RBM8A - RBM8A
Protein vázající RNA 8A je protein že u lidí je kódován RBM8A gen.[5][6]
Tento gen kóduje protein se zachovaným motivem vázajícím RNA. Protein se nachází převážně v jádru, i když je také přítomen v cytoplazmě. Je přednostně spojena s mRNA produkovanými sestřihem, včetně jaderných mRNA a nově exportovaných cytoplazmatických mRNA. Předpokládá se, že protein zůstává asociován se sestřiženými mRNA jako značka, která indikuje, kde byly přítomny introny, a tak spojuje události sestřihu před a po mRNA. Dříve se předpokládalo, že tento gen kódují dva geny, RBM8A a RBM8B; nyní se předpokládá, že lokus RBM8B je pseudogen. Dva alternativní startovací kodony vedou ke dvěma formám proteinu a tento gen také používá více polyadenylačních míst.[7]
Interakce
RBM8A bylo prokázáno komunikovat s IPO13,[8] MAGOH[9][10] a UPF3A.[11]
Související problémy s geny
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000265241 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038374 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Conklin DC, Rixon MW, Kuestner RE, Maurer MF, Whitmore TE, Millar RP (říjen 2000). "Klonování a genová exprese nového lidského ribonukleoproteinu". Biochim Biophys Acta. 1492 (2–3): 465–9. doi:10.1016 / s0167-4781 (00) 00090-7. PMID 11004516.
- ^ Salicioni AM, Xi M, Vanderveer LA, Balsara B, Testa JR, Dunbrack RL Jr, Godwin AK (říjen 2000). „Identifikace a strukturní analýza lidských RBM8A a RBM8B: dva vysoce konzervované proteiny vázající RNA, které interagují s OVCA1, kandidátským supresorem nádoru“. Genomika. 69 (1): 54–62. doi:10,1006 / geno.2000.6315. PMID 11013075.
- ^ "Entrez gen: RBM8A RNA vazebný motivový protein 8A".
- ^ Mingot, J. M.; Kostka S; Kraft R; Hartmann E; Görlich D (červenec 2001). „Importin 13: nový zprostředkovatel jaderného dovozu a vývozu“. EMBO J.. Anglie. 20 (14): 3685–94. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3685. ISSN 0261-4189. PMC 125545. PMID 11447110.
- ^ Zhao, XF; Nowak N J; Ukazuje T B; Aplan P D (leden 2000). „MAGOH interaguje s novým proteinem vázajícím RNA“. Genomika. SPOJENÉ STÁTY. 63 (1): 145–8. doi:10.1006 / geno.1999,6064. ISSN 0888-7543. PMID 10662555.
- ^ Kataoka, N; Diem M D; Kim VN; Yong J; Dreyfuss G (listopad 2001). „Magoh, lidský homolog proteinu Drosophila mago nashi, je součástí spojovacího komplexu exon – exon závislého na sestřihu“. EMBO J.. Anglie. 20 (22): 6424–33. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6424. ISSN 0261-4189. PMC 125744. PMID 11707413.
- ^ Kim, VN; Kataoka N; Dreyfuss G (září 2001). "Role nesmyslem zprostředkovaného faktoru rozpadu hUpf3 v sestupně závislém komplexu spojení exon-exon". Věda. Spojené státy. 293 (5536): 1832–6. Bibcode:2001Sci ... 293.1832K. doi:10.1126 / science.1062829. ISSN 0036-8075. PMID 11546873.
- ^ Klopocki E, Schulze H, Strauss G a kol. (Únor 2007). „Složitý vzor dědičnosti připomínající autozomálně recesivní dědičnost zahrnující mikrodeleci u trombocytopenie - syndrom nepřítomného poloměru“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 80 (2): 232–40. doi:10.1086/510919. PMC 1785342. PMID 17236129.
Další čtení
- Wilson KF, Fortes P, Singh USA a kol. (1999). „Komplex vázající nukleární čepici je novým cílem transdukce signálu spojeného s receptorem růstového faktoru“. J. Biol. Chem. 274 (7): 4166–73. doi:10.1074 / jbc.274.7.4166. PMID 9933612.
- Zhao XF, Nowak NJ, ukazuje TB, Aplan PD (2000). „MAGOH interaguje s novým proteinem vázajícím RNA“. Genomika. 63 (1): 145–8. doi:10.1006 / geno.1999,6064. PMID 10662555.
- Kataoka N, Yong J, Kim VN a kol. (2000). „Sestřih pre-mRNA otiskne mRNA v jádru s novým proteinem vázajícím RNA, který přetrvává v cytoplazmě.“ Mol. Buňka. 6 (3): 673–82. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00065-4. PMID 11030346.
- Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
- Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2001). „Spliceosom ukládá více proteinů 20–24 nukleotidů před mRNA spojení exon – exon“. EMBO J.. 19 (24): 6860–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
- Mingot JM, Kostka S, Kraft R a kol. (2001). „Importin 13: nový zprostředkovatel jaderného dovozu a vývozu“. EMBO J.. 20 (14): 3685–94. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3685. PMC 125545. PMID 11447110.
- Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (2001). "Role nesmyslem zprostředkovaného faktoru rozpadu hUpf3 v sestupně závislém komplexu spojení exon-exon". Věda. 293 (5536): 1832–6. Bibcode:2001Sci ... 293.1832K. doi:10.1126 / science.1062829. PMID 11546873.
- Lykke-Andersen J, MD Shu, Steitz JA (2001). "Sdělení polohy spojení exon-exon do sledovacího zařízení mRNA proteinem RNPS1". Věda. 293 (5536): 1836–9. Bibcode:2001Sci ... 293.1836L. doi:10.1126 / science.1062786. PMID 11546874.
- Hachet O, Ephrussi A (2002). „Drosophila Y14 kyvadlová doprava k zadní části oocytu a je nutná pro transport mRNA oskar“. Curr. Biol. 11 (21): 1666–74. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00508-5. PMID 11696323.
- Faurholm B, Millar RP, Katz AA (2002). „Geny kódující receptor hormonu uvolňujícího gonadotropin typu II a ribonukleoprotein RBM8A se u lidí překrývají ve dvou genomových lokusech.“ Genomika. 78 (1–2): 15–8. doi:10.1006 / geno.2001.6650. PMID 11707068.
- Kataoka N, Diem MD, Kim VN a kol. (2002). „Magoh, lidský homolog proteinu Drosophila mago nashi, je součástí spojovacího komplexu exon – exon závislého na sestřihu“. EMBO J.. 20 (22): 6424–33. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6424. PMC 125744. PMID 11707413.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Okubo K, Mitani H, Naruse K a kol. (2002). "Zachovaná fyzická vazba GnRH-R a RBM8 v medaku a lidských genomech". Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 327–31. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00161-4. PMID 12054603.
- Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). „Komplex exonového spojení je detekován na mRNA vázané na CBP80, ale ne na eIF4E v savčích buňkách: dynamika remodelace mRNP“. EMBO J.. 21 (13): 3536–45. doi:10.1093 / emboj / cdf345. PMC 126094. PMID 12093754.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Gehring NH, Neu-Yilik G, Schell T a kol. (2003). "Y14 a hUpf3b tvoří komplex aktivující NMD". Mol. Buňka. 11 (4): 939–49. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00142-4. PMID 12718880.
- Fribourg S, Gatfield D, Izaurralde E, Conti E (2003). „Nový způsob rozpoznávání RBD-proteinu v komplexu Y14-Mago“. Nat. Struct. Biol. 10 (6): 433–9. doi:10.1038 / nsb926. PMID 12730685.
- Lau CK, MD Diem, Dreyfuss G, Van Duyne GD (2004). "Struktura jádra Y14-Magoh komplexu exonového spojení". Curr. Biol. 13 (11): 933–41. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00328-2. PMID 12781131.
Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |