RAB11FIP1 - RAB11FIP1

RAB11FIP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4D0G
Identifikátory
Aliasy	RAB11FIP1„NOEL1A, RCP, rab11-FIP1, RAB11 rodina interagující protein 1
Externí ID	OMIM: 608737 MGI: 1923017 HomoloGene: 11853 Genové karty: RAB11FIP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	37,899,497 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	27,174,646 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba Rab GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • recyklace endosomu; • endozom; • membrána fagocytických vezikul; • membrána; • cytoplazmatický váček; • cytosol; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• transport bílkovin; • regulovaná exocytóza; • negativní regulace sekrece adiponektinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	80223
	75767
	ENSG00000156675
	ENSMUSG00000031488
	Q6WKZ4
	Q9D620
	NM_025151; NM_001002233; NM_001002814
	NM_001080813; NM_029423
	NP_001002814; NP_079427
	NP_001074282; NP_083699
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein interagující s rodinou Rab11 1 (Rab11-FIP1) také známý jako Rab vazebný protein je protein že u lidí je kódován RAB11FIP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Proteiny velkého Rab GTPáza rodina (viz např RAB1A ) mají regulační role při tvorbě, cílení a fúzi intracelulárních transportních vezikul. RAB11FIP1 je jedním z mnoha proteinů, které interagují s a regulují Rab GTPasy.^[6]^[7] RAB11FIP1 byl identifikován jako nový protein podílející se na regulaci obchodu s adiponektiny a uvolňování z adipocytů.^[8] Exprese RAB11FIP1, která se zvyšuje se zvyšujícím se BMI u lidí, inhibuje uvolňování adiponektinu z adipocytů, což potenciálně přispívá ke snížení cirkulujících hladin adiponektinu pozorovaných u obézních populací.^[8]

Interakce

RAB11FIP1 bylo prokázáno komunikovat s RAB11A^[5]^[6]^[9] a RAB4A.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156675 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031488 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Lindsay AJ, Hendrick AG, Cantalupo G, Senic-Matuglia F, Goud B, Bucci C, McCaffrey MW (duben 2002). „Rab coupling protein (RCP), nový efektorový protein Rab4 a Rab11“. J Biol Chem. 277 (14): 12190–9. doi:10,1074 / jbc.M108665200. PMID 11786538.
^ ^A ^b ^C Hales CM, Griner R, Hobdy-Henderson KC, Dorn MC, Hardy D, Kumar R, Navarre J, Chan EK, Lapierre LA, Goldenring JR (říjen 2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". J Biol Chem. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. PMID 11495908.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAB11FIP1 RAB11 rodina interagující protein 1 (třída I)“.
^ ^A ^b Carson, Brian P .; Maria Del Bas, Josep; Moreno-Navarrete, Jose Maria; Fernandez-Real, Jose Manuel; Mora, Silvia (září 2013). „Rab11 efektorový protein FIP1 reguluje adiponektin“. PLOS ONE. 8 (9): e74687. doi:10.1371 / journal.pone.0074687. PMC 3770573. PMID 24040321.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Další čtení

Wallace DM, Lindsay AJ, Hendrick AG, McCaffrey MW (2002). „Nová rodina proteinů Rab11-FIP / Rip / RCP vykazuje rozsáhlé homo- a heterointeragující schopnosti“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 292 (4): 909–15. doi:10.1006 / bbrc.2002.6736. PMID 11944901.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Thériault C, MD Rochdi, rodič JL (2004). „Úloha intracelulárního souboru receptorů spojených s Rab11 vytvořeného konstitutivní endocytózou beta izoformy receptoru tromboxanu A2 (TP beta)“. Biochemie. 43 (19): 5600–7. doi:10.1021 / bi036268v. PMID 15134434.
Peden AA, Schonteich E, Chun J a kol. (2005). „Komplex RCP-Rab11 reguluje třídění endocytických proteinů“. Mol. Biol. Buňka. 15 (8): 3530–41. doi:10,1091 / mbc.E03-12-0918. PMC 491816. PMID 15181150.
Lindsay AJ, McCaffrey MW (2004). "Charakterizace vazebných vlastností Rabu vazebného proteinu Rab (RCP) místně cílenou mutagenezí". FEBS Lett. 571 (1–3): 86–92. doi:10.1016 / j.febslet.2004.06.068. PMID 15280022. S2CID 35306314.
Damiani MT, Pavarotti M, Leiva N a kol. (2005). "Rab vazebný protein se asociuje s fagozomy a reguluje recyklaci z fagozomálního kompartmentu". Provoz. 5 (10): 785–97. doi:10.1111 / j.1600-0854.2004.00220.x. PMID 15355514. S2CID 37310957.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Marie N, Lindsay AJ, McCaffrey MW (2005). „Rab vazebný protein je selektivně degradován calpainem způsobem závislým na Ca2 +“. Biochem. J. 389 (Pt 1): 223–31. doi:10.1042 / BJ20042116. PMC 1184555. PMID 15769254.
Tajika Y, Matsuzaki T, Suzuki T a kol. (2006). "Diferenciální regulace obchodování AQP2 v endosomech mikrotubuly a aktinovými vlákny". Histochem. Cell Biol. 124 (1): 1–12. doi:10.1007 / s00418-005-0010-3. PMID 16049696. S2CID 14746792.
Patil VS, Sachdeva G, Modi DN a kol. (2006). „Rab coupling protein (RCP): nový cíl působení progesteronu v endometriu primátů“. J. Mol. Endokrinol. 35 (2): 357–72. doi:10.1677 / jme.1.01807. PMID 16216915.
Jin M, Goldenring JR (2006). "Rab11-FIP1 / RCP gen kóduje více transkriptů proteinů souvisejících se systémem recyklace plazmatické membrány". Biochim. Biophys. Acta. 1759 (6): 281–95. doi:10.1016 / j.bbaexp.2006.06.001. PMID 16920206.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156675 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031488 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11786538-5] A ^b ^C Lindsay AJ, Hendrick AG, Cantalupo G, Senic-Matuglia F, Goud B, Bucci C, McCaffrey MW (duben 2002). „Rab coupling protein (RCP), nový efektorový protein Rab4 a Rab11“. J Biol Chem. 277 (14): 12190–9. doi:10,1074 / jbc.M108665200. PMID 11786538.

[pmid11495908-6] A ^b ^C Hales CM, Griner R, Hobdy-Henderson KC, Dorn MC, Hardy D, Kumar R, Navarre J, Chan EK, Lapierre LA, Goldenring JR (říjen 2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". J Biol Chem. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. PMID 11495908.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RAB11FIP1 RAB11 rodina interagující protein 1 (třída I)“.

[ncbi.nlm.nih.gov-8] A ^b Carson, Brian P .; Maria Del Bas, Josep; Moreno-Navarrete, Jose Maria; Fernandez-Real, Jose Manuel; Mora, Silvia (září 2013). „Rab11 efektorový protein FIP1 reguluje adiponektin“. PLOS ONE. 8 (9): e74687. doi:10.1371 / journal.pone.0074687. PMC 3770573. PMID 24040321.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]