NRXN2 - NRXN2 - Wikipedia

NRXN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4NXR
Identifikátory
Aliasy	NRXN2, neurexin 2
Externí ID	OMIM: 600566 MGI: 1096362 HomoloGene: 86984 Genové karty: NRXN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	64,723,197 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteinů rodiny neuroliginů; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • vazba molekul buněčné adheze; • aktivita regulátoru kalciového kanálu; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • presynapse; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• adheze neuronů mezi buňkami; • buněčná adheze; • signální transdukce; • shlukování gephyrinů zapojené do sestavy postsynaptické hustoty; • shlukování proteinu 95 postsynaptické hustoty; • chování vokalizace; • vokální učení; • shlukování neuroliginů zapojených do postsynaptické membránové sestavy; • chování dospělých; • sestava postsynaptické membrány; • chování sociálního organismu; • sestava synapse; • GO: Sekvence neurotransmiteru 0010554; • chemický synaptický přenos;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9379
	18190
	ENSG00000110076
	ENSMUSG00000033768
	P58401; Q9P2S2
	E9Q7X7
NM_015080; NM_138732; NM_138734; NM_001376262; NM_001376263;
	NM_001376265; NM_001376266; NM_001376267
	NM_001205234; NM_001205235; NM_020253
NP_055895; NP_620060; NP_620063; NP_001363191; NP_001363192;
	NP_001363194; NP_001363195; NP_001363196; NP_055895.1; NP_620060.1
	NP_001192163; NP_001192164; NP_064649; NP_001356292
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neurexin-2-alfa je protein že u lidí je kódován NRXN2 gen.^[4]^[5]

Neurexiny jsou rodinou proteinů, které fungují v nervovém systému obratlovců jako molekuly a receptory buněčné adheze. Jsou kódovány několika nespojenými geny, z nichž dva, NRXN1 a NRXN3, patří mezi největší známé lidské geny. Tři z genů (NRXN1-3) využívají dva alternativní promotory a zahrnují mnoho alternativně sestříhané exony ke generování tisíců odlišných transkriptů mRNA a proteinových izoforem. Většina transkriptů je produkována z upstream promotoru a kóduje izoformy alfa-neurexinu; mnohem menší počet transkriptů se produkuje z následného promotoru a kóduje beta-neurexin izoformy. Alfa-neurexiny obsahují epidermální růstový faktor (Jako EGF ) sekvence a domény lamininu G. a bylo prokázáno, že interagují s neurexofiliny. Beta-neurexiny postrádají sekvence podobné EGF a obsahují méně domén lamininu G než alfa-neurexiny.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110076 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ushkaryov YA, Petrenko AG, Geppert M, Sudhof TC (srpen 1992). „Neurexiny: synaptické buněčné povrchové proteiny související s alfa-latrotoxinovým receptorem a lamininem“. Věda. 257 (5066): 50–56. doi:10.1126 / science.1621094. PMID 1621094.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NRXN2 neurexin 2“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Ichtchenko K, Nguyen T, Südhof TC (1996). „Struktury, alternativní sestřih a neurexinová vazba více neuroliginů“. J. Biol. Chem. 271 (5): 2676–2682. doi:10.1074 / jbc.271.5.2676. PMID 8576240.
Hata Y, Butz S, Südhof TC (1996). „CASK: nový homolog dlg / PSD95 s N-koncovou kalmodulin-dependentní doménou protein kinázy identifikovanou interakcí s neurexiny“. J. Neurosci. 16 (8): 2488–94. doi:10.1523 / JNEUROSCI.16-08-02488.1996. PMC 6578772. PMID 8786425.
Kurschner C, Mermelstein PG, Holden WT, Surmeier DJ (1998). „CIPP, nový multivalentní protein domény PDZ, selektivně interaguje s členy rodiny Kir4.0, podjednotkami receptoru NMDA, neurexiny a neuroliginy“. Mol. Buňka. Neurosci. 11 (3): 161–172. doi:10,1006 / mcne.1998.0679. PMID 9647694. S2CID 36534759.
Hock B, Böhme B, Karn T a kol. (1998). „Interakce receptorové tyrosinkinázy EphB3 a proteinu AF6 vázajícího ras na zprostředkovanou doménu PDZ závisí na kinázové aktivitě receptoru“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (17): 9779–9784. doi:10.1073 / pnas.95.17.9779. PMC 21413. PMID 9707552.
Bergman L, Silins G, Grimmond S a kol. (1999). "Kosmidová konfigurace a přepisová mapa oblasti připravené na sekvenci 500 kb pro oblast MEN1 na 11q13". Genomika. 55 (1): 49–56. doi:10.1006 / geno.1998.5625. PMID 9888998.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
Rowen L, Young J, Birditt B a kol. (2002). „Analýza lidských neurexinových genů: alternativní sestřih a generování proteinové rozmanitosti“. Genomika. 79 (4): 587–597. doi:10.1006 / geno.2002.6734. PMID 11944992.
Tabuchi K, Südhof TC (2002). "Struktura a vývoj genů neurexinu: vhled do mechanismu alternativního sestřihu". Genomika. 79 (6): 849–859. doi:10.1006 / geno.2002.6780. PMID 12036300.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–1784. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Homma K, Kikuno RF, Nagase T a kol. (2004). "Alternativní sestřihové varianty kódující nestabilní proteinové domény existují v lidském mozku". J. Mol. Biol. 343 (5): 1207–1220. doi:10.1016 / j.jmb.2004.09.028. PMID 15491607.
Taylor TD, Noguchi H, Totoki Y a kol. (2006). „Sekvence DNA lidského chromozomu 11 a analýza včetně nové identifikace genu“. Příroda. 440 (7083): 497–500. doi:10.1038 / nature04632. PMID 16554811.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110076 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1621094-4] Ushkaryov YA, Petrenko AG, Geppert M, Sudhof TC (srpen 1992). „Neurexiny: synaptické buněčné povrchové proteiny související s alfa-latrotoxinovým receptorem a lamininem“. Věda. 257 (5066): 50–56. doi:10.1126 / science.1621094. PMID 1621094.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: NRXN2 neurexin 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]