Index otcovství - Paternity Index

v testování otcovství, Index otcovství (PI) je vypočítaná hodnota generovaná pro jednotlivce genetický marker nebo místo (chromozomální poloha nebo místo DNA sledovaná sekvence) a je spojena se statistickou silou nebo váhou tohoto lokusu ve prospěch nebo proti původu vzhledem k fenotypům testovaných účastníků a scénáři dědičnosti. Fenotyp typicky označuje fyzické vlastnosti, jako je tělesný plán, barva, chování atd. v organismech. Termín používaný v oblasti testování otcovství DNA však odkazuje na to, co je pozorováno přímo v laboratoři. Laboratoře zapojené do testování rodičovství a dalších oborů lidské identity využívají panely pro genetické testování, které obsahují baterii lokusů (množné pro lokus), z nichž každý je vybrán kvůli rozsáhlému alelický rozdíly uvnitř a mezi populacemi. Nepředpokládá se, že tyto genetické variace propůjčují osobě nesoucí alelické uspořádání (s) fyzikální a / nebo behaviorální atributy, a proto na ně není vyvíjen selektivní tlak a následují vzory dědičnosti Hardy Weinberg.

Produktem jednotlivých PI je CPI (Combined Paternity Index), který se nakonec používá k výpočtu pravděpodobnosti otcovství zaznamenaného ve zprávách o otcovství. Požadavky na minimální hodnotu pravděpodobnosti otcovství pro státní případy se mezi státy liší, ale AABB vyžaduje ve svých Standardech pro laboratoře pro testování vztahů (aktuálně v 9. vydání)[1] minimálně 99,0% se uvádí, pokud testovaný muž „není vyloučen“ jako biologický otec dotyčného dítěte. Americké ministerstvo zahraničí vyžaduje minimální pravděpodobnost otcovství 99,5% pro všechny imigrační případy.[2]

Využívají se výpočty PI frekvence alel generované ze zavedených populačních databází[3] nejčastěji pomocí Krátké tandemové opakování.[3]

Protože frekvence alel mohou být generovány interně nebo publikovány, PI se mohou mezi společnostmi lišit. Toto je pochopitelný jev a je ospravedlnitelný mezi členy testovací komunity.[Citace je zapotřebí ]

Výpočty

PI je poměr pravděpodobnosti[4] který je generován porovnáním dvou pravděpodobností kde PI = X / Y:

  1. Čitatel („X“) - The pravděpodobnost že pozorujeme fenotypy testovaných účastníků scénáře dědičnosti, protože testovaný muž je pravým biologickým otcem. Jednodušeji, pravděpodobnost, že k určité události dojde za určitých okolností nebo podmínek. Tento výpočet předpokládá, že testovaní jedinci jsou „skuteční trio / duo“ (což je vysvětleno o dva odstavce níže) nebo jinými slovy, testovaní rodiče jsou skuteční biologičtí rodiče.
  2. Jmenovatel („Y“) - Pravděpodobnost, že budeme sledovat fenotypy testovaných účastníků scénáře dědičnosti, protože náhodný člověk je pravým biologickým otcem. Jednodušeji, pravděpodobnost, že k nějaké události dojde za různých okolností nebo podmínek. Tento výpočet předpokládá, že testovaní jedinci jsou „falešné trio / duo“ nebo jinými slovy, testovaní rodiče nejsou skuteční biologičtí rodiče.

Obecně lze X / Y přeložit jako: Je X / Y krát větší pravděpodobnost pozorovat pozorované fenotypy, pokud je testovaný muž pravým biologickým otcem, než kdyby byl skutečným biologickým otcem netestovaný, nesouvisející náhodně vybraný muž ze stejné rasové populace.

K dispozici je 14 možných kombinací otcovství trojice a 5 možných kombinací otcovství duo.[5]

Viz také

Reference

  1. ^ Pokyny pro standardy pro laboratoře pro testování vztahů (9. vydání). ISBN  978-1-56395-293-7.[stránka potřebná ]
  2. ^ „Procedury testování vztahu DNA“. Úřad pro konzulární záležitosti.
  3. ^ A b Budowle, B; Shea, B; Niezgoda, S; Chakraborty, R (2001). "Data lokusů CODIS STR ze 41 populací vzorků". Journal of Forensic Sciences. 46 (3): 453–89. doi:10.1520 / JFS14996J. PMID  11372982.
  4. ^ Baur, MP; Elston, RC; Gürtler, H; Henningsen, K; Hummel, K; Matsumoto, H; Mayr, W; Moris, JW; et al. (1986). „Žádné klamy ve formulaci indexu otcovství“. American Journal of Human Genetics. 39 (4): 528–36. PMC  1683973. PMID  3766545.
  5. ^ http://dna-view.com/patform.htm

Další čtení

externí odkazy