RBM14 - RBM14 - Wikipedia

RBM14
Protein RBM14 PDB 2dnp.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRBM14COAA, PSP2, SIP, SYTIP1, TMEM137, protein vázající motiv RNA
Externí IDOMIM: 612409 MGI: 1929092 HomoloGene: 4614 Genové karty: RBM14
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro RBM14
Genomické umístění pro RBM14
Kapela11q13.2Start66,616,582 bp[1]
Konec66,627,347 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RBM14 204178 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_032886
NM_001198836
NM_001198837
NM_006328

NM_019869

RefSeq (protein)

NP_001185765
NP_001185766
NP_006319

NP_063922

Místo (UCSC)Chr 11: 66,62 - 66,63 MbChr 19: 4,8 - 4,81 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein vázající RNA 14 je protein že u lidí je kódován RBM14 gen.[5][6]

Interakce

RBM14 bylo prokázáno komunikovat s TARBP2.[7]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce RBM14. Podmíněný knockout myš linka volala Rbm14tm1a (KOMP) Wtsi byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[8] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[9] k určení účinků vypuštění.[10][11][12][13] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[14]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000239306 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006456 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Brett D, Whitehouse S, Antonson P, Shipley J, Cooper C, Goodwin G (září 1997). „SYT protein zapojený do translokace synoviálního sarkomu t (X; 18) je transkripční aktivátor lokalizovaný v jaderných tělech“. Lidská molekulární genetika. 6 (9): 1559–64. doi:10,1093 / hmg / 6.9.1559. PMID  9285794.
  6. ^ "Entrez gen: RBM14 RNA vázající motivový protein 14".
  7. ^ Iwasaki T, Chin WW, Ko L (září 2001). „Identifikace a charakterizace aktivátoru koaktivátoru obsahujícího RRM (CoAA) jako proteinu interagujícího s TRBP a jeho sestřihové varianty jako modulátoru koaktivátoru (CoAM)“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (36): 33375–83. doi:10,1074 / jbc.M101517200. PMID  11443112.
  8. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
  10. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  11. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  12. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  13. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  14. ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.

Další čtení