Pantoea aglomerans - Pantoea agglomerans

Gramovo barvení Pantoea aglomerans pod 1000 zvětšení

Pantoea aglomerans
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Gama proteobakterie
Objednat:
Enterobacterales
Rodina:
Erwiniaceae
Rod:
Pantoea
Binomické jméno
Pantoea aglomerans
(Ewing a Fife 1972)
Gavini et al. 1989
Typ kmene
ATCC 27155
CCUG 539
CDC 1461-67
CFBP 3845
CIP 57,51
DSM 3493
ICPB 3435
ICMP 12534
JCM 1236
LMG 1286
NCTC 9381
Synonyma

Enterobacter agglomerans Ewing a Fife 1972
Bacillus agglomerans Beijerinck 1888
Erwinia herbicola (Löhnis 1911) Dye 1964
Bacterium herbicola Löhnis 1911
Bacterium herbicola Geilinger 1921
Pseudomonas herbicola (Geilinger 1921) de’Rossi 1927
Corynebacterium beticola Abdou 1969
Pseudomonas trifolii Hus

Pantoea aglomerans je Gramnegativní bakterie který patří do rodiny Erwiniaceae.

Dříve se tomu říkalo Enterobacter agglomeransnebo Erwinia herbicola a je všudypřítomná bakterie běžně izolovaná z povrchů rostlin, semen, plodů a zvířecích nebo lidských výkalů a lze ji nalézt v prostředí včel.[1]

Bakteriologie

Pantoea aglomerans může sloužit jako konkurent rostlinných patogenů pro zvládání chorob rostlin. Plíseň ohně, onemocnění rostlin způsobené bakterií Erwinia amylovora, se běžně vyskytuje v plodinách hrušek a jablek.[2][3][4] Po kontaktu s Erwinia amylovora, Pantoea aglomerans produkuje antibiotické vlastnosti, které jsou toxické pro bakterii vyvolávající plíseň. Bylo zjištěno, že je možné, že úprava nebo vyloučení stanoviště může také hrát roli v účinnosti antibiózy biologické kontroly plíseň.[5][3]

Faktory prostředí ovlivňující růst a šíření Pantoea aglomerans zahrnují zimní chlazení, dobré sluneční světlo a kvalitní cirkulaci vzduchu.[6] Ovocné stromy, jako jsou jabloně a hrušky, jsou běžné Pantoea aglomerans hostitelé a během období kvetení dostávají ovocné stromy období ochlazování, aby je v následujícím jaru oživily ze svého nečinného stavu. Pokud jde o vystavení slunečnímu záření, ovocné stromy obecně rostou nejlépe v teplém, vlhkém a dobře osvětleném prostředí Pantoea aglomerans musí být také schopen přežít za těchto podmínek, pokud doufá, že infikuje zdravé hostitele rostlin. Pantoea aglomerans je aerobní bakterie, takže k přežití vyžaduje určitou úroveň cirkulace vzduchu.[7]

Pantoea aglomerans se nachází v střevo z kobylky. Kobylky se přizpůsobily pro použití guajakol produkovaný Pantoea aglomerans zahájit synchronizaci rojení kobylky.[8]

To je také běžně k dispozici jako symbiont v střevo z komáři. Vědci vytvořili a geneticky modifikovaný kmen Pantoea aglomerans vyrobit antimalarický efektorové molekuly. Očkování komárů tímto kmenem snížilo prevalenci organismu způsobujícího malárii (Plasmodium ) až o 98%.[9]

Antibiotika odvozená od Pantoea aglomerans

Ukázaly to novější studie Pantoea aglomerans má širokou škálu antibiotik, která z něj lze odvodit. Mezi tato antibiotika patří: herbicolin, pantociny, fenazin a další.[3][4] Navíc, Pantoea aglomerans produkty mohou působit jako konzervační látky, mají bioremediační vlastnosti a mohou bojovat proti škodlivým patogenům v rostlinách. Japonský výzkumník dokázal izolovat IP-PA1 v roce Pantoea aglomerans a zjistil, že lipopolysacharid má nízkou molekulovou hmotnost, což mu dává jedinečné vlastnosti. Bylo také zjištěno, že tato bakterie používá aktivitu makrofágů k regulaci homeostázy, dávání Pantoea aglomerans léčivé vlastnosti. Mezi tyto vlastnosti patří: „nádory, hyperlipidémie, cukrovka, vředy, různé infekční nemoci, atopická alergie a imunosuprese vyvolaná stresem“.[10]

Klinické izoláty

Pantoea aglomerans je občas uváděn jako oportunistický patogen v imunokompromitovaný pacientů, způsobujících infekce ran, krve a močových cest. Infekce se obvykle získávají z infikovaných částí vegetace pronikajících kůží. Kontaminované intravenózní tekutiny nebo krevní produkty jsou původcem pouze zřídka.[11] Infekce krevního řečiště může vést k šíření nemoci a koncový orgán infekce septická artritida, ale také endoftalmitida, periostitis, endokarditida a osteomyelitida u lidí.[12]

Pomocí biochemických panelů běžně používaných v lékařské diagnostice je obtížné rozlišit Pantoea aglomerans z jiných druhů stejného rodu nebo z členů příbuzných rodů, jako je Phytobacter, Enterobacter, Klebsiella, a Serratia spp.[13] To vedlo ke zmatku kolem něj patogenita jako molekulární studie založené na Sekvenování DNA vyvrátili identitu několika klinických izolátů původně uváděných jako Pantoea aglomerans.[3][14] Pro přesnou identifikaci Pantoea aglomerans nekulturní metody jako např Zadávání sekvencí multilocus (MLST) nebo Celobuněčný MALDI-TOF MS jsou doporučeny.[15]

Reference

  1. ^ Loncaric, Igor; Heigl, Helmut; Licek, Elisabeth; Moosbeckhofer, Rudolf; Busse, Hans-Jürgen; Rosengarten, Renate (01.01.2009). "Psaní Pantoea aglomeransizolované z kolonií včel (Apis mellifera) a kultivovatelnost vybraných kmenů z medu “. Apidologie. 40 (1): 40–54. doi:10.1051 / apido / 2008062. ISSN  0044-8435. S2CID  29833478.
  2. ^ Anderson, L. M .; Stockwell, V. O .; Loper, J. E. (listopad 2004). "Extracelulární proteáza Pseudomonas fluorescens deaktivuje antibiotika zPantoea aglomerans". Fytopatologie. 94 (11): 1228–1234. doi:10.1094 / phyto.2004.94.11.1228. PMID  18944458.
  3. ^ A b C d Rezzonico, Fabio; Smits, Theo HM; Montesinos, Emilio; Frey, Jürg E .; Duffy, Brion (01.01.2009). "Genotypové srovnání Pantoea aglomerans rostlinné a klinické kmeny ". Mikrobiologie BMC. 9: 204. doi:10.1186/1471-2180-9-204. ISSN  1471-2180. PMC  2764716. PMID  19772624.
  4. ^ A b Lim, Jeong-A; Lee, Dong Hwan; Kim, Byoung-Young; Heu, Sunggi (2014-10-20). "Návrh sekvence genomuPantoea aglomeransR190, výrobce antibiotik proti fytopatogenům a potravinovým patogenům “. Journal of Biotechnology. 188: 7–8. doi:10.1016 / j.jbiotec.2014.07.440. ISSN  0168-1656. PMID  25087741.
  5. ^ Johnson, K. B .; Stockwell, V. O .; Cukr, D; Loper, J. E. (listopad 2002). "Antibióza přispívá k biologické kontrole požárního světla"Pantoea aglomeransKmen Eh252 v sadech ". Fytopatologie. 92 (11): 1202–9. doi:10.1094 / phyto.2002.92.11.1202. PMID  18944246.
  6. ^ Johnson, K. B .; Stockwell, V. O .; Cukr, D; Sawyer, T. L. (listopad 2000). "Hodnocení faktorů prostředí ovlivňujících růst a šíření Pantoea aglomerans a mezi květy hrušky a jablka ". Fytopatologie. 90 (11): 1285–94. doi:10.1094 / PHYTO.2000.90.11.1285. PMID  18944433.
  7. ^ „Klima a aspekt“. Apple and Pear Australia Limited. 2009. Citováno 15. prosince 2016.
  8. ^ Dillon, Rod J .; Vennard, Chris T .; Charnley, A. Keith (2000). "Využití střevních bakterií v kobylce". Příroda. 403 (6772): 851. doi:10.1038/35002669. PMID  10706273. S2CID  5207502.
  9. ^ Wang, Sibao; et al. (2012). „Boj proti malárii pomocí vytvořených symbiotických bakterií z vektorových komárů“. Sborník Národní akademie věd. 109 (31): 12734–12739. Bibcode:2012PNAS..10912734W. doi:10.1073 / pnas.1204158109. PMC  3412027. PMID  22802646.
  10. ^ Dutkiewicz, Jacek; Mackiewicz, Barbara; Lemieszek, Marta Kinga; Golec, Marcin; Milanowski, Janusz (02.06.2016). „Pantoea agglomerans: tajemná bakterie zla a dobra. Část IV. Příznivé účinky“. Annals of Agricultural and Environmental Medicine. 23 (2): 206–222. doi:10.5604/12321966.1203879. ISSN  1232-1966. PMID  27294621.
  11. ^ Cruz, A. T .; Cazacu, A. C .; Allen, C. H. (2007-04-18). "Pantoea aglomerans, rostlinný patogen způsobující nemoci člověka “. Journal of Clinical Microbiology. 45 (6): 1989–1992. doi:10.1128 / JCM.00632-07. PMC  1933083. PMID  17442803.
  12. ^ Dutkiewicz, J; Mackiewicz, B; Kinga Lemieszek, M; Golec, M; Milanowski, J (02.06.2016). "Pantoea aglomerans: Tajemná bakterie zla a dobra. Část III. Škodlivé účinky: Infekce lidí, zvířat a rostlin “. Annals of Agricultural and Environmental Medicine. 23 (2): 197–205. doi:10.5604/12321966.1203878. PMID  27294620.
  13. ^ Rezzonico, F .; Stockwell, V.O .; Tonolla, M .; Duffy, B .; Smits, T.H.M. (01.04.2012). "Pantoea klinické izoláty nelze přesně přiřadit druhům na základě metabolického profilování “. Transplantační infekční nemoc. 14 (2): 220–221. doi:10.1111 / j.1399-3062.2011.00684.x. ISSN  1399-3062. PMID  22093950.
  14. ^ Delétoile, Alexis; Decré, Dominique; Courant, Stéphanie; Passet, Virginie; Audo, Jennifer; Grimont, Patrick; Arlet, Guillaume; Brisse, Sylvain (01.02.2009). "Fylogeneze a identifikace Pantoea Druhy a psaníPantoea aglomeransKmeny podle multilokusového genového sekvenování ". Journal of Clinical Microbiology. 47 (2): 300–310. doi:10.1128 / JCM.01916-08. ISSN  0095-1137. PMC  2643697. PMID  19052179.
  15. ^ Rezzonico, Fabio; Vogel, Guido; Duffy, Brion; Tonolla, Mauro (01.07.2010). „Aplikace iontové laserové desorpce s ionizací celé buňky - doba letové hmotnostní spektrometrie pro rychlou identifikaci a shlukovou analýzu Pantoea Druh". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 76 (13): 4497–4509. doi:10.1128 / AEM.03112-09. ISSN  0099-2240. PMC  2897409. PMID  20453125.

externí odkazy