RAB1A - RAB1A

RAB1A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2FOL, 2WWX, 3L0I, 3SFV, 3TKL, 4FMB, 4FMC, 4FMD, 4FME, 4IRU, 4JVS
Identifikátory
Aliasy	RAB1A, RAB1, YPT1, člen onkogenní rodiny RAS
Externí ID	OMIM: 179508 MGI: 97842 HomoloGene: 36154 Genové karty: RAB1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	65,130,331 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	20,226,856 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • kadherinová vazba; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • endozom; • Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • melanosom; • Golgiho membrána; • časný endosom; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární exosom; • transportní vezikulární membrána;
Biologický proces	• nakládání nákladu do vezikuly potažené COPII; • endocytóza; • vytvoření endoteliální intestinální bariéry; • Golgiho organizace; • transport vezikul podél mikrotubulů; • autofagozomální sestava; • pozitivní regulace metabolismu glykoproteinů; • autofagie; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • Povlak vezikul COPII; • transport melanosomu; • sekrece růstového hormonu; • obranná reakce na bakterii; • transport bílkovin; • šíření buněk závislé na adhezi; • migrace buněk; • transport zprostředkovaný vezikuly; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • cilium morfogeneze; • GO: 0090623, GO: 1903835, GO: 0007092, GO: 0051488 pozitivní regulace aktivity ubikvitinové proteinové ligázy; • posttranslační modifikace; • doprava; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5861
	19324
	ENSG00000138069
	ENSMUSG00000020149
	P62820
	P62821
	NM_004161; NM_015543
	NM_008996
	NP_004152; NP_056358
	NP_033022
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-1A je protein že u lidí je kódován RAB1A gen.^[5]^[6]

Interakce

RAB1A bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138069 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020149 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (červenec 1989). „Lidské geny Rab kódují rodinu proteinů vázajících GTP souvisejících s produkty kvasinek YPT1 a SEC4 zapojenými do sekrece.“ The Journal of Biological Chemistry. 264 (21): 12394–401. PMID 2501306.
^ „Entrez Gene: RAB1A RAB1A, člen RAS onkogenní rodiny“.
^ ^A ^b Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (leden 1994). „REP-2, doprovodný protein Rab kódovaný genem podobným choroideremii“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (3): 2111–7. PMID 8294464.
^ Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (září 1998). "Mechanismus Rab geranylgeranylace: tvorba katalytického ternárního komplexu". Biochemie. 37 (36): 12559–68. doi:10.1021 / bi980881a. PMID 9730828.
^ ^A ^b Weide T, Teuber J, Bayer M, Barnekow A (červen 2003). "MICAL-1 izoformy, nové proteiny interagující s rab1". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (1): 79–86. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 00918-5. PMID 12788069.
^ Valsdottir R, Hashimoto H, Ashman K, Koda T, Storrie B, Nilsson T (listopad 2001). "Identifikace rabaptinu-5, rabexu-5 a GM130 jako domnělých efektorů rab33b, regulátoru retrográdního provozu mezi Golgiho aparátem a ER". FEBS Dopisy. 508 (2): 201–9. doi:10.1016 / s0014-5793 (01) 02993-3. PMID 11718716. S2CID 21545088.
^ Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.
^ Satoh A, Wang Y, Malsam J, Beard MB, Warren G (březen 2003). „Golgin-84 je vazebný partner rab1 zapojený do struktury Golgi“. Provoz. 4 (3): 153–61. doi:10.1034 / j.1600-0854.2003.00103.x. PMC 3282115. PMID 12656988.
^ Diao A, Rahman D, Pappin DJ, Lucocq J, Lowe M (leden 2003). „Membránový protein s navinutou cívkou golgin-84 je nový rabův efektor potřebný pro tvorbu pásky Golgi“. The Journal of Cell Biology. 160 (2): 201–12. doi:10.1083 / jcb.200207045. PMC 2172652. PMID 12538640.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Martincic I, Peralta ME, Ngsee JK (říjen 1997). „Izolace a charakterizace duálního prenylovaného receptoru Rab a VAMP2“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (43): 26991–8. doi:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.

Další čtení

Bailly E, McCaffrey M, Touchot N, Zahraoui A, Goud B, Bornens M (duben 1991). "Fosforylace dvou malých GTP vázajících proteinů rodiny Rab pomocí p34cdc2". Příroda. 350 (6320): 715–8. doi:10.1038 / 350715a0. PMID 1902553. S2CID 4261640.
Farnsworth CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (prosinec 1994). „Rab geranylgeranyl transferáza katalyzuje geranylgeranylaci sousedních cysteinů v malých GTPázách Rab1A, Rab3A a Rab5A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (25): 11963–7. doi:10.1073 / pnas.91.25.11963. PMC 45356. PMID 7991565.
Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (leden 1994). „REP-2, doprovodný protein Rab kódovaný genem podobným choroideremii“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (3): 2111–7. PMID 8294464.
Karniguian A, Zahraoui A, Tavitian A (srpen 1993). "Identifikace malých GTP vázajících rab proteinů v lidských krevních destičkách: trombinem indukovaná fosforylace proteinů rab3B, rab6 a rab8". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (16): 7647–51. doi:10.1073 / pnas.90.16.7647. PMC 47199. PMID 8356066.
Wedemeyer N, Lengeling A, Ronsiek M, Korthaus D, Baer K, Wuttke M, Jockusch H (březen 1996). „YAC kontigy oblasti genu pro spinální svalovou atrofii Rab1 a voblera (wr) na proximálním myším chromozomu 11 a homologní oblasti na lidském chromozomu 2p“ (PDF). Genomika. 32 (3): 447–54. doi:10.1006 / geno.1996.0140. PMID 8838809.
Martincic I, Peralta ME, Ngsee JK (říjen 1997). „Izolace a charakterizace duálního prenylovaného receptoru Rab a VAMP2“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (43): 26991–8. doi:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.
Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (září 1998). "Mechanismus Rab geranylgeranylace: tvorba katalytického ternárního komplexu". Biochemie. 37 (36): 12559–68. doi:10.1021 / bi980881a. PMID 9730828.
Bao S, Zhu J, Garvey WT (listopad 1998). „Klonování Rab GTPáz exprimovaných v lidském kosterním svalu: studie u subjektů rezistentních na inzulín“. Hormonální a metabolický výzkum = Hormon- und Stoffwechselforschung = Hormony a metabolismus. 30 (11): 656–62. doi:10.1055 / s-2007-978953. PMID 9918381.
Allan BB, Moyer BD, Balch WE (červenec 2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Moyer BD, Allan BB, Balch WE (duben 2001). "Interakce Rab1 s efektorovým komplexem GM130 reguluje uvázání cis-Golgiho váčku COPII". Provoz. 2 (4): 268–76. doi:10.1034 / j.1600-0854.2001.1o007.x. PMID 11285137. S2CID 43069518.
Muslin AJ (prosinec 2001). „Road Rage: Cardiac Rab1 and ER-to-Golgi Traffic“. Výzkum oběhu. 89 (12): 1087–8. doi:10.1161 / res.89.12.1087. PMID 11739271.
Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.
Diao A, Rahman D, Pappin DJ, Lucocq J, Lowe M (leden 2003). „Membránový protein s navinutou cívkou golgin-84 je nový rabův efektor potřebný pro tvorbu pásky Golgi“. The Journal of Cell Biology. 160 (2): 201–12. doi:10.1083 / jcb.200207045. PMC 2172652. PMID 12538640.
Satoh A, Wang Y, Malsam J, Beard MB, Warren G (březen 2003). „Golgin-84 je vazebný partner rab1 zapojený do struktury Golgi“. Provoz. 4 (3): 153–61. doi:10.1034 / j.1600-0854.2003.00103.x. PMC 3282115. PMID 12656988.
Weide T, Teuber J, Bayer M, Barnekow A (červen 2003). "MICAL-1 izoformy, nové proteiny interagující s rab1". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (1): 79–86. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00918-5. PMID 12788069.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138069 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020149 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2501306-5] Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (červenec 1989). „Lidské geny Rab kódují rodinu proteinů vázajících GTP souvisejících s produkty kvasinek YPT1 a SEC4 zapojenými do sekrece.“ The Journal of Biological Chemistry. 264 (21): 12394–401. PMID 2501306.

[entrez-6] „Entrez Gene: RAB1A RAB1A, člen RAS onkogenní rodiny“.

[pmid8294464-7] A ^b Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (leden 1994). „REP-2, doprovodný protein Rab kódovaný genem podobným choroideremii“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (3): 2111–7. PMID 8294464.

[pmid9730828-8] Anant JS, Desnoyers L, Machius M, Demeler B, Hansen JC, Westover KD, Deisenhofer J, Seabra MC (září 1998). "Mechanismus Rab geranylgeranylace: tvorba katalytického ternárního komplexu". Biochemie. 37 (36): 12559–68. doi:10.1021 / bi980881a. PMID 9730828.

[pmid12788069-9] A ^b Weide T, Teuber J, Bayer M, Barnekow A (červen 2003). "MICAL-1 izoformy, nové proteiny interagující s rab1". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (1): 79–86. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 00918-5. PMID 12788069.

[pmid11718716-10] Valsdottir R, Hashimoto H, Ashman K, Koda T, Storrie B, Nilsson T (listopad 2001). "Identifikace rabaptinu-5, rabexu-5 a GM130 jako domnělých efektorů rab33b, regulátoru retrográdního provozu mezi Golgiho aparátem a ER". FEBS Dopisy. 508 (2): 201–9. doi:10.1016 / s0014-5793 (01) 02993-3. PMID 11718716. S2CID 21545088.

[pmid11739401-11] Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.

[pmid12656988-12] Satoh A, Wang Y, Malsam J, Beard MB, Warren G (březen 2003). „Golgin-84 je vazebný partner rab1 zapojený do struktury Golgi“. Provoz. 4 (3): 153–61. doi:10.1034 / j.1600-0854.2003.00103.x. PMC 3282115. PMID 12656988.

[pmid12538640-13] Diao A, Rahman D, Pappin DJ, Lucocq J, Lowe M (leden 2003). „Membránový protein s navinutou cívkou golgin-84 je nový rabův efektor potřebný pro tvorbu pásky Golgi“. The Journal of Cell Biology. 160 (2): 201–12. doi:10.1083 / jcb.200207045. PMC 2172652. PMID 12538640.

[pmid16189514-14] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid9341137-15] Martincic I, Peralta ME, Ngsee JK (říjen 1997). „Izolace a charakterizace duálního prenylovaného receptoru Rab a VAMP2“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (43): 26991–8. doi:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]