RUVBL2 - RUVBL2

RUVBL2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CQA, 2XSZ, 3UK6
Identifikátory
Aliasy	RUVBL2, ECP51, INO80J, REPTIN, RVB2, TIH2, TIP48, TIP49B, CGI-46, ECP-51, TAP54-beta, RuvB jako AAA ATPáza 2
Externí ID	OMIM: 604788 MGI: 1342299 HomoloGene: 4856 Genové karty: RUVBL2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	49,015,970 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	45,438,096 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba nukleotidů; • GO: 0043141 5'-3 'aktivita DNA helikázy; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • rozložená vazba na protein; • GO: 0004003 aktivita DNA helikázy; • Aktivita ATPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • vazba chromatinové DNA; • ATP vazba; • aktivita hydrolázy; • Vazba specifické pro sekvenci jádra promotoru RNA polymerázy II; • Vazba transkripčního faktoru třídy TFIID; • aktivita homodimerizace proteinu; • Vazba ADP; • Vazba ATPázy;
Buněčná složka	• nukleární euchromatin; • membrána; • jaderná matice; • Komplex NuA4 histon-acetyltransferáza; • intracelulární; • nukleoplazma; • MLL1 komplex; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • Komplex SWR1; • Komplex R2TP; • cytoplazma; • centrosome; • cytosol; • Komplex Ino80;
Biologický proces	• remodelace chromatinu; • DNA rekombinace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripční aktivace smyčkami promotor-enhancer; • buněčná odpověď na UV záření; • acetylace histonu H2A; • buněčná odpověď na estradiolový stimul; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace acetylace histonů; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • stanovení lokalizace proteinu na chromatinu; • skládání bílkovin; • pozitivní regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • acetylace histonu H4; • regulace růstu; • negativní regulace vazby na estrogenový receptor; • Oprava DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Odvíjení duplexu DNA; • kovalentní modifikace chromatinu; • sestava snoRNP krabice C / D;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10856
	20174
	ENSG00000183207
	ENSMUSG00000003868
	Q9Y230
	Q9WTM5
	NM_006666; NM_001321190; NM_001321191
	NM_011304
	NP_001308119; NP_001308120; NP_006657
	NP_035434
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

RuvB-like 2 (E. coli), také známý jako RUVBL2, je člověk gen kódující protein patřící do AAA + rodina proteinů.

Funkce

Tento gen kóduje druhý lidský homolog bakteriálního genu RuvB. Bakteriální RuvB protein je DNA helikáza nezbytná pro homologní rekombinaci a opravu dvouřetězcové DNA. Důkazy o tom, zda má RUVBL2 aktivitu DNA helikázy, si však odporují.^[5] Tento gen je fyzicky spojen s klastrem CGB / LHB genu na chromozomu 19q13.3 a je velmi blízký (55 nt) genu LHB v opačné orientaci.^[6]

Interakce

RUVBL2 bylo prokázáno komunikovat s RuvB-like 1^[7] a Aktivace transkripčního faktoru 2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183207 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003868 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puri T, Wendler P, Sigala B, Saibil H, Tsaneva IR (únor 2007). "Dodekamerická struktura a aktivita ATPázy lidského komplexu TIP48 / TIP49". Journal of Molecular Biology. 366 (1): 179–92. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.030. PMID 17157868.
^ „Entrez Gene: RUVBL2 RuvB-like 2 (E. coli)“.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární biologie systémů. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Cho SG, Bhoumik A, Broday L, Ivanov V, Rosenstein B, Ronai Z (prosinec 2001). „TIP49b, regulátor aktivace reakce transkripčního faktoru 2 na stres a poškození DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (24): 8398–413. doi:10.1128 / MCB.21.24.8398-8413.2001. PMC 100004. PMID 11713276.

Další čtení

Doyon Y, Côté J (duben 2004). "Vysoce konzervativní a multifunkční komplex NuA4 HAT". Aktuální názor na genetiku a vývoj. 14 (2): 147–54. doi:10.1016 / j.gde.2004.02.009. PMID 15196461.
Kanemaki M, Kurokawa Y, Matsu-ura T, Makino Y, Masani A, Okazaki K, Morishita T, Tamura TA (srpen 1999). „TIP49b, nová RuvB podobná DNA helikáza, je součástí komplexu spolu s další RuvB podobnou DNA helikázou, TIP49a“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (32): 22437–44. doi:10.1074 / jbc.274.32.22437. PMID 10428817.
Salzer U, Kubíček M, Prohaska R (září 1999). „Izolace, molekulární charakterizace a tkáňově specifická exprese ECP-51 a ECP-54 (TIP49), dvou homologních, interagujících erytroidních cytosolických proteinů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1446 (3): 365–70. doi:10.1016 / S0167-4781 (99) 00104-9. PMID 10524211.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (květen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Výzkum genomu. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Wood MA, McMahon SB, Cole MD (únor 2000). „Komplex ATPáza / helikáza je nezbytným kofaktorem pro onkogenní transformaci pomocí c-Myc.“ Molekulární buňka. 5 (2): 321–30. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80427-X. PMID 10882073.
Ikura T, Ogryzko VV, Grigoriev M, Groisman R, Wang J, Horikoshi M, Scully R, Qin J, Nakatani Y (srpen 2000). "Zapojení komplexu histonacetylázy TIP60 do opravy DNA a apoptózy". Buňka. 102 (4): 463–73. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00051-9. PMID 10966108. S2CID 18047169.
Parfait B, Giovangrandi Y, Asheuer M, Laurendeau I, Olivi M, Vodovar N, Vidaud D, Vidaud M, Bièche I (2000). „Lidský gen TIP49b / RUVBL2: genomová struktura, vzor exprese, fyzická vazba na klastr humánního CGB / LHB genu na chromozomu 19q13.3“. Annales de Génétique. 43 (2): 69–74. doi:10.1016 / S0003-3995 (00) 01016-9. PMID 10998447.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Bauer A, Chauvet S, Huber O, Usseglio F, Rothbächer U, Aragnol D, Kemler R, Pradel J (listopad 2000). „Pontin52 a reptin52 fungují jako antagonistické regulátory signální aktivity beta-kateninu“. Časopis EMBO. 19 (22): 6121–30. doi:10.1093 / emboj / 19.22.6121. PMC 305835. PMID 11080158.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Cho SG, Bhoumik A, Broday L, Ivanov V, Rosenstein B, Ronai Z (prosinec 2001). „TIP49b, regulátor aktivace reakce transkripčního faktoru 2 na stres a poškození DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (24): 8398–413. doi:10.1128 / MCB.21.24.8398-8413.2001. PMC 100004. PMID 11713276.
Park J, Wood MA, Cole MD (březen 2002). „BAF53 tvoří odlišné jaderné komplexy a funguje jako kritický nukleární kofaktor interagující s C-Myc pro onkogenní transformaci“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (5): 1307–16. doi:10.1128 / MCB.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID 11839798.
Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Watkins NJ, Dickmanns A, Lührmann R (prosinec 2002). „Konzervovaný kmen II motivu C / D boxu je nezbytný pro nukleolární lokalizaci a je vyžadován spolu s proteinem 15,5K pro hierarchické sestavení box C / D snoRNP“ (PDF). Molekulární a buněčná biologie. 22 (23): 8342–52. doi:10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002. PMC 134055. PMID 12417735.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). "Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů". Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Cai Y, Jin J, Tomomori-Sato C, Sato S, Sorokina I, Parmely TJ, Conaway RC, Conaway JW (říjen 2003). "Identifikace nových podjednotek multproteinového savčího komplexu histon-acetyltransferázy obsahujícího TRRAP / TIP60". The Journal of Biological Chemistry. 278 (44): 42733–6. doi:10,1074 / jbc.C300389200. PMID 12963728.
Gstaiger M, Luke B, Hess D, Oakeley EJ, Wirbelauer C, Blondel M, Vigneron M, Peter M, Krek W (listopad 2003). "Řízení transkripčních programů citlivých na živiny nekonvenčním prefoldinovým URI". Věda. 302 (5648): 1208–12. doi:10.1126 / science.1088401. PMID 14615539. S2CID 26836888.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183207 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003868 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Puri T, Wendler P, Sigala B, Saibil H, Tsaneva IR (únor 2007). "Dodekamerická struktura a aktivita ATPázy lidského komplexu TIP48 / TIP49". Journal of Molecular Biology. 366 (1): 179–92. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.030. PMID 17157868.

[entrez-6] „Entrez Gene: RUVBL2 RuvB-like 2 (E. coli)“.

[pmid17353931-7] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární biologie systémů. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid11713276-8] Cho SG, Bhoumik A, Broday L, Ivanov V, Rosenstein B, Ronai Z (prosinec 2001). „TIP49b, regulátor aktivace reakce transkripčního faktoru 2 na stres a poškození DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (24): 8398–413. doi:10.1128 / MCB.21.24.8398-8413.2001. PMC 100004. PMID 11713276.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]