PDCD6 - PDCD6

PDCD6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2ZN8, 2ZN9, 2ZND, 2ZNE, 2ZRS, 2ZRT, 3AAJ, 3AAK, 3WXA
Identifikátory
Aliasy	PDCD6, ALG-2, PEF1B, ALG2, programovaná buněčná smrt 6
Externí ID	OMIM: 601057 MGI: 109283 HomoloGene: 7880 Genové karty: PDCD6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	314,974 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita dimerizace bílkovin; • kotva proteinové membrány; • vazba na bílkoviny závislá na vápníku; • vazba kovových iontů; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu závislá na vápníku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • GO: Aktivita molekulárního adaptéru 0032947; • vazba iontů hořčíku; • vazba iontů vápníku; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba na bílkoviny, přemostění;
Buněčná složka	• cytoplazma; • endozom; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • Golgiho membrána; • Kabát vezikuly COPII; • Komplex ubikvitin ligázy Cul3-RING; • místo výstupu endoplazmatického retikula; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• negativní regulace signalizace proteinkinázy B.; • buněčná reakce na teplo; • signální dráha receptoru 2 pro vaskulární endoteliální růstový faktor; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • negativní regulace signální dráhy receptoru vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • pozitivní regulace angiogeneze; • pozitivní regulace migrace endotelových buněk; • reakce na iont vápníku; • negativní regulace TOR signalizace; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • angiogeneze; • apoptotická signální cesta; • transport intracelulárních proteinů; • aktivace aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • apoptotický proces; • proteolýza; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • tvorba neurální lišty; • vývoj buněk neurální lišty; • Povlak vezikul COPII; • pozitivní regulace monobikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10016
	18570
	ENSG00000249915
	ENSMUSG00000021576
	O75340
	P12815
	NM_001267556; NM_001267557; NM_001267558; NM_001267559; NM_013232
	NM_011051; NM_001359996
	NP_001254485; NP_001254486; NP_001254487; NP_001254488; NP_037364
	NP_035181; NP_001346925
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Programovaný protein buněčné smrti 6 je protein že u lidí je kódován PDCD6 gen.^[4]

Tento gen kóduje protein vázající vápník patřící do rodiny proteinů penta-EF-hand. Vazba vápníku je důležitá pro homodimerizaci a pro konformační změny potřebné pro vazbu na další proteinové partnery. Tento genový produkt se účastní programované buněčné smrti indukované receptorem T, Fas a glukokortikoidy. U myší s deficitem tohoto genového produktu však nebyla blokována apoptóza, což naznačuje, že tento genový produkt je funkčně nadbytečný.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že PDCD6 komunikovat s POŽÁDAT1,^[6] PDCD6IP,^[7]^[8] Fas receptor,^[9] ANXA11^[8] a PEF1.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000249915 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vito P, Lacana E, D'Adamio L (únor 1996). "Interference s apoptózou: Ca (2 +) - vazebný protein ALG-2 a gen pro Alzheimerovu chorobu ALG-3". Věda. 271 (5248): 521–5. Bibcode:1996Sci ... 271..521V. doi:10.1126 / science.271.5248.521. PMID 8560270. S2CID 22286752.
^ „Entrez Gene: PDCD6 programovaná buněčná smrt 6“.
^ Hwang, In-Sik; Jung Yong-Sam; Kim Eunhee (říjen 2002). "Interakce ALG-2 s ASK1 ovlivňuje lokalizaci ASK1 a následnou aktivaci JNK". FEBS Lett. Holandsko. 529 (2–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03329-X. ISSN 0014-5793. PMID 12372597. S2CID 9264865.
^ Vito, P; Pellegrini L; Guiet C; D'Adamio L (leden 1999). „Klonování AIP1, nového proteinu, který se asociuje s genem ALG-2 spojeným s apoptózou v reakci závislé na Ca2 +“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (3): 1533–40. doi:10.1074 / jbc.274.3.1533. ISSN 0021-9258. PMID 9880530.
^ ^A ^b Satoh, Hirokazu; Shibata Hideki; Nakano Yoshimi; Kitaura Yasuyuki; Maki Masatoshi (březen 2002). "ALG-2 interaguje s amino-terminální doménou anexinu XI způsobem závislým na Ca (2 +)". Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 291 (5): 1166–72. doi:10.1006 / bbrc.2002.6600. ISSN 0006-291X. PMID 11883939.
^ Jung, Y S; Kim KS; Kim KD; Lim JS; Kim J W; Kim E (říjen 2001). „Gen 2 spojený s apoptózou se váže na smrtící doménu Fas a disociuje se z Fas během apoptózy zprostředkované Fas v Jurkatových buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 288 (2): 420–6. doi:10.1006 / bbrc.2001.5769. ISSN 0006-291X. PMID 11606059.
^ Kitaura, Y; Matsumoto S; Satoh H; Hitomi K; Maki M (duben 2001). „Peflin a ALG-2, členové rodiny proteinů penta-EF-hand, tvoří heterodimer, který disociuje způsobem závislým na Ca2 +“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (17): 14053–8. doi:10,1074 / jbc.M008649200. ISSN 0021-9258. PMID 11278427.

Další čtení

Krebs J, Klemenz R (2001). „Komplex ALG-2 / AIP, modulátor na rozhraní mezi buněčnou proliferací a buněčnou smrtí? Hypotéza“. Biochim. Biophys. Acta. 1498 (2–3): 153–61. doi:10.1016 / S0167-4889 (00) 00091-4. PMID 11108958.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Vito P, Pellegrini L, Guiet C, D'Adamio L (1999). „Klonování AIP1, nového proteinu, který se asociuje s genem ALG-2 spojeným s apoptózou v reakci závislé na Ca2 +“. J. Biol. Chem. 274 (3): 1533–40. doi:10.1074 / jbc.274.3.1533. PMID 9880530.
Tarabykina S, Møller AL, Durussel I a kol. (2000). „Dvě formy proteinu ALG-2 spojeného s apoptózou s různými afinitami k Ca (2+) a rozpoznáním cíle“. J. Biol. Chem. 275 (14): 10514–8. doi:10.1074 / jbc.275.14.10514. PMID 10744743.
Chen B, Borinstein SC, Gillis J a kol. (2000). „Protein SETA spojený s gliomem interaguje s AIP1 / Alix a ALG-2 a moduluje apoptózu v astrocytech“. J. Biol. Chem. 275 (25): 19275–81. doi:10,1074 / jbc.M908994199. PMID 10858458.
Kitaura Y, Matsumoto S, Satoh H a kol. (2001). „Peflin a ALG-2, členové rodiny proteinů penta-EF-hand, tvoří heterodimer, který disociuje způsobem závislým na Ca2 +“. J. Biol. Chem. 276 (17): 14053–8. doi:10,1074 / jbc.M008649200. PMID 11278427.
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I a kol. (2001). „Panel interakce protein – protein využívající myší plné délky cDNA“. Genome Res. 11 (10): 1758–65. doi:10,1101 / gr. 180101. PMC 311163. PMID 11591653.
Jung YS, Kim KS, Kim KD a kol. (2001). „Gen 2 spojený s apoptózou se váže na smrtící doménu Fas a disociuje se z Fas během apoptózy zprostředkované Fas v Jurkatových buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 288 (2): 420–6. doi:10.1006 / bbrc.2001.5769. PMID 11606059.
Kitaura Y, Satoh H, Takahashi H a kol. (2002). „Jak ALG-2, tak peflin, proteiny penta-EF-ruky (PEF), jsou stabilizovány dimerizací prostřednictvím svých pátých oblastí EF-ruky“. Oblouk. Biochem. Biophys. 399 (1): 12–8. doi:10.1006 / abbi.2001.2736. PMID 11883899.
Satoh H, Shibata H, Nakano Y a kol. (2002). "ALG-2 interaguje s amino-terminální doménou anexinu XI způsobem závislým na Ca (2 +)". Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (5): 1166–72. doi:10.1006 / bbrc.2002.6600. PMID 11883939.
Chatellard-Causse C, Blot B, Cristina N a kol. (2002). „Alix (protein X interagující s ALG-2), protein zapojený do apoptózy, váže se na endofiliny a vyvolává cytoplazmatickou vakuolizaci“. J. Biol. Chem. 277 (32): 29108–15. doi:10,1074 / jbc.M204019200. PMID 12034747.
Hwang IS, Jung YS, Kim E (2002). "Interakce ALG-2 s ASK1 ovlivňuje lokalizaci ASK1 a následnou aktivaci JNK". FEBS Lett. 529 (2–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03329-X. PMID 12372597. S2CID 9264865.
Satoh H, Nakano Y, Shibata H, Maki M (2002). „Penta-EF-ruční doména ALG-2 interaguje s amino-koncovými doménami jak anexinu VII, tak anexinu XI způsobem závislým na Ca2 +“. Biochim. Biophys. Acta. 1600 (1–2): 61–7. doi:10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4. PMID 12445460.
Krebs J, Saremaslani P, Caduff R (2002). „ALG-2: Ca2 +-vázající modulátorový protein zapojený do buněčné proliferace a do buněčné smrti“. Biochim. Biophys. Acta. 1600 (1–2): 68–73. doi:10.1016 / S1570-9639 (02) 00446-6. PMID 12445461.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Tomsig JL, Snyder SL, Creutz CE (2003). "Identifikace cílů pro vápníkovou signalizaci prostřednictvím kopinové rodiny proteinů. Charakterizace vazebného motivu kopin-vazba na kopin". J. Biol. Chem. 278 (12): 10048–54. doi:10,1074 / jbc.M212632200. PMID 12522145.
Hansen C, Tarabykina S, la Cour JM, et al. (2003). "Proteiny rodiny PEF sorcin a grancalcin interagují in vivo a in vitro". FEBS Lett. 545 (2–3): 151–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00518-0. PMID 12804766. S2CID 42572647.

}}

externí odkazy

PDCD6 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
PDCD6 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000249915 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8560270-4] Vito P, Lacana E, D'Adamio L (únor 1996). "Interference s apoptózou: Ca (2 +) - vazebný protein ALG-2 a gen pro Alzheimerovu chorobu ALG-3". Věda. 271 (5248): 521–5. Bibcode:1996Sci ... 271..521V. doi:10.1126 / science.271.5248.521. PMID 8560270. S2CID 22286752.

[entrez-5] „Entrez Gene: PDCD6 programovaná buněčná smrt 6“.

[pmid12372597-6] Hwang, In-Sik; Jung Yong-Sam; Kim Eunhee (říjen 2002). "Interakce ALG-2 s ASK1 ovlivňuje lokalizaci ASK1 a následnou aktivaci JNK". FEBS Lett. Holandsko. 529 (2–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03329-X. ISSN 0014-5793. PMID 12372597. S2CID 9264865.

[pmid9880530-7] Vito, P; Pellegrini L; Guiet C; D'Adamio L (leden 1999). „Klonování AIP1, nového proteinu, který se asociuje s genem ALG-2 spojeným s apoptózou v reakci závislé na Ca2 +“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (3): 1533–40. doi:10.1074 / jbc.274.3.1533. ISSN 0021-9258. PMID 9880530.

[pmid11883939-8] A ^b Satoh, Hirokazu; Shibata Hideki; Nakano Yoshimi; Kitaura Yasuyuki; Maki Masatoshi (březen 2002). "ALG-2 interaguje s amino-terminální doménou anexinu XI způsobem závislým na Ca (2 +)". Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 291 (5): 1166–72. doi:10.1006 / bbrc.2002.6600. ISSN 0006-291X. PMID 11883939.

[pmid11606059-9] Jung, Y S; Kim KS; Kim KD; Lim JS; Kim J W; Kim E (říjen 2001). „Gen 2 spojený s apoptózou se váže na smrtící doménu Fas a disociuje se z Fas během apoptózy zprostředkované Fas v Jurkatových buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 288 (2): 420–6. doi:10.1006 / bbrc.2001.5769. ISSN 0006-291X. PMID 11606059.

[pmid11278427-10] Kitaura, Y; Matsumoto S; Satoh H; Hitomi K; Maki M (duben 2001). „Peflin a ALG-2, členové rodiny proteinů penta-EF-hand, tvoří heterodimer, který disociuje způsobem závislým na Ca2 +“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (17): 14053–8. doi:10,1074 / jbc.M008649200. ISSN 0021-9258. PMID 11278427.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]