POLR2E - POLR2E

POLR2E
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5IY6, 5IY9, 5IY8, 5IYA, 5IYB, 5IY7, 5IYC, 5YYD
Identifikátory
Aliasy	POLR2E, RPABC1, RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5, polymeráza (RNA) II podjednotka E, RNA polymeráza II podjednotka E, RNA polymeráza II, I a III podjednotka E
Externí ID	OMIM: 180664 MGI: 1913670 HomoloGene: 2018 Genové karty: POLR2E
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	1,095,380 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Aktivita RNA polymerázy II; • Aktivita RNA polymerázy III; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita RNA polymerázy I.; • Aktivita 5'-3 'RNA polymerázy zaměřená na DNA;
Buněčná složka	• cytosol; • Komplex RNA-polymerázy I zaměřený na DNA; • Komplex DNA polymerázy III zaměřený na DNA; • DNA zaměřená RNA polymeráza II, jádrový komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• ukončení transkripce RNA polymerázy I.; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Uzávěr mRNA 7-methylguanosinu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • GO: virový proces 0022415; • transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II; • RNA metabolický proces; • regulace umlčování genů miRNA; • transkripce, chráněná DNA; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • pozitivní regulace produkce interferonu typu I.; • udržování populace somatických kmenových buněk; • pozitivní regulace virové transkripce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5434
	66420
	ENSG00000099817
	ENSMUSG00000004667
	P19388
	Q80UW8
	NM_002695; NM_001316323; NM_001316324
	NM_025554
	NP_001303252; NP_001303253; NP_002686
	NP_079830
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA řízené RNA polymerázy I, II a III podjednotka RPABC1 je protein že u lidí je kódován POLR2E gen.^[4]

Tento gen kóduje pátou největší podjednotku RNA polymerázy II, polymerázy odpovědné za syntézu messengerové RNA v eukaryotech. Tato podjednotka je sdílena dalšími dvěma DNA řízenými RNA polymerázami a je přítomna ve dvojnásobném molárním přebytku nad ostatními podjednotkami polymerázy. Byla prokázána interakce mezi touto podjednotkou a transaktivujícím proteinem viru hepatitidy, což naznačuje, že prostřednictvím této podjednotky může dojít k interakci mezi transkripčními aktivátory a polymerázou. Na chromozomu 11 se nachází pseudogen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že POLR2E komunikovat s TAF15,^[6] POLR2C,^[7] POLR2G,^[7] POLR2H,^[7] POLR2A,^[7] POLR2B,^[7] POLR2L^[7] a GTF2F2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099817 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (srpen 1994). "Chromozomální lokalizace genů podjednotky lidské RNA polymerázy II". Genomika. 20 (3): 496–499. doi:10.1006 / geno.1994.1208. PMID 8034326.
^ „Entrez Gene: POLR2E polymeráza (RNA) II (řízená DNA) polypeptid E, 25 kDa“.
^ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 18 (3): 1489–1497. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. ISSN 0270-7306. PMC 108863. PMID 9488465.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M (červenec 1997). „Interakce mezi podjednotkami lidské RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 272 (27): 16815–16821. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. ISSN 0021-9258. PMID 9201987.
^ Wei, W; Dorjsuren D; Lin Y; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S (duben 2001). „Přímá interakce mezi podjednotkou RAP30 transkripčního faktoru IIF (TFIIF) a RNA polymerázovou podjednotkou 5, která přispívá k asociaci mezi TFIIF a RNA polymerázou II“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (15): 12266–12273. doi:10,1074 / jbc.M009634200. ISSN 0021-9258. PMID 11278533.

Další čtení

Jeang KT (1998). "Tat, kináza asociovaná s Tat a transkripce". J. Biomed. Sci. 5 (1): 24–27. doi:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
Yankulov K, Bentley D (1998). "Kontrola transkripce: Tat kofaktory a transkripční prodloužení". Curr. Biol. 8 (13): R447–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
Romano G, Kasten M, De Falco G a kol. (2000). "Regulační funkce Cdk9 a cyklinu T1 při expresi genu pro transaktivační dráhu HIV tat". J. Cell. Biochem. 75 (3): 357–368. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID 10536359.
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). "Více režimů transkripční regulace transaktivátorem HIV-1 Tat". IUBMB Life. 51 (3): 175–181. doi:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919. S2CID 10931640.
Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). „Regulace transkripce HIV-1: molekulární cíle pro chemoterapeutickou intervenci“. Med Res Rev. 26 (5): 595–625. doi:10.1002 / med.20081. PMC 7168390. PMID 16838299.
Harrich D, McMillan N, Munoz L a kol. (2007). „Vedou různé Tat interakce k novým antiretrovirovým lékovým cílům?“. Aktuální drogové cíle. 7 (12): 1595–1606. doi:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P a kol. (1992). „HIV-1 Tat působí in vitro ve spojení s faktory prodlužování buněk jako faktor procesivity“. Genes Dev. 6 (4): 655–666. doi:10,1101 / gad. 6.4.455. PMID 1559613.
Pati UK, Weissman SM (1991). „Izolace a molekulární charakterizace cDNA kódující 23-kDa podjednotku lidské RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. 266 (20): 13468. PMID 2071613.
Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). "Aktivace transkripce HIV-1 Tat proteinem uvázaným na rodící se RNA prostřednictvím jiného proteinu". Příroda. 345 (6276): 640–642. Bibcode:1990 Natur.345..640S. doi:10.1038 / 345640a0. PMID 2190099. S2CID 4233742.
Pati UK, Weissman SM (1989). „Izolace a molekulární charakterizace cDNA kódující 23-kDa podjednotku lidské RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. 264 (22): 13114–13121. PMID 2753903.
Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). „Specifická vazba RNA polymerázy II na transaktivující oblast RNA viru lidské imunodeficience je regulována buněčnými kofaktory a Tat“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (16): 7153–7157. Bibcode:1995PNAS ... 92,7153W. doi:10.1073 / pnas.92.16.7153. PMC 41297. PMID 7638159.
Cheong JH, Yi M, Lin Y, Murakami S (1995). „Lidská RPB5, podjednotka sdílená eukaryotickými nukleárními RNA polymerázami, váže na X protein lidského viru hepatitidy B a může hrát roli při X transaktivaci.“. EMBO J.. 14 (1): 143–150. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06984.x. PMC 398061. PMID 7828586.
Herrmann CH, Rice AP (1995). „Lentivirové Tat proteiny se specificky asociují s buněčnou proteinovou kinázou TAK, která hyperfosforyluje karboxylterminální doménu velké podjednotky RNA polymerázy II: kandidát na kofaktor Tat“. J. Virol. 69 (3): 1612–1620. doi:10.1128 / jvi.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496.
Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). „Virus lidské imunodeficience typu 1 Tat je nedílnou součástí aktivovaného komplexu transkripce a prodloužení“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (6): 2505–2510. Bibcode:1996PNAS ... 93,2505K. doi:10.1073 / pnas.93.6.2505. PMC 39827. PMID 8637904.
Yang X, Herrmann CH, Rice AP (1996). „Tat proteiny viru lidské imunodeficience se specificky asociují s TAK in vivo a pro svou funkci vyžadují karboxylovou koncovou doménu RNA polymerázy II“. J. Virol. 70 (7): 4576–4584. doi:10.1128 / jvi.70.7.4576-4584.1996. PMC 190394. PMID 8676484.
Agostini I, Navarro JM, Rey F a kol. (1996). "Transaktivátor viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr: spolupráce s doménami aktivátoru vázaného na promotor a vazba na TFIIB". J. Mol. Biol. 261 (5): 599–606. doi:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID 8800208.
Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–610. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Okamoto H, Sheline CT, Corden JL a kol. (1996). „Transaktivace proteinem Tat viru lidské imunodeficience vyžaduje C-koncovou doménu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (21): 11575–11579. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. doi:10.1073 / pnas.93.21.11575. PMC 38099. PMID 8876177.
Chun RF, Jeang KT (1996). "Požadavky na karboxyl-terminální doménu RNA polymerázy II pro aktivovanou transkripci lidských retrovirů, lidský lymfocytární virus T-buněk I a HIV-1". J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–27894. doi:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID 8910388.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099817 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8034326-4] Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (srpen 1994). "Chromozomální lokalizace genů podjednotky lidské RNA polymerázy II". Genomika. 20 (3): 496–499. doi:10.1006 / geno.1994.1208. PMID 8034326.

[entrez-5] „Entrez Gene: POLR2E polymeráza (RNA) II (řízená DNA) polypeptid E, 25 kDa“.

[pmid9488465-6] Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L (březen 1998). „EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojován s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 18 (3): 1489–1497. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. ISSN 0270-7306. PMC 108863. PMID 9488465.

[pmid9201987-7] A ^b ^C ^d ^E ^F Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M (červenec 1997). „Interakce mezi podjednotkami lidské RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 272 (27): 16815–16821. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. ISSN 0021-9258. PMID 9201987.

[pmid11278533-8] Wei, W; Dorjsuren D; Lin Y; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S (duben 2001). „Přímá interakce mezi podjednotkou RAP30 transkripčního faktoru IIF (TFIIF) a RNA polymerázovou podjednotkou 5, která přispívá k asociaci mezi TFIIF a RNA polymerázou II“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (15): 12266–12273. doi:10,1074 / jbc.M009634200. ISSN 0021-9258. PMID 11278533.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]