Běhová doména - Runt domain - Wikipedia

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1 ekvA: 48-182 1 hjbC: 60-182 1 hjcD: 60-182 1io4C: 60-182 1eaoA: 48-182 1eanA: 48-182 1e50E: 50-182 1co1A: 61-175 1h9dC: 50-182 1ljmB: 51-181 1cmoA: 52-178

Běhová doména
Identifikátory
Symbol	Zakrslík
Pfam	PF00853
InterPro	IPR013524
SCOP2	1cmo / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1 ekvA: 48-182 1 hjbC: 60-182 1 hjcD: 60-182 1io4C: 60-182 1eaoA: 48-182 1eanA: 48-182 1e50E: 50-182 1co1A: 61-175 1h9dC: 50-182 1ljmB: 51-181 1cmoA: 52-178

The Běhová doména je evoluční konzervovaný proteinová doména.^[1]

The AML1 Gen RUNX1 je přeskupen translokací t (8; 21) u akutní myeloidní leukémie.^[2] Gen je velmi podobný Drosophila melanogaster segmentační genový gen a gen myšího transkripčního faktoru PEBP2 alfa.^[2] Oblast sdílené podobnosti, známá jako Runtova doména, je zodpovědná za vazbu DNA a interakci protein-protein.

Kromě vysoce konzervované domény Runt nese produkt genu AML-1 domnělé místo vázající ATP (GRSGRGKS) a má C-koncovou oblast bohatou na prolinové a serinové zbytky. Protein (známý jako protein akutní myeloidní leukémie 1, onkogen AML-1, faktor vazby na jádro (CBF), podjednotka alfa-B atd.) Se váže na jádro místa, 5'-pygpyggt-3 ', řady zesilovače a promotory.

Protein je heterodimer alfa- a beta-podjednotek. Alfa podjednotka váže DNA jako monomer a zdá se, že má roli ve vývoji normální hematopoézy. CBF je jaderný protein exprimovaný v mnoha typech tkání, kromě mozku a srdce; nejvyšší hladiny se vyskytují v brzlíku, kostní dřeni a periferní krvi.

Tato doména se vyskytuje na N-konci proteinů v této položce.

Příklady

Lidské geny kódující proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:

RUNX1, RUNX2, RUNX3

Reference

^ Kagoshima H, Shigesada K, Satake M, Ito Y, Miyoshi H, Ohki M, Pepling M, Gergen P (říjen 1993). "Runtova doména identifikuje novou rodinu heteromerních transkripčních regulátorů". Trendy Genet. 9 (10): 338–41. doi:10.1016 / 0168-9525 (93) 90026-E. PMID 8273148.
^ ^A ^b Hirai H, Shimizu K, Miyoshi H, Ohira M, Mitani K, Imai T, Yokoyama K, Soeda E, Ohki M (1995). „Alternativní sestřih a genomová struktura genu AML1 zapojeného do akutní myeloidní leukémie“. Nucleic Acids Res. 23 (14): 2762–2769. doi:10.1093 / nar / 23.14.2762. PMC 307102. PMID 7651838.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR013524

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid8273148-1] Kagoshima H, Shigesada K, Satake M, Ito Y, Miyoshi H, Ohki M, Pepling M, Gergen P (říjen 1993). "Runtova doména identifikuje novou rodinu heteromerních transkripčních regulátorů". Trendy Genet. 9 (10): 338–41. doi:10.1016 / 0168-9525 (93) 90026-E. PMID 8273148.

[PUB00004459-2] A ^b Hirai H, Shimizu K, Miyoshi H, Ohira M, Mitani K, Imai T, Yokoyama K, Soeda E, Ohki M (1995). „Alternativní sestřih a genomová struktura genu AML1 zapojeného do akutní myeloidní leukémie“. Nucleic Acids Res. 23 (14): 2762–2769. doi:10.1093 / nar / 23.14.2762. PMC 307102. PMID 7651838.

[1]

[2]