Natrialba - Natrialba - Wikipedia

Natrialba
Vědecká klasifikace
Doména:	Archaea
Království:	Euryarchaeota
Kmen:	Euryarchaeota
Třída:	Halobakterie
Objednat:	Halobacteriales
Rodina:	Halobacteriaceae
Rod:	Natrialba; Kamekura a Dyall-Smith 1996
Druh
	N. aegyptia; N. asiatica; N. chahannaoensis; N. hulunbeirensis; N. magadii; N. taiwanensis;

v taxonomie, Natrialba je rod z Halobacteriaceae.^[4] Rod se skládá z mnoha různých druhů, které mohou přežít extrémní mezery v životním prostředí, zejména jsou schopné žít ve vodách nasycených nebo téměř nasycených solí (halofili ).^[5]^[6] Mají určité adaptace, aby žili ve svém slaném prostředí. Například jejich buněčné aparáty jsou přizpůsobeny vysokým koncentracím solí nabíjením aminokyseliny na jejich površích, což umožňuje buňce udržet své molekuly vody kolem těchto složek. Osmotický tlak a tyto aminokyseliny pomáhají regulovat množství soli uvnitř buňka.^[7]

Například, N. magadii je aerobní chemoorganotrophic, dual extremophile vyžadující alkalické podmínky a hypersalinitu pro optimální růst. Tyto drsné podmínky vedly ke změně složení nabitých aminokyselin v bílkoviny (průměrný izoelektrický bod je pouze 4,64, zatímco průměr jiných organismů je 6,5), přičemž téměř všechny bílkoviny jsou vysoce kyselé.^[8] The genom z N. magadii skládá se ze čtyř replikony s celkovou sekvencí 4 443 643 bp a kóduje 4 212 domnělých proteinů. Analýza genomu identifikovala více geny kódování domnělých proteinů zapojených do adaptace na hypersalinitu, stresovou reakci, glykosylace, a polysacharid biosyntéza. Navíc protonově řízený ATP syntáza a různé domnělé cytochromy a další proteiny potřebné pro aerobní dýchání a elektronový přenos byl nalezen. Genom kóduje řadu domnělých proteázy / peptidázy.^[9]

Jejich odolnost vůči solím umožňuje použití některých členů rodu v biotechnologických procesech.^[10]

Reference

^ Kamekura, M .; Seno, Y .; Dyall-Smith, M. (1996-05-23). „Halolysin R4, serinová proteináza z halofilního archaeonu Haloferax mediterranei; genové klonování, exprese a strukturní studie“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1294 (2): 159–167. doi:10.1016/0167-4838(96)00016-7. ISSN 0006-3002. PMID 8645734.
^ Hezayen, F F; Rehm, BH; Tindall, BJ; Steinbüchel, A (2001). „Převod Natrialba asiatica B1T do Natrialba taiwanensis sp. Nov. A popis Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Nového extrémně halofilního, aerobního, nepigmentovaného člena Archea z Egypta, který produkuje extracelulární poly (kyselinu glutamovou)“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (3): 1133–1142. doi:10.1099/00207713-51-3-1133. PMID 11411682.
^ Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Zhou, P .; Smět.; Ventosa, A .; Grant, W. D. (září 2001). "Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. A Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Nová haloalkalifilní archaea ze sódových jezer v autonomní oblasti Vnitřní Mongolsko, Čína". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (Pt 5): 1693–1698. doi:10.1099/00207713-51-5-1693. ISSN 1466-5026. PMID 11594597.
^ Viz NCBI webová stránka Natrialba. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
^ KAMEKURA, MASAHIRO; DYALL-SMITH, MICHAEL L. (1995). "Taxonomie čeledi Halobacteriaceae a popis dvou nových rodů Halorubrobacterium a Natrialba". The Journal of General and Applied Microbiology. 41 (4): 333–350. doi:10 2323 / jgam.41 333. ISSN 0022-1260.
^ Kamekura, M .; Dyall-Smith, M. L .; Upasani, V .; Ventosa, A .; Kates, M. (červenec 1997). „Rozmanitost alkalifilních halobakterií: návrhy na převod Natronobacterium vakuolatum, Natronobacterium magadii a Natronobacterium pharaonis na Halorubrum, Natrialba a Natronomonas gen. Nov., Jako Halorubrum vakuolatum comb. Nov., Natrialba magadii comb. Nov. pharaonis comb. nov. ". International Journal of Systematic Bacteriology. 47 (3): 853–857. doi:10.1099/00207713-47-3-853. ISSN 0020-7713. PMID 9226918.
^ Reed, Christopher J .; Lewis, Hunter; Trejo, Eric; Winston, Vern; Evilia, Caryn (2013). „Proteinové adaptace u archaeálních extremofilů“. Archaea. 2013: 373275. doi:10.1155/2013/373275. ISSN 1472-3646. PMC 3787623. PMID 24151449.
^ Kozlowski, Lukasz P. (01.01.2017). "Proteome-pI: proteome isoelectric point database". Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D1112 – D1116. doi:10.1093 / nar / gkw978. PMC 5210655. PMID 27789699.
^ Siddaramappa, Shivakumara; Challacombe, Jean F .; Decastro, Rosana E .; Pfeiffer, Friedhelm; Sastre, Diego E .; Giménez, María I .; Paggi, Roberto A .; Detter, John C .; Davenport, Karen W. (05.05.2012). „Srovnávací genomický pohled na genetický obsah alkalifilního haloarchaeonu Natrialba magadii ATCC 43099T“. BMC Genomics. 13: 165. doi:10.1186/1471-2164-13-165. PMC 3403918. PMID 22559199.
^ Kebbouche-Gana, Salima; Gana, Mohamed Lamine; Ferrioune, Imen; Khemili, Souad; Lenchi, Nesrine; Akmouci-Toumi, Sihem; Bouanane-Darenfed, Nabila Amel; Djelali, Nacer-Eddine (01.11.2013). „Produkce biosurfaktantu na surovém datlovém sirupu za solných podmínek zachycenými buňkami kmene E21 Natrialba sp., Extrémně halofilní bakterie izolované ze solární solárny (Ain Salah, Alžírsko).“ Extremophiles. 17 (6): 981–993. doi:10.1007 / s00792-013-0580-2. ISSN 1431-0651. PMID 24061687.

Další čtení

Vědecké časopisy

Conde, J. D .; Guillen, J .; Nercessian, D .; Ordonez, M.V .; et al. (Září 2011). "Stanovení sekundární struktury FTIR archaálního ubikvitinového polypeptidu z Natrialba magadii". Evropský biofyzikální časopis. 40 (9): 1101–1107. doi:10.1007 / s00249-011-0719-r. PMID 21701865.
Oren A; Ventosa A (2000). „Mezinárodní výbor pro systematickou bakteriologii Podvýbor pro taxonomii Halobacteriaceae. Zápis ze schůze, 16. srpna 1999, Sydney, Austrálie“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3): 1405–1407. doi:10.1099/00207713-50-3-1405. PMID 10843089.

Vědecké knihy

Gibbons, NE (1974). „Rodina V. Halobacteriaceae fam. Nov.“. V RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8. vydání). Baltimore: Williams & Wilkins Co.

Vědecké databáze

externí odkazy

Tento archaea související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Kamekura, M .; Seno, Y .; Dyall-Smith, M. (1996-05-23). „Halolysin R4, serinová proteináza z halofilního archaeonu Haloferax mediterranei; genové klonování, exprese a strukturní studie“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1294 (2): 159–167. doi:10.1016/0167-4838(96)00016-7. ISSN 0006-3002. PMID 8645734.

[2] Hezayen, F F; Rehm, BH; Tindall, BJ; Steinbüchel, A (2001). „Převod Natrialba asiatica B1T do Natrialba taiwanensis sp. Nov. A popis Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Nového extrémně halofilního, aerobního, nepigmentovaného člena Archea z Egypta, který produkuje extracelulární poly (kyselinu glutamovou)“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (3): 1133–1142. doi:10.1099/00207713-51-3-1133. PMID 11411682.

[3] Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Zhou, P .; Smět.; Ventosa, A .; Grant, W. D. (září 2001). "Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. A Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Nová haloalkalifilní archaea ze sódových jezer v autonomní oblasti Vnitřní Mongolsko, Čína". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (Pt 5): 1693–1698. doi:10.1099/00207713-51-5-1693. ISSN 1466-5026. PMID 11594597.

[4] Viz NCBI webová stránka Natrialba. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.

[5] KAMEKURA, MASAHIRO; DYALL-SMITH, MICHAEL L. (1995). "Taxonomie čeledi Halobacteriaceae a popis dvou nových rodů Halorubrobacterium a Natrialba". The Journal of General and Applied Microbiology. 41 (4): 333–350. doi:10 2323 / jgam.41 333. ISSN 0022-1260.

[6] Kamekura, M .; Dyall-Smith, M. L .; Upasani, V .; Ventosa, A .; Kates, M. (červenec 1997). „Rozmanitost alkalifilních halobakterií: návrhy na převod Natronobacterium vakuolatum, Natronobacterium magadii a Natronobacterium pharaonis na Halorubrum, Natrialba a Natronomonas gen. Nov., Jako Halorubrum vakuolatum comb. Nov., Natrialba magadii comb. Nov. pharaonis comb. nov. ". International Journal of Systematic Bacteriology. 47 (3): 853–857. doi:10.1099/00207713-47-3-853. ISSN 0020-7713. PMID 9226918.

[7] Reed, Christopher J .; Lewis, Hunter; Trejo, Eric; Winston, Vern; Evilia, Caryn (2013). „Proteinové adaptace u archaeálních extremofilů“. Archaea. 2013: 373275. doi:10.1155/2013/373275. ISSN 1472-3646. PMC 3787623. PMID 24151449.

[8] Kozlowski, Lukasz P. (01.01.2017). "Proteome-pI: proteome isoelectric point database". Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D1112 – D1116. doi:10.1093 / nar / gkw978. PMC 5210655. PMID 27789699.

[9] Siddaramappa, Shivakumara; Challacombe, Jean F .; Decastro, Rosana E .; Pfeiffer, Friedhelm; Sastre, Diego E .; Giménez, María I .; Paggi, Roberto A .; Detter, John C .; Davenport, Karen W. (05.05.2012). „Srovnávací genomický pohled na genetický obsah alkalifilního haloarchaeonu Natrialba magadii ATCC 43099T“. BMC Genomics. 13: 165. doi:10.1186/1471-2164-13-165. PMC 3403918. PMID 22559199.

[10] Kebbouche-Gana, Salima; Gana, Mohamed Lamine; Ferrioune, Imen; Khemili, Souad; Lenchi, Nesrine; Akmouci-Toumi, Sihem; Bouanane-Darenfed, Nabila Amel; Djelali, Nacer-Eddine (01.11.2013). „Produkce biosurfaktantu na surovém datlovém sirupu za solných podmínek zachycenými buňkami kmene E21 Natrialba sp., Extrémně halofilní bakterie izolované ze solární solárny (Ain Salah, Alžírsko).“ Extremophiles. 17 (6): 981–993. doi:10.1007 / s00792-013-0580-2. ISSN 1431-0651. PMID 24061687.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]