné jaderné komplexy a funguje jako kritický nukleární kofaktor interagující s C-Myc pro onkogenní transformaci“. Mol. Buňka. Biol. 22 (5): 1307–16. doi:10.1128 / mcb.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID 11839798.

[pmid9843967-8] Bauer A, Huber O, Kemler R (prosinec 1998). „Pontin52, interakční partner beta-kateninu, se váže na protein vázající TATA box“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (25): 14787–92. doi:10.1073 / pnas.95.25.14787. PMC 24527. PMID 9843967.

[pmid11509179-9] A ^b Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (srpen 2001). "Komplex p400 je základním cílem transformace E1A". Buňka. 106 (3): 297–307. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00450-0. PMID 11509179. S2CID 15634637.

[pmid17353931-10] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]