Radioimunoprecipitační testovací pufr - Radioimmunoprecipitation assay buffer

Radioimunoprecipitační testovací pufr (RIPA buffer) je a lyzační pufr bývalo lyžovat buňky a tkáně pro rádio imunoprecipitace test (RIPA).[1][2] Tato vyrovnávací paměť je více denaturující než NP-40 nebo Triton X-100 protože obsahuje iontové detergenty SDS a deoxycholát sodný jako aktivní složky a je zvláště užitečný pro narušení jaderných membrán při přípravě jaderných extraktů. Vyrovnávací paměť RIPA poskytuje nízké pozadí, ale může denaturovat kinázy.

Recept

Recepty vyrovnávací paměti RIPA se mezi autory mírně liší a mohou zahrnovat:

  • 10-50 mM Tris -HCl (10 mM fosforečnan sodný místo toho lze použít), pH 7–8
  • 150 mM NaCl k udržení osmotického tlaku téměř fyziologického
  • neiontové detergenty (1% Triton X-100 nebo NP-40 ), aby se zabránilo nespecifickým interakcím mezi proteiny nebo se zkumavkou
  • aniontové prací prostředky (0,1-0,5% deoxycholát, 0.1-0.5% BL ). To je třeba optimalizovat pro každý test, čím vyšší je koncentrace, tím čistší je výsledek, ale tím nižší je signál.

Následující přísady jsou volitelné a jsou zahrnuty podle potřeby:

  • Proteáza inhibitory (1 mM PMSF (čerstvé z 1 M zásobního roztoku v i-propanolu), každý po 1 ug / ml leupeptin, aprotinin, pepstatin, 1-5 mM EDTA 0,5-1 mM EGTA, 5 mM kyselina aminokapronová ) nebo komerční koktejl s inhibitorem proteázy (použití podle pokynů výrobce)
  • 1 mM každý Na3VO4 a Na4P2Ó7 jako inhibitor fosfatázy (pokud je důležitý stav fosforylace)
  • 1 mM NaF jako konzervační prostředek (velmi toxický!)
  • 5-10 mM dithiothreitol (DTT) nebo β-merkaptoethanol jako antioxidant. DTT je dražší než βME, ale jeho redoxní potenciál je vhodnější pro vazbu Cys-Cys.

Reference

  1. ^ Alcaraz C, De Diego M, Pastor MJ, Escribano JM (červenec 1990). „Srovnání radioimunoprecipitačního testu s imunoblotováním a ELISA pro detekci protilátek proti viru afrického moru prasat“. J. Vet. Diagn. Investovat. 2 (3): 191–6. doi:10.1177/104063879000200307. PMID  2094444.
  2. ^ Ngoka LC (říjen 2008). „Příprava vzorků pro proteomiku rakoviny prsu: proteomika a genová ontologie odhalují dramatické rozdíly v preferencích solubilizace proteinů v testu radioimmunoprecipitace a pufrech pro lýzu močoviny“. Proteome Sci. 6 (1): 30. doi:10.1186/1477-5956-6-30. PMC  2600628. PMID  18950484.