Nomurabakterie - Nomurabacteria

Nomurabakterie
Vědecká klasifikace
Doména:
(bez hodnocení):
Kmen:
Nomurabakterie

Nomurabakterie je kandidát kmen z bakterie patřící k CPR skupina takže jsou to velmi malé bakterie. Byly nalezeny v nejrůznějších prostředích, hlavně v sedimenty za anaerobních podmínek.[1][2]

Bakterie tohoto kmene sdílejí několik svých charakteristik s jinými ultra malými bakteriemi: jako je nanometrická velikost, malé genomy, redukované metabolismus, nízká kapacita pro syntézu nukleotidy a aminokyseliny, postrádají dýchací řetězce a Krebsův cyklus. Kromě toho mnoho může být endosymbionty větších bakterií.[3][1][2]

Fylogenetické analýzy naznačují, že Nomurabacteria a další ultra malé bakterie tvoří nejzákladnější clade ze všech bakterií. The archaea z DPANN Skupiny jsou ultra-malé archaea, které sdílejí stejné vlastnosti s těmito bakteriemi a jsou nejzákladnější skupinou archeo-eukaryotického kladu, ačkoli to může také být paraphyletic z eukaryoty a další archaea, jak bude vidět níže.[3][2]

V některých fylogenetických analýzách proteom, ultramalé bakterie se objevují mimo tradiční bakteriální doménu a vystupují jako parafyletická skupina tradičních bakterií a kladu složeného z archea a eukaryot. V těchto analýzách se nejvíce ukázaly Nomurabakterie bazální clade všech buněčných organismů.[3][2]

Fylogeneze

Proteome analýzy ukázaly, že Nomurabakterie mohou být nejzákladnější třídou buněčných organismů a že ostatní CPR bakterie jsou paraphyletic skupina, jak je vidět na kladogram který ukazuje fylogenetické vztahy mezi více bakteriálními, archaeanskými a eukaryotickými buňkami.[2]

2016 metagenomické zastoupení strom života pomocí ribosomálních proteinových sekvencí

Reference

  1. ^ A b Castelle, C., Brown, C., Thomas, B. a kol. Neobvyklá dechová kapacita a metabolismus dusíku v Parcubacterium (OD1) kandidátní fylové radiace. Sci Rep 7, 40101 (2017) doi: 10,1038 / srep40101
  2. ^ A b C d E Hug, L. A. a kol. 2016, Nový pohled na strom života. Nature Microbiology, 1, 16048.
  3. ^ A b C Rijja Hussain Bokhari, Nooreen Amirjan, Hyeonsoo Jeong, Kyung Mo Kim, Gustavo Caetano-Anollés, Arshan Nasir (2020). Bakteriální původ a redukční vývoj skupiny CPR. Oxford Academic. https://doi.org/10.1093/gbe/evaa024