RAB18 - RAB18

RAB18
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X3S
Identifikátory
Aliasy	RAB18, RAB18LI1, WARBM3, člen onkogenní rodiny RAS
Externí ID	OMIM: 602207 MGI: 102790 HomoloGene: 40765 Genové karty: RAB18
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	27,542,237 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na HDP; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• intracelulární; • membrána; • tubulární síť endoplazmatického retikula; • cytosol; • membrána endoplazmatického retikula; • buněčná membrána; • sekreční granulovaná membrána; • Golgiho aparát; • synapse;
Biologický proces	• vývoj očí; • transport bílkovin; • vývoj mnohobuněčných organismů; • organizace tubulární sítě endoplazmatického retikula; • vývoj mozku; • organizace lipidových částic; • degranulace neutrofilů; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • jaderný dovoz; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	22931
	19330
	ENSG00000099246
	ENSMUSG00000073639
	Q9NP72
	P35293
	NM_001256410; NM_001256411; NM_001256412; NM_001256415; NM_021252
	NM_001278447; NM_181070
	NP_001243339; NP_001243340; NP_001243341; NP_001243344; NP_067075
	NP_001265376; NP_851415
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-18 je protein že u lidí je kódován RAB18 gen.^[4]^[5]

Rab18 je všudypřítomně exprimovaný protein se zvláště vysokou expresí v mozek.^[6] Rab18 byl nejprve charakterizován jako endozomální protein v epiteliální buňky myší ledviny a střeva.^[6] Následující studie odhalily, že Rab18 má širokou intracelulární distribuci; lokalizace do golgiho komplex, endoplazmatické retikulum, lipidové kapičky a cytosol různých typů buněk.^[7]^[8]^[9] V mozku byl Rab18 izolován ve spojení s synaptické vezikuly^[10]^[11] a bylo pozorováno, že se lokalizuje do sekrečních granulí v neuroendokrinních buňkách.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099246 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schafer U, Seibold S, Schneider A, Neugebauer E (únor 2000). "Izolace a charakterizace lidského genu rab18 po stimulaci endoteliálních buněk histaminem". FEBS Lett. 466 (1): 148–54. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01778-0. PMID 10648831. S2CID 31093183.
^ „Entrez Gene: RAB18 RAB18, člen onkogenní rodiny RAS“.
^ ^A ^b Lütcke A, Parton RG, Murphy C, Olkkonen VM, Dupree P, Valencia A, Simons K, Zerial M (prosinec 1994). „Klonování a subcelulární lokalizace nových rab proteinů odhaluje polarizovanou a buněčně specifickou expresi“. J. Cell Sci. 107 (12): 3437–48. PMID 7706395.
^ Dejgaard SY, Murshid A, Erman A, Kizilay O, Verbich D, Lodge R, Dejgaard K, Ly-Hartig TB, Pepperkok R, Simpson JC, Presley JF (srpen 2008). „Rab18 a Rab43 mají klíčové role v obchodování s ER-Golgi“. J. Cell Sci. 121 (Pt 16): 2768–81. doi:10.1242 / jcs.021808. PMID 18664496.
^ Martin S, Driessen K, Nixon SJ, Zerial M, Parton RG (prosinec 2005). "Regulovaná lokalizace Rab18 na lipidové kapičky: účinky lipolytické stimulace a inhibice katabolismu lipidových kapiček" (PDF). J. Biol. Chem. 280 (51): 42325–35. doi:10,1074 / jbc.M506651200. PMID 16207721. S2CID 30398568.
^ Ozeki S, Cheng J, Tauchi-Sato K, Hatano N, Taniguchi H, Fujimoto T (červen 2005). „Rab18 se lokalizuje na lipidové kapičky a indukuje jejich těsnou apozici na membránu odvozenou od endoplazmatického retikula“. J. Cell Sci. 118 (Pt 12): 2601–11. doi:10.1242 / jcs.02401. PMID 15914536.
^ Burré J, Beckhaus T, Corvey C, Karas M, Zimmermann H, Volknandt W (září 2006). „Proteiny synaptických vezikul za podmínek klidu a aktivace: analýza pomocí 2-D rozdílové gelové elektroforézy“. Elektroforéza. 27 (17): 3488–96. doi:10,1002 / elps.200500864. PMID 16944461. S2CID 43618245.
^ Takamori S, Holt M, Stenius K, Lemke EA, Grønborg M, Riedel D, Urlaub H, Schenck S, Brügger B, Ringler P, Müller SA, Rammner B, Gräter F, Hub JS, De Groot BL, Mieskes G, Moriyama Y, Klingauf J, Grubmüller H, Heuser J, Wieland F, Jahn R (listopad 2006). „Molekulární anatomie obchodující organely“. Buňka. 127 (4): 831–46. doi:10.1016 / j.cell.2006.10.030. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E357-D. PMID 17110340. S2CID 6703431.
^ Vazquez-Martinez R, Cruz-Garcia D, Duran-Prado M, Peinado JR, Castaño JP, Malagon MM (červenec 2007). „Rab18 inhibuje sekreční aktivitu v neuroendokrinních buňkách interakcí se sekrečními granulemi“. Provoz. 8 (7): 867–82. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00570.x. PMID 17488286. S2CID 9987968.

Další čtení

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD a kol. (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Hillier LD, Lennon G, Becker M a kol. (1997). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hu RM, Han ZG, Song HD a kol. (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Behrends U, Schneider I, Rössler S, et al. (2003). „Nové nádorové antigeny identifikované autologním screeningem protilátek v knihovnách cDNA dětského medulloblastomu“. Int. J. Cancer. 106 (2): 244–51. doi:10.1002 / ijc.11208. PMID 12800201. S2CID 36836051.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 10“. Příroda. 429 (6990): 375–81. doi:10.1038 / nature02462. PMID 15164054.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Dou T, Ji C, Gu S a kol. (2006). "Klonování a charakterizace nové sestřihové varianty lidského genu Rab18 (RAB18)". DNA sekv. 16 (3): 230–4. doi:10.1080/10425170500061681. PMID 16147880. S2CID 45143893.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099246 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10648831-4] Schafer U, Seibold S, Schneider A, Neugebauer E (únor 2000). "Izolace a charakterizace lidského genu rab18 po stimulaci endoteliálních buněk histaminem". FEBS Lett. 466 (1): 148–54. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01778-0. PMID 10648831. S2CID 31093183.

[entrez-5] „Entrez Gene: RAB18 RAB18, člen onkogenní rodiny RAS“.

[Lütcke_1994-6] A ^b Lütcke A, Parton RG, Murphy C, Olkkonen VM, Dupree P, Valencia A, Simons K, Zerial M (prosinec 1994). „Klonování a subcelulární lokalizace nových rab proteinů odhaluje polarizovanou a buněčně specifickou expresi“. J. Cell Sci. 107 (12): 3437–48. PMID 7706395.

[Dejgaard_2008-7] Dejgaard SY, Murshid A, Erman A, Kizilay O, Verbich D, Lodge R, Dejgaard K, Ly-Hartig TB, Pepperkok R, Simpson JC, Presley JF (srpen 2008). „Rab18 a Rab43 mají klíčové role v obchodování s ER-Golgi“. J. Cell Sci. 121 (Pt 16): 2768–81. doi:10.1242 / jcs.021808. PMID 18664496.

[Martin_2005-8] Martin S, Driessen K, Nixon SJ, Zerial M, Parton RG (prosinec 2005). "Regulovaná lokalizace Rab18 na lipidové kapičky: účinky lipolytické stimulace a inhibice katabolismu lipidových kapiček" (PDF). J. Biol. Chem. 280 (51): 42325–35. doi:10,1074 / jbc.M506651200. PMID 16207721. S2CID 30398568.

[Ozeki_2005-9] Ozeki S, Cheng J, Tauchi-Sato K, Hatano N, Taniguchi H, Fujimoto T (červen 2005). „Rab18 se lokalizuje na lipidové kapičky a indukuje jejich těsnou apozici na membránu odvozenou od endoplazmatického retikula“. J. Cell Sci. 118 (Pt 12): 2601–11. doi:10.1242 / jcs.02401. PMID 15914536.

[Burré_2006-10] Burré J, Beckhaus T, Corvey C, Karas M, Zimmermann H, Volknandt W (září 2006). „Proteiny synaptických vezikul za podmínek klidu a aktivace: analýza pomocí 2-D rozdílové gelové elektroforézy“. Elektroforéza. 27 (17): 3488–96. doi:10,1002 / elps.200500864. PMID 16944461. S2CID 43618245.

[Takamori_2006-11] Takamori S, Holt M, Stenius K, Lemke EA, Grønborg M, Riedel D, Urlaub H, Schenck S, Brügger B, Ringler P, Müller SA, Rammner B, Gräter F, Hub JS, De Groot BL, Mieskes G, Moriyama Y, Klingauf J, Grubmüller H, Heuser J, Wieland F, Jahn R (listopad 2006). „Molekulární anatomie obchodující organely“. Buňka. 127 (4): 831–46. doi:10.1016 / j.cell.2006.10.030. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E357-D. PMID 17110340. S2CID 6703431.

[Vazquez-Martinez_2007-12] Vazquez-Martinez R, Cruz-Garcia D, Duran-Prado M, Peinado JR, Castaño JP, Malagon MM (červenec 2007). „Rab18 inhibuje sekreční aktivitu v neuroendokrinních buňkách interakcí se sekrečními granulemi“. Provoz. 8 (7): 867–82. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00570.x. PMID 17488286. S2CID 9987968.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]