Pseudoautosomální oblast - Pseudoautosomal region

Detail šíření lidské metafáze. Oblast v pseudoautosomální oblasti krátkých ramen chromozomu X (vlevo) a chromozomu Y (vpravo nahoře) byla detekována fluorescenční hybridizace in situ (zelená). Chromozomy byly vybarveny červeně.

The pseudoautosomální oblasti, PAR1, PAR2,[1] jsou homologní sekvence nukleotidy na X a Y chromozomy.

Pseudoautosomální oblasti dostávají své jméno, protože v nich byly nalezeny jakékoli geny (dosud bylo nalezeno nejméně 29)[2] jsou zděděny jako každý jiný autosomální geny. PAR1 obsahuje 2,6 Mbp špiček krátkých ramen chromozomů X i Y u lidí a lidoopů (X ​​a Y jsou celkem 155 Mbp a 59 Mbp). PAR2 je na špičkách dlouhých paží a má 320 kbp.[3]

Umístění

Pseudoautosomální oblasti jsou na obou koncích pohlavních chromozomů.

Umístění PAR v rámci GRCh38 jsou:[4]

názevChromozómZačátek základního páruZastavení základního páruKapela[5]
PAR1X10,0012,781,479Xp22
Y10,0012,781,479Yp11
PAR2X155,701,383156,030,895Xq28
Y56,887,90357,217,415Yq12

Umístění PAR v GRCh37 jsou:

názevChromozómZačátek základního páruZastavení základního páru
PAR1X60,0012,699,520
Y10,0012,649,520
PAR2X154,931,044155,260,560
Y59,034,05059,363,566

Dědičnost a funkce

Normální savci mají dvě kopie těchto genů: jednu v pseudoautosomální oblasti jejich chromozomu Y a druhou v odpovídající části jejich chromozomu X. Normální ženy také vlastní dvě kopie pseudoautosomálních genů, protože každý z jejich dvou chromozomů X obsahuje pseudoautosomální oblast. Překračující mezi X a Y chromozomy je normálně omezena na pseudoautosomální oblasti; tedy pseudoautosomální geny vykazují autozomální, nikoli pohlavně vázaný, vzor dědičnosti. Ženy tedy mohou zdědit alelu původně přítomnou na chromozomu Y svého otce.

Funkce těchto pseudoautosomálních oblastí spočívá v tom, že umožňují X a Y. chromozomy spárovat a správně oddělit během redukční dělení buněk u mužů.[6]

Geny

PAR1 obsahuje 16 genů s PLCXD1 jako nejvzdálenější gen PAR1 na distálním telomerním konci a XG na hranici PAR1 na centromerickém konci. PAR2 obsahuje 3 geny s SPRY3 na centromerické hranici a IL9R na distálním telomerním konci.[7]

Pseudoautosomální geny se nacházejí na dvou různých místech: PAR1 a PAR2. Předpokládá se, že se vyvinuly nezávisle.[8]

PAR1

v myši, byly přeneseny některé geny PAR1 autosomy.[10]

PAR2

Patologie

Párování (synapse ) chromozomů X a Y a přecházejí (rekombinace ) mezi jejich pseudoautosomálními oblastmi se jeví jako nezbytné pro normální postup mužů redukční dělení buněk.[13] Tedy buňky, ve kterých nedochází k rekombinaci X-Y, selhají v dokončení meiózy. Strukturální a / nebo genetická odlišnost (kvůli hybridizace nebo mutace ) mezi pseudoautosomálními oblastmi chromozomů X a Y může narušit párování a rekombinaci a následně způsobit mužskou neplodnost.

The SHOX gen v oblasti PAR1 je gen nejčastěji asociovaný s dobře známými poruchami u lidí,[14] ale všechny pseudoautosomální geny unikají X-inaktivace a jsou tedy kandidáty na to mít dávkování genů účinky na pohlavní chromozom aneuploidie podmínky (45, X, 47, XXX, 47, XXY, 47, XYY, atd.).

S odstraněním bylo také spojeno Léri-Weill dyschondrosteóza[15] a Madelungova deformita.

Viz také

Reference

  1. ^ Mangs, Helena; Morris BJ (2007). „Lidská pseudoautosomální oblast (PAR): původ, funkce a budoucnost“. Současná genomika. 8 (2): 129–136. doi:10.2174/138920207780368141. PMC  2435358. PMID  18660847.
  2. ^ Blaschke RJ, Rappold G (2006). "Pseudoautosomální oblasti, SHOX a nemoc". Curr Opin Genet Dev. 16 (3): 233–9. doi:10.1016 / j.gde.2006.04.004. PMID  16650979.
  3. ^ Helena Mangs A, Morris BJ (duben 2007). „Lidská pseudoautosomální oblast (PAR): původ, funkce a budoucnost“. Curr. Genomika. 8 (2): 129–36. doi:10.2174/138920207780368141. PMC  2435358. PMID  18660847.
  4. ^ Konsorcium pro genomové reference (2017-01-06). "Přehled lidského genomu GRCh38.p10". Citováno 2017-05-10.
  5. ^ "Pseudoautosomální oblasti Gene Family". Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO. Citováno 2017-05-11.
  6. ^ A b Ciccodicola A, D'Esposito M, Esposito T a kol. (Únor 2000). „Diferenciálně regulované a vyvinuté geny v plně sekvenované pseudoautosomální oblasti Xq / Yq“. Hučení. Mol. Genet. 9 (3): 395–401. doi:10.1093 / hmg / 9.3.395. PMID  10655549.
  7. ^ Weng S, Stoner SA, Zhang DE (2016). „Ztráta pohlavních chromozomů a geny pseudoautosomální oblasti u hematologických malignit“. Cílový cíl. 7 (44): 72356–72372. doi:10.18632 / oncotarget.12050. PMC  5342167. PMID  27655702.
  8. ^ Charchar FJ, Svartman M, El-Mogharbel N, et al. (Únor 2003). „Složité události ve vývoji lidské pseudoautosomální oblasti 2 (PAR2)“. Genome Res. 13 (2): 281–6. doi:10,1101 / gr. 390503. PMC  420362. PMID  12566406.
  9. ^ "Rodina genů pseudoautosomální oblasti 1 (PAR1)". Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO. Citováno 2017-05-12.
  10. ^ Levy MA, Fernandes AD, Tremblay DC, Seah C, Bérubé NG (2008). „Protein SWI / SNF ATRX společně reguluje pseudoautosomální geny, které se translokovaly do autosomů v genomu myši“. BMC Genomics. 9: 468. doi:10.1186/1471-2164-9-468. PMC  2577121. PMID  18842153.
  11. ^ „Genová skupina pseudoautosomální oblasti 2 (PAR2)“. Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO. Citováno 2019-08-30.
  12. ^ „WASH6P“. Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO. Citováno 2019-08-30.
  13. ^ Eichner, E.M. (únor 1991). „Myší Y * chromozom zahrnuje komplexní přeskupení včetně intersticiálního umístění Y-pseudoautosomální oblasti“. Cytogenetika a buněčná genetika. 57 (4): 221–230. doi:10.1159/000133152. PMID  1743079.
  14. ^ Blaschke RJ, Rappold G (červen 2006). "Pseudoautosomální oblasti, SHOX a nemoc". Curr. Opin. Genet. Dev. 16 (3): 233–9. doi:10.1016 / j.gde.2006.04.004. PMID  16650979.
  15. ^ Benito-Sanz S, Thomas NS, Huber C a kol. (Říjen 2005). „Nová třída delecí pseudoautosomální oblasti 1 pod SHOX je spojena s dyschondrosteózou Leri-Weill“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 77 (4): 533–44. doi:10.1086/449313. PMC  1275603. PMID  16175500.

externí odkazy