Rodina RhoBTB molekuly byl nevědomky objeven v roce 1993 analýzou genomu Dictyostelium a hledáním členů nadrodiny Ras GTPas. Autoři začali tím, že udělali Southern blot hledat cDNA které křížově hybridizují s velmi konzervativní sondou z hRas.[1] Identifikovali 19 nových geny který patřil k Ras nadčeleď a sekvenováno přibližně 600 nukleotidů od začátku přepisu.[1] Pokud by hledali normální GTPázu podobnou Ras, bylo by to dostačující. Jeden z jejich klonů, kterému říkali RacA, byl odlišnější než většina ostatních a přepis nekončil stop kodonem jako ostatní.[1] Autoři se k tomu však nevyjádřili a RhoBTB zůstal neobjeven dalších osm let.
K nalezení všech Rho GTPáz v Dictyosteliu následovala velmi pečlivá analýza, kterou provedl Francisco Rivero a spolupracovníci. Během svého úsilí zjistili, že otevřený čtecí rámec RacA byl ve skutečnosti o 400 aminokyselin delší než to, co Bush publikoval před 8 lety.[2] Místo proteinu o 168 aminokyselinách RacA kódoval protein o zbytku 598 s doménou Rho GTPázy na N-konci a dvěma doménami BTB směrem k C-konci. Je známo, že domény BTB (Broad-Complex, Tramtrack a Bric-a-Brac) zahrnují hetero a homo asociace s jinými proteiny obsahujícími doménu BTB.[3][4] Protože tento nový protein RhoBTB byl v Dictostelium, byli autoři zvědaví, zda u lidí existují homologní proteiny. Našli tři a zavolali jim RhoBTB1, RhoBTB2, a RhoBTB3.[2]
Lokalizace a výraz
RhoBTB1 a RhoBTB2 jsou mnohem homolognější než RhoBTB3.[2] Další analýza odhalila, že struktura intron-exon RhoBTB1 a 2 jsou také docela podobné a mají pouze jeden společný intron s RhoBTB3.[5]
RhoBTB1 a 2 nebyly během vývoje myší detekovány, ale RhoBTB3 byl detekován silně mezi embryonálními dny 11,5 až 17,5.[5] Navíc jsou RhoBTB1 a 2 lokalizovány do vezikulárních struktur,[6] zatímco RhoBTB3 je lokalizován do trans-Golgiho sítě.[7]
Reference
^ AbCBush J, Franek K, Cardelli J (prosinec 1993). „Klonování a charakterizace sedmi nových genů souvisejících s rasou Dictyostelium discoideum rac patřících do rho rodiny GTPas“. Gen. 136 (1–2): 61–8. doi:10.1016 / 0378-1119 (93) 90448-C. PMID8294042.
^ AbRamos S, Khademi F, Somesh BP, Rivero F (říjen 2002). "Genomická organizace a profil exprese malých GTPáz rodiny RhoBTB u lidí a myší". Gen. 298 (2): 147–57. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00980-0. PMID12426103.