PARD3 - PARD3

PARD3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KOM
Identifikátory
Aliasy	PARD3, ASIP, Baz, PAR3, PAR3alpha, PARD-3, PARD3A, PPP1R118, SE2-5L16, SE2-5LT1, SE2-5T2, regulátor polarity buňky rodiny rodiny 3
Externí ID	OMIM: 606745 MGI: 2135608 HomoloGene: 10489 Genové karty: PARD3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	34,815,325 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	127,612,286 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fosfatidylinositol-3-fosfátu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátu; • vázání proteinové fosfatázy; • vazba fosfatidylinositol-3,4,5-trisfosfátu; • vazba lipidů; • identická vazba na protein; • vazba fosfatidylinositolu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • mezibuněčné spojení; • dvoubuněčný těsný spoj; • buněčná membrána; • axonální růstový kužel; • internode oblast axonu; • buněčné spojení; • tělo neuronových buněk; • buněčná kůra; • cytoskelet; • endomembránový systém; • adherens křižovatka; • makromolekulární komplex; • apikální plazmatická membrána; • apikální spojovací komplex;
Biologický proces	• stanovení polarity epiteliálních buněk; • diferenciace buněk; • axonogeneze; • cílení proteinu na membránu; • negativní regulace fosforylace peptidyl-threoninu; • myelinizace v periferním nervovém systému; • buněčné dělení; • vytvoření nebo udržování polarity buněk; • pozitivní regulace myelinizace; • regulace buněčné lokalizace; • signální dráha receptoru spřaženého s proteinkinázou C aktivující G-protein; • asymetrické dělení buněk; • sestava dvoubunkového těsného spojení; • buněčný cyklus; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • sestava makromolekulárního komplexu; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • buněčná adheze; • lokalizace bílkovin; • stanovení polarity buněk; • vytvoření nebo udržování apikální / bazální polarity epiteliálních buněk; • zřízení lokalizace centrozomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56288
	93742
	ENSG00000148498
	ENSMUSG00000025812
	Q8TEW0
	Q99NH2
NM_001184785; NM_001184786; NM_001184787; NM_001184788; NM_001184789;
	NM_001184790; NM_001184791; NM_001184792; NM_001184793; NM_001184794; NM_019619
NM_001013580; NM_001013581; NM_001122850; NM_033620; NM_001309391;
	NM_001309392; NM_001363431; NM_001363432
NP_001171714; NP_001171715; NP_001171716; NP_001171717; NP_001171718;
	NP_001171719; NP_001171720; NP_001171721; NP_001171722; NP_001171723; NP_062565
NP_001013598; NP_001013599; NP_001116322; NP_001296320; NP_001296321;
	NP_296369; NP_001350360; NP_001350361
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vadný 3 homolog rozdělení je protein že u lidí je kódován PARD3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Proteiny PARD, které byly poprvé identifikovány u C. elegans, jsou nezbytné pro asymetrické dělení buněk a polarizovaný růst, zatímco CDC42 (MIM 116952) zprostředkovává stanovení buněčné polarity. CDC42 GTPáza, která je řízena nukleotidovými výměnnými faktory (GEF; viz MIM 606057) a proteiny aktivující GTPázu (GAP; viz MIM 604980), interaguje s velkou sadou efektorových proteinů, které obvykle obsahují CDC42 / RAC (MIM 602048) -interaktivní vazebná (CRIB) doména. [dodává OMIM]^[6]

Interakce

PARD3 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148498 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025812 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Joberty G, Petersen C, Gao L, Macara IG (říjen 2000). "Protein Par6 s buněčnou polaritou spojuje Par3 a atypickou proteinkinázu C s Cdc42". Nat Cell Biol. 2 (8): 531–9. doi:10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PARD3 par-3 partitioning defective 3 homolog (C. elegans)“.
^ ^A ^b Ebnet K, Aurrand-Lions M, Kuhn A, Kiefer F, Butz S, Zander K, Meyer zu Brickwedde MK, Suzuki A, Imhof BA, Vestweber D (říjen 2003). „Členové rodiny junkčních adhezních molekul (JAM) JAM-2 a JAM-3 se asociují s proteinem PAR-3 buněčné polarity: možná role JAM v polaritě endotelových buněk“. J. Cell Sci. 116 (Pt 19): 3879–91. doi:10.1242 / jcs.00704. PMID 12953056.
^ Kohjima M, Noda Y, Takeya R, Saito N, Takeuchi K, Sumimoto H (prosinec 2002). „PAR3beta, nový homolog proteinu buněčné polarity PAR3, se lokalizuje na těsné spoje“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (4): 641–6. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 02698-0. PMID 12459187.
^ Takekuni K, Ikeda W, Fujito T, Morimoto K, Takeuchi M, Monden M, Takai Y (únor 2003). "Přímá vazba buněčné polarity proteinu PAR-3 na buněčnou buněčnou adhezní molekulu nektinu v neuroepiteliálních buňkách vyvíjející se myši". J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. doi:10.1074 / jbc.C200707200. PMID 12515806.

Další čtení

Johansson A, Driessens M, Aspenström P (2000). „Savčí homolog proteinu polarity Caenorhabditis elegans PAR-6 je vazebným partnerem pro Rho GTPasy Cdc42 a Rac1.“ J. Cell Sci. 113 (18): 3267–75. PMID 10954424.
Eichmuller S, Usener D, Dummer R, Stein A, Thiel D, Schadendorf D (2001). „Sérologická detekce antigenů asociovaných s kožními lymfomy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (2): 629–34. doi:10.1073 / pnas.021386498. PMC 14639. PMID 11149944.
Suzuki A, Yamanaka T, Hirose T, Manabe N, Mizuno K, Shimizu M, Akimoto K, Izumi Y, Ohnishi T, Ohno S (2001). „Atypická proteinkináza C je zapojena do evolučně konzervovaného parproteinového komplexu a hraje rozhodující roli při vytváření spojovacích struktur specifických pro epitel“. J. Cell Biol. 152 (6): 1183–96. doi:10.1083 / jcb.152.6.1183. PMC 2199212. PMID 11257119.
Noda Y, Takeya R, Ohno S, Naito S, Ito T, Sumimoto H (2001). „Lidské homology proteinu PAR6 buněčné polarity Caenorhabditis elegans jako adaptéru, který spojuje malé GTPasy Rac a Cdc42 s atypickou proteinovou kinázou C.“. Geny buňky. 6 (2): 107–19. doi:10.1046 / j.1365-2443.2001.00404.x. PMID 11260256. S2CID 8789941.
Ebnet K, Suzuki A, Horikoshi Y, Hirose T, Meyer Zu Brickwedde MK, Ohno S, Vestweber D (2001). „Protein buněčné polarity ASIP / PAR-3 se přímo asociuje s molekulou junkční adheze (JAM)“. EMBO J.. 20 (14): 3738–48. doi:10.1093 / emboj / 20.14.3738. PMC 125258. PMID 11447115.
Fang CM, Xu YH (2002). „Down-regulovaná exprese atypických izoforem asipu s doménou vázající se na PKC v lidských hepatocelulárních karcinomech“. Cell Res. 11 (3): 223–9. doi:10.1038 / sj.cr.7290090. PMID 11642408.
Gao L, Macara IG, Joberty G (2003). "Více variant sestřihu Par3 a nového příbuzného genu, Par3L, produkuje proteiny s různými vazebnými vlastnostmi". Gen. 294 (1–2): 99–107. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00681-9. PMID 12234671.
Kohjima M, Noda Y, Takeya R, Saito N, Takeuchi K, Sumimoto H (2003). „PAR3beta, nový homolog proteinu buněčné polarity PAR3, se lokalizuje na těsné spoje“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (4): 641–6. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02698-0. PMID 12459187.
Takekuni K, Ikeda W, Fujito T, Morimoto K, Takeuchi M, Monden M, Takai Y (2003). "Přímá vazba buněčné polarity proteinu PAR-3 na buněčnou buněčnou adhezní molekulu nektinu v neuroepiteliálních buňkách vyvíjející se myši". J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. doi:10.1074 / jbc.C200707200. PMID 12515806.
Warner DR, Pisano MM, Roberts EA, Greene RM (2003). "Identifikace tří nových Smad vázajících proteinů zapojených do buněčné polarity". FEBS Lett. 539 (1–3): 167–73. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00155-8. PMID 12650946.
Brajenovic M, Joberty G, Küster B, Bouwmeester T, Drewes G (2004). „Komplexní proteomická analýza lidských proteinových komplexů Par odhaluje vzájemně propojenou proteinovou síť“. J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. doi:10,1074 / jbc.M312171200. PMID 14676191.
Navarro-Lérida I, Martínez Moreno M, Roncal F, Gavilanes F, Albar JP, Rodríguez-Crespo I (2004). "Proteomická identifikace mozkových proteinů, které interagují s dyneinovým lehkým řetězcem LC8". Proteomika. 4 (2): 339–46. doi:10.1002 / pmic.200300528. PMID 14760703. S2CID 8868600.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Liu XF, Ishida H, Raziuddin R, Miki T (2004). „Nukleotidový výměnný faktor ECT2 interaguje s proteinovým komplexem polarity Par6 / Par3 / protein kináza Czeta (PKCzeta) a reguluje aktivitu PKCzeta“. Mol. Buňka. Biol. 24 (15): 6665–75. doi:10.1128 / MCB.24.15.6665-6675.2004. PMC 444862. PMID 15254234.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). „Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace“. Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148498 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025812 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10934474-5] Joberty G, Petersen C, Gao L, Macara IG (říjen 2000). "Protein Par6 s buněčnou polaritou spojuje Par3 a atypickou proteinkinázu C s Cdc42". Nat Cell Biol. 2 (8): 531–9. doi:10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PARD3 par-3 partitioning defective 3 homolog (C. elegans)“.

[pmid12953056-7] A ^b Ebnet K, Aurrand-Lions M, Kuhn A, Kiefer F, Butz S, Zander K, Meyer zu Brickwedde MK, Suzuki A, Imhof BA, Vestweber D (říjen 2003). „Členové rodiny junkčních adhezních molekul (JAM) JAM-2 a JAM-3 se asociují s proteinem PAR-3 buněčné polarity: možná role JAM v polaritě endotelových buněk“. J. Cell Sci. 116 (Pt 19): 3879–91. doi:10.1242 / jcs.00704. PMID 12953056.

[pmid12459187-8] Kohjima M, Noda Y, Takeya R, Saito N, Takeuchi K, Sumimoto H (prosinec 2002). „PAR3beta, nový homolog proteinu buněčné polarity PAR3, se lokalizuje na těsné spoje“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (4): 641–6. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 02698-0. PMID 12459187.

[pmid12515806-9] Takekuni K, Ikeda W, Fujito T, Morimoto K, Takeuchi M, Monden M, Takai Y (únor 2003). "Přímá vazba buněčné polarity proteinu PAR-3 na buněčnou buněčnou adhezní molekulu nektinu v neuroepiteliálních buňkách vyvíjející se myši". J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. doi:10.1074 / jbc.C200707200. PMID 12515806.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]