PDCD6IP - PDCD6IP
Programovaná buněčná smrt 6-interagující protein také známý jako ALIX je a protein že u lidí je kódován PDCD6IP gen.[5][6]
Tento gen kóduje protein, o kterém se předpokládá, že se účastní programované buněčné smrti. Studie využívající myší buňky ukázaly, že nadměrná exprese tohoto proteinu může blokovat apoptózu. Kromě toho se produkt tohoto genu váže na produkt genu PDCD6, což je protein potřebný pro apoptózu, způsobem závislým na vápníku. Tento genový produkt se také váže na endofiliny, proteiny, které regulují tvar membrány během endocytózy. Nadměrná exprese tohoto genového produktu a endofilinů vede k cytoplazmatické vakuolizaci, která může být částečně zodpovědná za ochranu před smrtí buněk.[6]
Funkce
PDCD6IP protein je součástí ESCRT cesta. Podílí se na štěpení membrány pučení reverzní topologie a podílí se na tvorbě multivesikulárního těla.[7] Je rovněž zásadní v pozdějších fázích a pro úspěšné dokončení cytokineze.[8]
Interakce
PDCD6IP bylo prokázáno komunikovat s PDCD6.[5][9] Doména V PDCD6IP rozpoznává Krátký lineární motiv LYPxLxxL a tento motiv je napodobován pozdní doménou p6 HIV a souvisejících virů, což usnadňuje virové únosy dráhy ESCRT a následné pučení virových částic.[10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170248 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032504 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Vito P, Pellegrini L, Guiet C, D'Adamio L (únor 1999). „Klonování AIP1, nového proteinu, který se asociuje s genem ALG-2 spojeným s apoptózou v reakci závislé na Ca2 +“. J Biol Chem. 274 (3): 1533–40. doi:10.1074 / jbc.274.3.1533. PMID 9880530.
- ^ A b "Entrez Gene: PDCD6IP programovaná buněčná smrt 6 interagujících proteinů".
- ^ Vietri, Marina; Radulovic, Maja; Stenmark, Harald (leden 2020). Msgstr "Mnoho funkcí ESCRT". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 21 (1): 25–42. doi:10.1038 / s41580-019-0177-4. PMID 31705132. S2CID 207939465.
- ^ Carlton, Jez G .; Martin-Serrano, Juan (29. června 2007). „Paralely mezi cytokinezí a retrovirovým pučením: role pro strojní zařízení ESCRT“. Věda. 316 (5833): 1908–1912. Bibcode:2007Sci ... 316.1908C. doi:10.1126 / science.1143422. PMID 17556548. S2CID 29191843.
- ^ Satoh, Hirokazu; Shibata Hideki; Nakano Yoshimi; Kitaura Yasuyuki; Maki Masatoshi (březen 2002). "ALG-2 interaguje s amino-terminální doménou anexinu XI způsobem závislým na Ca (2 +)". Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 291 (5): 1166–72. doi:10.1006 / bbrc.2002.6600. ISSN 0006-291X. PMID 11883939.
- ^ Votteler, Jörg; Sundquist, Wesley I. (září 2013). „Virus Budding and the ESCRT Pathway“. Mobilní hostitel a mikrob. 14 (3): 232–241. doi:10.1016 / j.chom.2013.08.012. PMC 3819203. PMID 24034610.
Další čtení
- Wood JD, Yuan J, Margolis RL a kol. (1998). „Atrophin-1, produkt genu DRPLA, interaguje se dvěma rodinami proteinů obsahujících WW doménu“. Mol. Buňka. Neurosci. 11 (3): 149–60. doi:10,1006 / mcne.1998.0677. PMID 9647693. S2CID 20003277.
- Missotten M, Nichols A, Rieger K, Sadoul R (1999). „Alix, nový myší protein, který prochází interakcí závislou na vápníku s proteinem apoptózy vázaného na gen 2 (ALG-2)“. Buněčná smrt se liší. 6 (2): 124–9. doi:10.1038 / sj.cdd.4400456. PMID 10200558.
- Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
- Wu Y, Pan S, Che S a kol. (2002). "Nadměrná exprese Hp95 indukuje zastavení fáze G1 v soutokých buňkách HeLa". Diferenciace. 67 (4–5): 139–53. doi:10.1046 / j.1432-0436.2001.670406.x. PMID 11683497.
- Satoh H, Shibata H, Nakano Y a kol. (2002). "ALG-2 interaguje s amino-terminální doménou anexinu XI způsobem závislým na Ca (2 +)". Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (5): 1166–72. doi:10.1006 / bbrc.2002.6600. PMID 11883939.
- Chatellard-Causse C, Blot B, Cristina N a kol. (2002). „Alix (protein X interagující s ALG-2), protein zapojený do apoptózy, se váže na endofiliny a vyvolává cytoplazmatickou vakuolizaci“. J. Biol. Chem. 277 (32): 29108–15. doi:10,1074 / jbc.M204019200. PMID 12034747.
- Wu Y, Pan S, Luo W a kol. (2002). „HP95 podporuje anoikis a inhibuje tumorigenicitu buněk HeLa“. Onkogen. 21 (44): 6801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1205849. PMID 12360406.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Vincent O, Rainbow L, Tilburn J a kol. (2003). „YPXL / I je motiv proteinové interakce rozpoznávaný aspergillus PalA a jeho lidským homologem, AIP1 / Alix“. Mol. Buňka. Biol. 23 (5): 1647–55. doi:10.1128 / MCB.23.5.1647-1655.2003. PMC 151718. PMID 12588984.
- Schmidt MH, Chen B, Randazzo LM, Bogler O (2004). „SETA / CIN85 / Ruk a jeho vazebný partner AIP1 se spojují s různými cytoskeletálními prvky, včetně FAK, a modulují buněčnou adhezi“. J. Cell Sci. 116 (Pt 14): 2845–55. doi:10.1242 / jcs.00522. PMID 12771190.
- Katoh K, Shibata H, Suzuki H a kol. (2003). „ALG-2 interagující protein Alix se asociuje s CHMP4b, lidským homologem kvasinek Snf7, který se podílí na multivesikulárním třídění těla“. J. Biol. Chem. 278 (40): 39104–13. doi:10,1074 / jbc.M301604200. PMID 12860994.
- Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (2003). „hLodestar / HuF2 interaguje s CDC5L a podílí se na sestřihu pre-mRNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308 (4): 793–801. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01486-4. PMID 12927788.
- Strack B, Calistri A, Craig S a kol. (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
- von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B a kol. (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
- Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D a kol. (2003). „Divergentní retrovirové domény s pozdním pučením získávají faktory třídění vakuolárních proteinů pomocí alternativních adaptačních proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (21): 12414–9. Bibcode:2003PNAS..10012414M. doi:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
- Peck JW, Bowden ET, Burbelo PD (2004). "Struktura a funkce lidských proteinů Vps20 a Snf7". Biochem. J. 377 (Pt 3): 693–700. doi:10.1042 / BJ20031347. PMC 1223912. PMID 14583093.
- Katoh K, Shibata H, Hatta K, Maki M (2004). „CHMP4b je hlavním vazebným partnerem proteinu Alix interagujícího s ALG-2 mezi třemi izoformami CHMP4.“ Oblouk. Biochem. Biophys. 421 (1): 159–65. doi:10.1016 / j.abb.2003.09.038. PMID 14678797.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Matsuo H, Chevallier J, Mayran N a kol. (2004). „Role LBPA a Alix při tvorbě multivesikulárních liposomů a organizaci endosomů“. Věda. 303 (5657): 531–4. Bibcode:2004Sci ... 303..531M. doi:10.1126 / science.1092425. PMID 14739459. S2CID 36353407.
externí odkazy
- PDCD6IP umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
- PDCD6IP podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |