RACGAP1 - RACGAP1 - Wikipedia

RACGAP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2OVJ, 3W6R, 3WPQ, 3 WPS, 4B6D, 5C2J, 5C2K
Identifikátory
Aliasy	RACGAP1, CYK4, HsCYK-4, ID-GAP, MgcRacGAP, protein aktivující Rac GTPázu 1
Externí ID	OMIM: 604980 MGI: 1349423 HomoloGene: 8077 Genové karty: RACGAP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	50,033,136 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	99,651,656 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba mikrotubulů; • vazba alfa-tubulinu; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu; • vazba gama-tubulinu; • vazba protein kinázy; • vazba fosfatidylinositol-3,4,5-trisfosfátu; • vazba lipidů; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • komplex centralspindlin; • membrána; • vnější složka cytoplazmatické strany plazmatické membrány; • buněčná membrána; • vřeteno; • nukleoplazma; • Akrozom; • vřetenová střední zóna; • dělící rýha; • mitotické vřeteno; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • buněčné jádro; • cytoplazmatický váček; • střední část těla; • Flemmingovo tělo;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • sestava středních zón mitotického vřetena; • transport síranů; • mitotická cytokineze; • iontový transport; • buněčné dělení; • pozitivní regulace cytokineze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pohyb založený na mikrotubulích; • sestava kontraktilního prstence aktomyosinu; • spermatogeneze; • proliferace neuroblastů; • buněčný cyklus; • regulace připojení mikrotubulů vřetena ke kinetochoru; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • signální transdukce; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • regulace embryonálního vývoje; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29127
	26934
	ENSG00000161800
	ENSMUSG00000023015
	Q9H0H5
	Q9WVM1
NM_001126103; NM_001126104; NM_013277; NM_001319999; NM_001320000;
	NM_001320001; NM_001320002; NM_001320003; NM_001320004; NM_001320005; NM_001320006; NM_001320007
	NM_001253808; NM_001253809; NM_012025
NP_001119575; NP_001119576; NP_001306928; NP_001306929; NP_001306930;
	NP_001306931; NP_001306932; NP_001306933; NP_001306934; NP_001306935; NP_001306936; NP_037409
	NP_001240737; NP_001240738; NP_036155
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein aktivující Rac GTPázu 1 je enzym že u lidí je kódován RACGAP1 gen.^[5]

Funkce

Rho GTPasy řídí celou řadu buněčných procesů. V nadrodině Ras malých G proteinů jsou 3 podtypy Rho GTPáz: RHO (viz MIM 165370), RAC (viz RAC1; MIM 602048) a CDC42 (MIM 116952). Proteiny aktivující GTPázu (GAP) vážou aktivované formy Rho GTPáz a stimulují hydrolýzu GTP. Prostřednictvím této katalytické funkce Rho GAP negativně regulují signály zprostředkované Rho. GAP mohou také sloužit jako efektorové molekuly a hrát roli v signalizaci po proudu od Rho a jiných GTPáz podobných Ras. [Dodáváno OMIM]^[6]

Interakce

RACGAP1 bylo prokázáno komunikovat s Rnd2^[7] a SLC26A8.^[8]

Během cytokineze bylo prokázáno, že s RACGAP1 interaguje KIF23 tvořit centralspindlin komplex.^[9] Tento komplex je nezbytný pro vytvoření centrálního vřetena. RACGAP1 také interaguje s PRC1 stabilizovat a udržovat centrální vřeteno, jak postupuje anafáze.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161800 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023015 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Touré A, Dorseuil O, Morin L, Timmons P, Jégou B, Reibel L, Gacon G (březen 1998). „MgcRacGAP, nový lidský protein aktivující GTPázu pro Rac a Cdc42 podobný produktu genu Drosophila rotundRacGAP, je exprimován v mužských zárodečných buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (11): 6019–23. doi:10.1074 / jbc.273.11.6019. PMID 9497316.
^ "Entrez Gene: RACGAP1 Rac GTPáza aktivující protein 1".
^ Naud N, Touré A, Liu J, Pineau C, Morin L, Dorseuil O, Escalier D, Chardin P, Gacon G (květen 2003). „Rodina Rho GTPáza Rnd2 interaguje a lokalizuje se s MgcRacGAP v mužských zárodečných buňkách“. The Biochemical Journal. 372 (Pt 1): 105–12. doi:10.1042 / BJ20021652. PMC 1223378. PMID 12590651.
^ Toure A, Morin L, Pineau C, Becq F, Dorseuil O, Gacon G (červen 2001). „Tat1, nový sulfátový transportér specificky exprimovaný v lidských mužských zárodečných buňkách a potenciálně spojený s rhogtpázovou signalizací“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (23): 20309–15. doi:10,1074 / jbc.M011740200. PMID 11278976.
^ Glotzer M (únor 2013). „Cytokineze: měsíční svit centrální membrány jako membránová kotva“. Aktuální biologie. 23 (4): R145–7. doi:10.1016 / j.cub.2013.01.006. PMID 23428321.
^ Lee KY, Esmaeili B, Zealley B, Mishima M (2015). „Přímá interakce mezi centralspindlinem a PRC1 posiluje mechanickou odolnost centrálního vřetena“. Příroda komunikace. 6: 7290. doi:10.1038 / ncomms8290. PMC 4557309. PMID 26088160.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Gerwins P, Blank JL, Johnson GL (březen 1997). „Klonování nové mitogenem aktivované protein kinázy kinázy kinázy, MEKK4, která selektivně reguluje dráhu aminoterminální kinázy c-Jun“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (13): 8288–95. doi:10.1074 / jbc.272.13.8288. PMID 9079650.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Nagata Ki, Puls A, Futter C, Aspenstrom P, Schaefer E, Nakata T, Hirokawa N, hala A (leden 1998). „MAP kináza kináza kináza MLK2 se společně lokalizuje s aktivovaným JNK podél mikrotubulů a asociuje s motorem KIF3 nadrodiny kinesinu“. Časopis EMBO. 17 (1): 149–58. doi:10.1093 / emboj / 17.1.149. PMC 1170366. PMID 9427749.
Tapon N, Nagata K, Lamarche N, hala A (březen 1998). „Nový racový cíl POSH je protein lešení obsahující SH3 zapojený do signálních drah JNK a NF-kappaB“. Časopis EMBO. 17 (5): 1395–404. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1395. PMC 1170487. PMID 9482736.
Abo A, Qu J, Cammarano MS, Dan C, Fritsch A, Baud V, Belisle B, Minden A (listopad 1998). „PAK4, nový efektor pro Cdc42Hs, se podílí na reorganizaci aktinového cytoskeletu a na tvorbě filopodií“. Časopis EMBO. 17 (22): 6527–40. doi:10.1093 / emboj / 17.22.6527. PMC 1171000. PMID 9822598.
Zuber J, Tchernitsa OI, Hinzmann B, Schmitz AC, Grips M, Hellriegel M, Sers C, Rosenthal A, Schäfer R (únor 2000). "Celogenomový průzkum cílů transformace RAS". Genetika přírody. 24 (2): 144–52. doi:10.1038/72799. PMID 10655059. S2CID 21887748.
Das B, Shu X, Day GJ, Han J, Krishna UM, Falck JR, Broek D (květen 2000). „Kontrola intramolekulárních interakcí mezi pleckstrinovou homologií a Dbl homologickými doménami Vav a Sos1 reguluje vazbu Rac“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 15074–81. doi:10,1074 / jbc.M907269199. PMID 10748082.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa K, Hirosawa M, Ohara O (duben 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (2): 143–50. doi:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID 10819331.
Kawashima T, Hirose K, Satoh T, Kaneko A, Ikeda Y, Kaziro Y, Nosaka T, Kitamura T (září 2000). „MgcRacGAP se podílí na řízení růstu a diferenciace hematopoetických buněk“. Krev. 96 (6): 2116–24. doi:10.1182 / krev. V96.6.2116. PMID 10979956.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Hirose K, Kawashima T, Iwamoto I, Nosaka T, Kitamura T (únor 2001). „MgcRacGAP se podílí na cytokinezi spojením s mitotickým vřetenem a středním tělem“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (8): 5821–8. doi:10,1074 / jbc.M007252200. PMID 11085985.
Caloca MJ, Wang H, Delemos A, Wang S, Kazanietz MG (květen 2001). „Forbolové estery a příbuzné analogy regulují subcelulární lokalizaci beta 2-chimaerinu, nefrolesterového receptoru neproteinové kinázy C“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (21): 18303–12. doi:10,1074 / jbc.M011368200. PMID 11278894.
Toure A, Morin L, Pineau C, Becq F, Dorseuil O, Gacon G (červen 2001). „Tat1, nový sulfátový transportér specificky exprimovaný v lidských mužských zárodečných buňkách a potenciálně spojený s rhogtpázovou signalizací“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (23): 20309–15. doi:10,1074 / jbc.M011740200. PMID 11278976.
Mishima M, Kaitna S, Glotzer M (leden 2002). „Sestava centrálního vřetena a cytokineze vyžadují komplex podobný kinesinu s proteinem / RhoGAP s aktivitou svazování mikrotubulů“. Vývojová buňka. 2 (1): 41–54. doi:10.1016 / S1534-5807 (01) 00110-1. PMID 11782313.
Vikis HG, Li W, Guan KL (duben 2002). „Interakce plexin-B1 / Rac inhibuje aktivaci PAK a zvyšuje vazbu ligandu Sema4D“. Geny a vývoj. 16 (7): 836–45. doi:10,1101 / gad.966402. PMC 186329. PMID 11937491.
Kitamura T, Kawashima T, Minoshima Y, Tonozuka Y, Hirose K, Nosaka T (prosinec 2001). „Role MgcRacGAP / Cyk4 jako regulátoru malé rodiny GTPase Rho v cytokinéze a buněčné diferenciaci“. Struktura a funkce buněk. 26 (6): 645–51. doi:10.1247 / csf.26.645. PMID 11942621.
Côté JF, Vuori K (prosinec 2002). „Identifikace evolučně konzervované nadrodiny proteinů souvisejících s DOCK180 s aktivitou výměny guaninových nukleotidů“. Journal of Cell Science. 115 (Pt 24): 4901–13. doi:10.1242 / jcs.00219. PMID 12432077.
Jantsch-Plunger V, Gönczy P, Romano A, Schnabel H, Hamill D, Schnabel R, Hyman AA, Glotzer M (červen 2000). "CYK-4: Rho rodina aktivující protein proteázy (GAP) potřebný pro tvorbu centrální vřetena a cytokinézu". The Journal of Cell Biology. 149 (7): 1391–404. doi:10.1083 / jcb.149.7.1391. PMC 2175131. PMID 10871280.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161800 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023015 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9497316-5] Touré A, Dorseuil O, Morin L, Timmons P, Jégou B, Reibel L, Gacon G (březen 1998). „MgcRacGAP, nový lidský protein aktivující GTPázu pro Rac a Cdc42 podobný produktu genu Drosophila rotundRacGAP, je exprimován v mužských zárodečných buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (11): 6019–23. doi:10.1074 / jbc.273.11.6019. PMID 9497316.

[entrez-6] "Entrez Gene: RACGAP1 Rac GTPáza aktivující protein 1".

[pmid12590651-7] Naud N, Touré A, Liu J, Pineau C, Morin L, Dorseuil O, Escalier D, Chardin P, Gacon G (květen 2003). „Rodina Rho GTPáza Rnd2 interaguje a lokalizuje se s MgcRacGAP v mužských zárodečných buňkách“. The Biochemical Journal. 372 (Pt 1): 105–12. doi:10.1042 / BJ20021652. PMC 1223378. PMID 12590651.

[pmid11278976-8] Toure A, Morin L, Pineau C, Becq F, Dorseuil O, Gacon G (červen 2001). „Tat1, nový sulfátový transportér specificky exprimovaný v lidských mužských zárodečných buňkách a potenciálně spojený s rhogtpázovou signalizací“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (23): 20309–15. doi:10,1074 / jbc.M011740200. PMID 11278976.

[cytokinesis-9] Glotzer M (únor 2013). „Cytokineze: měsíční svit centrální membrány jako membránová kotva“. Aktuální biologie. 23 (4): R145–7. doi:10.1016 / j.cub.2013.01.006. PMID 23428321.

[10] Lee KY, Esmaeili B, Zealley B, Mishima M (2015). „Přímá interakce mezi centralspindlinem a PRC1 posiluje mechanickou odolnost centrálního vřetena“. Příroda komunikace. 6: 7290. doi:10.1038 / ncomms8290. PMC 4557309. PMID 26088160.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]