RNF12 - RNF12

RLIM
Identifikátory
Aliasy	RLIM, NY-REN-43, RNF12, protein prstového prstu, interakce s doménou LIM, MRX61, TOKAS
Externí ID	OMIM: 300379 MGI: 1342291 HomoloGene: 7920 Genové karty: RLIM
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	74,614,624 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	103,981,284 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• transkripční represorový komplex; • buněčné jádro; • cytosol; • nukleoplazma;
Biologický proces	• negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • transkripce, chráněná DNA; • ubikvitinace bílkovin; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • polyubikvitinace bílkovin; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • negativní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • náhodná deaktivace chromozomu X; • regulace kompenzace dávky inaktivací X chromozomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51132
	19820
	ENSG00000131263
	ENSMUSG00000056537
	Q9NVW2
	Q9WTV7
	NM_183353; NM_016120
	NM_011276; NM_001358205
	NP_057204; NP_899196
	NP_035406; NP_001345134
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza RLIM je enzym že u lidí je kódován RLIM gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je protein RING-H2 se zinkovým prstem. Ukázalo se, že je to ubikvitinová proteinová ligáza, která cílí na vazbu domény LIM 1 (LDB1 / CLIM) a způsobuje proteazomově závislou degradaci LDB1. Tento protein a LDB1 jsou ko-represory LHX1 / LIM-1, transkripčního faktoru pro homeodoménu. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující stejný protein.^[6] Funkce u samic myší jako regulátor inaktivace chromozomu X.

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF12 komunikovat s Estrogenový receptor alfa.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131263 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056537 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (listopad 1999). „Antigeny rozpoznávané autologními protilátkami u pacientů s karcinomem ledvinových buněk“. Int. J. Cancer. 83 (4): 456–64. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID 10508479.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RNF12 protein prstového prstu 12".
^ Johnsen SA, Güngör C, Prenzel T, Riethdorf S, Riethdorf L, Taniguchi-Ishigaki N, Rau T, Tursun B, Furlow JD, Sauter G, Scheffner M, Pantel K, Gannon F, Bach I (leden 2009). "Regulace transkripce závislé na estrogenu pomocí LIM kofaktorů CLIM a RLIM u rakoviny prsu". Cancer Res. 69 (1): 128–36. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1630. PMC 2713826. PMID 19117995.

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Hiratani I, Yamamoto N, Mochizuki T, Ohmori SY, Taira M (2003). „Selektivní degradace přebytečného Ldb1 pomocí Rnf12 / RLIM poskytuje správné úrovně exprese Ldb1 a stechiometrii Xlim-1 / Ldb1 ve funkcích organizátoru Xenopus.“. Rozvoj. 130 (17): 4161–75. doi:10,1242 / dev.00621. PMID 12874135.
Ostendorff HP, Peirano RI, Peters MA, Schlüter A, Bossenz M, Scheffner M, Bach I (2002). "Výměna kofaktorů závislých na ubikvitinaci na transkripčních faktorech homeodomény LIM". Příroda. 416 (6876): 99–103. doi:10.1038 / 416099a. PMID 11882901.
Ostendorff HP, Bossenz M, Mincheva A, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Lichter P, Bach I (2000). "Funkční charakterizace genu kódujícího RLIM, jádrový represor faktorů homeodomény LIM". Genomika. 69 (1): 120–30. doi:10.1006 / geno.2000.6311. PMID 11013082.
Bach I, Rodriguez-Esteban C, Carrière C, Bhushan A, Krones A, Rose DW, Glass CK, Andersen B, Izpisúa Belmonte JC, Rosenfeld MG (1999). „RLIM inhibuje funkční aktivitu transkripčních faktorů LIM homeodomény prostřednictvím náboru komplexu histon-deacetylázy“. Nat. Genet. 22 (4): 394–9. doi:10.1038/11970. PMID 10431247.
Shin J, Bossenz M, Chung Y, Ma H, Byron M, Taniguchi-Ishigaki N, Zhu X, Jiao B, Hall LL, Green MR, Jones SN, Hermans-Borgmeyer I, Lawrence JB, Bach I (2010). „Mateřská Rnf12 / RLIM je nutná pro inaktivaci potištěných X-chromozomů u myší“. Příroda. 467 (7318): 977–81. doi:10.1038 / nature09457. PMC 2967734. PMID 20962847.
Jiao B, Taniguchi-Ishigaki N, Güngör C, Peters MA, Chen YW, Riethdorf S, Drung A, Ahronian LG, Shin J, Pagnis R, Pantel K, Tachibana T, Lewis BC, Johnsen SA, Bach I (2013). "Funkční aktivita RLIM / Rnf12 je regulována fosforylačně závislým nukleocytoplazmatickým pendlováním". Mol Biol Cell. 24 (19): 3085–96. doi:10,1091 / mbc.E13-05-0239. PMC 3784382. PMID 23904271.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131263 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056537 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10508479-5] Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (listopad 1999). „Antigeny rozpoznávané autologními protilátkami u pacientů s karcinomem ledvinových buněk“. Int. J. Cancer. 83 (4): 456–64. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID 10508479.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: RNF12 protein prstového prstu 12".

[pmid19117995-7] Johnsen SA, Güngör C, Prenzel T, Riethdorf S, Riethdorf L, Taniguchi-Ishigaki N, Rau T, Tursun B, Furlow JD, Sauter G, Scheffner M, Pantel K, Gannon F, Bach I (leden 2009). "Regulace transkripce závislé na estrogenu pomocí LIM kofaktorů CLIM a RLIM u rakoviny prsu". Cancer Res. 69 (1): 128–36. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1630. PMC 2713826. PMID 19117995.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]