ZBED1 - ZBED1

ZBED1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CT5
Identifikátory
Aliasy	ZBED1, ALTE, DREF, TRAMP, hDREF, zinkový prst typu BED obsahující 1
Externí ID	OMIM: 300178 HomoloGene: 123965 Genové karty: ZBED1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	2,500,976 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • transpozázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita dimerizace bílkovin; • vazba kovových iontů; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • identická vazba na protein; • Aktivita SUMO transferázy; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleární chromozom; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proteinová sumoylace; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9189
	n / a
	ENSG00000214717
	n / a
	O96006
	n / a
	NM_004729; NM_001171135; NM_001171136
	n / a
	NP_001164606; NP_001164607; NP_004720
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Protein obsahující BED doménu se zinkovým prstem 1 je protein že u lidí je kódován ZBED1 gen.^[3]^[4]^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000214717 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
^ Esposito T, Gianfrancesco F, Ciccodicola A, Montanini L, Mumm S, D'Urso M, Forabosco A (březen 1999). „Nový pseudoautosomální lidský gen kóduje domnělý protein podobný Ac-podobným transpozázám“. Hum Mol Genet. 8 (1): 61–7. doi:10,1093 / hmg / 8,1,61. PMID 9887332.
^ „Entrez Gene: ZBED1 zinkový prst, typ BED obsahující 1“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ohshima N, Takahashi M, Hirose F (2003). „Identifikace lidského homologu transkripčního faktoru DREF s potenciální rolí v regulaci genu histonu H1“. J. Biol. Chem. 278 (25): 22928–38. doi:10,1074 / jbc.M303109200. PMID 12663651.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Yamashita D, Komori H, Higuchi Y a kol. (2007). „Pro jeho jadernou akumulaci a vazbu na DNA je nezbytná vlastní asociace s faktorem vázajícím se na faktor replikace lidské DNA (hDREF) prostřednictvím domény hATC.“. J. Biol. Chem. 282 (10): 7563–75. doi:10,1074 / jbc.M607180200. PMID 17209048.
Yamashita D, Sano Y, Adachi Y a kol. (2007). "hDREF reguluje buněčnou proliferaci a expresi ribozomálních proteinových genů". Mol. Buňka. Biol. 27 (6): 2003–13. doi:10.1128 / MCB.01462-06. PMC 1820502. PMID 17220279.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000214717 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9872452-3] Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (duben 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.

[pmid9887332-4] Esposito T, Gianfrancesco F, Ciccodicola A, Montanini L, Mumm S, D'Urso M, Forabosco A (březen 1999). „Nový pseudoautosomální lidský gen kóduje domnělý protein podobný Ac-podobným transpozázám“. Hum Mol Genet. 8 (1): 61–7. doi:10,1093 / hmg / 8,1,61. PMID 9887332.

[entrez-5] „Entrez Gene: ZBED1 zinkový prst, typ BED obsahující 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]