RAB4A - RAB4A

RAB4A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1YU9, 1Z0K, 2BMD, 2BME
Identifikátory
Aliasy	RAB4A, HRES-1, HRES-1 / RAB4, HRES1, RAB4, člen onkogenní rodiny RAS
Externí ID	OMIM: 179511 MGI: 105069 HomoloGene: 101538 Genové karty: RAB4A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	229,305,894 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	123,835,287 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba na HDP; • Vazba ATPázy; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • Aktivita ATPázy; • syntaxinová vazba; • vazba ionotropního glutamátového receptoru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • recyklace endosomu; • váček; • cytosol; • endozom; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • kompartment reagující na inzulín; • buněčná membrána; • perinukleární oblast cytoplazmy; • extracelulární exosom; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • postsynaptický recyklační endosom; • časná endosomová membrána; • recyklace endosomové membrány; • zakotvená součást membrány synaptických vezikul;
Biologický proces	• regulace endocytózy; • zpracování a prezentace antigenu; • pozitivní regulace aktivity ATPázy; • Transdukce signálu Rab proteinu; • transport bílkovin; • proces biosyntézy fosfatidylinositolu; • transport intracelulárních proteinů; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5867
	19341
	ENSG00000168118
	ENSMUSG00000019478
	P20338
	P56371
	NM_001271998; NM_004578
	NM_009003
	NP_001258927; NP_004569; NP_004569.2
	NP_033029
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-4A je protein že u lidí je kódován RAB4A gen.^[5]

Interakce

RAB4A bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168118 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019478 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: RAB4A RAB4A, člen onkogenní rodiny RAS“.
^ Cormont M, Metón I, Mari M, Monzo P, Keslair F, Gaskin C, McGraw TE, Le Marchand-Brustel Y (únor 2003). „CD2AP / CMS reguluje morfologii endosomu a přenos na degradační dráhu prostřednictvím své interakce s Rab4 a c-Cbl“. Provoz. 4 (2): 97–112. doi:10.1034 / j.1600-0854.2003.40205.x. PMID 12559036.
^ Imamura T, Huang J, Usui I, Satoh H, Bever J, Olefsky JM (červenec 2003). „Translokace GLUT4 indukovaná inzulínem zahrnuje funkční vazbu zprostředkovanou proteinkinázou C-lambda mezi Rab4 a motorovým proteinovým kinesinem“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (14): 4892–900. doi:10.1128 / mcb.23.14.4892-4900.2003. PMC 162221. PMID 12832475.
^ Lindsay AJ, Hendrick AG, Cantalupo G, Senic-Matuglia F, Goud B, Bucci C, McCaffrey MW (duben 2002). „Rab coupling protein (RCP), nový efektorový protein Rab4 a Rab11“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (14): 12190–9. doi:10,1074 / jbc.M108665200. PMID 11786538.
^ Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (duben 1998). „Výrazné Rab vazebné domény zprostředkovávají interakci Rabaptinu-5 s GTP vázanými Rab4 a Rab5“. Časopis EMBO. 17 (7): 1941–51. doi:10.1093 / emboj / 17.7.1941. PMC 1170540. PMID 9524117.
^ Li L, Omata W, Kojima I, Shibata H (únor 2001). "Přímá interakce Rab4 se syntaxinem 4". The Journal of Biological Chemistry. 276 (7): 5265–73. doi:10,1074 / jbc.M003883200. PMID 11063739.

Další čtení

Stibbs HH, Seed JR (duben 1975). "Krátkodobý metabolismus (14-C) tryptofanu u potkanů infikovaných Trypanosoma brucei gambiense". The Journal of Infectious Diseases. 131 (4): 459–62. doi:10.1093 / infdis / 131.4.459. PMID 1117200.
van der Sluijs P, Hull M, Huber LA, Mâle P, Goud B, Mellman I (prosinec 1992). "Reverzibilní fosforylace - defosforylace určuje lokalizaci rab4 během buněčného cyklu". Časopis EMBO. 11 (12): 4379–89. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05538.x. PMC 557012. PMID 1425574.
Bailly E, McCaffrey M, Touchot N, Zahraoui A, Goud B, Bornens M (duben 1991). "Fosforylace dvou malých GTP-vázajících proteinů rodiny Rab pomocí p34cdc2". Příroda. 350 (6320): 715–8. doi:10.1038 / 350715a0. PMID 1902553.
Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Touchot N, Tavitian A, Berger R (únor 1991). "Přiřazení čtyř RAB genů RAS souvisejících s chromozomy". Genetika člověka. 86 (4): 350–4. doi:10.1007 / BF00201831. PMID 1999336.
Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (červenec 1989). „Lidské geny Rab kódují rodinu proteinů vázajících GTP souvisejících s produkty kvasinek YPT1 a SEC4 zapojenými do sekrece.“ The Journal of Biological Chemistry. 264 (21): 12394–401. PMID 2501306.
Cormont M, Tanti JF, Zahraoui A, Van Obberghen E, Le Marchand-Brustel Y (únor 1994). „Rab4 je fosforylován inzulinem aktivovanou kinázou ERK1 aktivovanou extracelulárním signálem.“ European Journal of Biochemistry / FEBS. 219 (3): 1081–5. doi:10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18591.x. PMID 8112321.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Karniguian A, Zahraoui A, Tavitian A (srpen 1993). "Identifikace malých GTP vázajících rab proteinů v lidských krevních destičkách: trombinem indukovaná fosforylace proteinů rab3B, rab6 a rab8". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (16): 7647–51. doi:10.1073 / pnas.90.16.7647. PMC 47199. PMID 8356066.
Valentijn JA, LaCivita DQ, Gumkowski FD, Jamieson JD (leden 1997). "Rab4 se asociuje s aktinovou terminální sítí při vývoji krysích pankreatických acinárních buněk". European Journal of Cell Biology. 72 (1): 1–8. PMID 9013719.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (duben 1998). „Výrazné Rab vazebné domény zprostředkovávají interakci Rabaptinu-5 s GTP vázanými Rab4 a Rab5“. Časopis EMBO. 17 (7): 1941–51. doi:10.1093 / emboj / 17.7.1941. PMC 1170540. PMID 9524117.
Bucci C, Chiariello M, Lattero D, Maiorano M, Bruni CB (květen 1999). "Interakční klonování a charakterizace cDNA kódující lidský prenylovaný akceptor rab (PRA1)". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 258 (3): 657–62. doi:10.1006 / bbrc.1999.0651. PMID 10329441.
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (září 1999). „Obecná role inhibitoru disociace GDP 2 v membránovém uvolňování proteinů Rab: modulace jeho funkčních interakcí strukturálními modifikacemi in vitro a in vivo“. Biochemie. 38 (36): 11711–21. doi:10.1021 / bi990200r. PMID 10512627.
Nagelkerken B, Van Anken E, Van Raak M, Gerez L, Mohrmann K, Van Uden N, Holthuizen J, Pelkmans L, Van Der Sluijs P (březen 2000). „Rabaptin4, nový efektor malé GTPázy rab4a, je přijímán do perinukleárních recyklačních váčků“. The Biochemical Journal. 346 (3): 593–601. doi:10.1042/0264-6021:3460593. PMC 1220890. PMID 10698684.
Gerez L, Mohrmann K, van Raak M, Jongeneelen M, Zhou XZ, Lu KP, van Der Sluijs P (červenec 2000). „Akumulace rab4GTP v cytoplazmě a asociace s peptidyl-prolyl izomerázou pin1 během mitózy“. Molekulární biologie buňky. 11 (7): 2201–11. doi:10,1091 / mbc.11.7.2201. PMC 14913. PMID 10888662.
Li L, Omata W, Kojima I, Shibata H (únor 2001). "Přímá interakce Rab4 se syntaxinem 4". The Journal of Biological Chemistry. 276 (7): 5265–73. doi:10,1074 / jbc.M003883200. PMID 11063739.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Cormont M, Mari M, Galmiche A, Hofman P, Le Marchand-Brustel Y (únor 2001). „Protein obsahující FYVE-prst, Rabip4, je Rab4 efektor zapojený do raného endozomálního přenosu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (4): 1637–42. doi:10.1073 / pnas.031586998. PMC 29309. PMID 11172003.
Bielli A, Thörnqvist PO, Hendrick AG, Finn R, Fitzgerald K, McCaffrey MW (březen 2001). „Malá GTPáza Rab4A interaguje s centrální oblastí cytoplazmatického lehkého meziproduktu dyneinu-1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 281 (5): 1141–53. doi:10.1006 / bbrc.2001.4468. PMID 11243854.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168118 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019478 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: RAB4A RAB4A, člen onkogenní rodiny RAS“.

[pmid12559036-6] Cormont M, Metón I, Mari M, Monzo P, Keslair F, Gaskin C, McGraw TE, Le Marchand-Brustel Y (únor 2003). „CD2AP / CMS reguluje morfologii endosomu a přenos na degradační dráhu prostřednictvím své interakce s Rab4 a c-Cbl“. Provoz. 4 (2): 97–112. doi:10.1034 / j.1600-0854.2003.40205.x. PMID 12559036.

[pmid12832475-7] Imamura T, Huang J, Usui I, Satoh H, Bever J, Olefsky JM (červenec 2003). „Translokace GLUT4 indukovaná inzulínem zahrnuje funkční vazbu zprostředkovanou proteinkinázou C-lambda mezi Rab4 a motorovým proteinovým kinesinem“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (14): 4892–900. doi:10.1128 / mcb.23.14.4892-4900.2003. PMC 162221. PMID 12832475.

[pmid11786538-8] Lindsay AJ, Hendrick AG, Cantalupo G, Senic-Matuglia F, Goud B, Bucci C, McCaffrey MW (duben 2002). „Rab coupling protein (RCP), nový efektorový protein Rab4 a Rab11“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (14): 12190–9. doi:10,1074 / jbc.M108665200. PMID 11786538.

[pmid9524117-9] Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (duben 1998). „Výrazné Rab vazebné domény zprostředkovávají interakci Rabaptinu-5 s GTP vázanými Rab4 a Rab5“. Časopis EMBO. 17 (7): 1941–51. doi:10.1093 / emboj / 17.7.1941. PMC 1170540. PMID 9524117.

[pmid11063739-10] Li L, Omata W, Kojima I, Shibata H (únor 2001). "Přímá interakce Rab4 se syntaxinem 4". The Journal of Biological Chemistry. 276 (7): 5265–73. doi:10,1074 / jbc.M003883200. PMID 11063739.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]