NRXN1 - NRXN1
Neurexin-1-alfa je protein že u lidí je kódován NRXN1 gen.[5]
Neurexiny jsou rodinou proteinů, které fungují v nervovém systému obratlovců jako molekuly a receptory buněčné adheze. Jsou kódovány několika nespojenými geny, z nichž dva, NRXN1 a NRXN3, patří mezi největší známé lidské geny. Tři z genů (NRXN1-3) využívají dva alternativní promotory a zahrnují četné alternativně sestříhané exony ke generování tisíců odlišných mRNA transkriptů a proteinových izoforem. Většina transkriptů je produkována z upstream promotoru a kóduje izoformy alfa-neurexinu; mnohem menší počet transkriptů je produkován z následného promotoru a kóduje beta-neurexinové izoformy. Alfa-neurexiny obsahují sekvence podobné epidermálnímu růstovému faktoru (podobné EGF) a domény lamininu G a bylo prokázáno, že interagují s neurexofiliny. Beta-neurexiny postrádají sekvence podobné EGF a obsahují méně domén lamininu G než alfa-neurexiny.[5]
Funkce
Neurexiny jsou presynaptická membrána molekuly buněčné adheze které se váží primárně na neuroliginy proteiny, které byly spojeny s autismus. Autismus je charakterizován širokou škálou sociálních a kognitivních deficitů, které jsou částečně přičítány vadné synaptické komunikaci mezi neurony.[6] Tento nedostatek komunikace je často spojen s mutacemi v NRXN1. Strukturní varianty NRXN1a (neurexin1 alfa) jsou v souladu s mutacemi predisponujícími k autismu.[7] Tyto alfa neurexiny se účastní komunikace prostřednictvím vazebných mechanismů vápníkových kanálů a exocytózy vezikul, aby se zajistilo správné uvolnění neurotransmiterů. Jsou specificky potřebné pro uvolňování glutamátu a GABA.[8] Důsledky zapojení neurexinu do autismu byly stanoveny delecí v kódujících exonech NRXN1a, zejména u myších knockoutových modelů. Tyto myši vykazovaly zhoršené sociální fungování, sníženou motorickou reakci v nových situacích a zvýšené agresivní chování u mužů.[6] Sociální fungování byl pro tento gen a jeho spojení s poruchou autistického spektra.
Genomika
Gen se nachází v jedné kopii na krátkém rameni chromozomu 2 (2p16.3). Gen má délku 1112 187 bází, je umístěn na Crickově (minus) řetězci a kóduje protein s 1477 aminokyselinami (molekulová hmotnost 161 883 kDa).
Byly spojeny mutace tohoto genu, které přerušují jeho expresi schizofrenie, autismus a mentální postižení (Mutace NRXN1 a mozkové poruchy ).
Interakce
Bylo prokázáno, že NRXN1 komunikovat s NLGN1.[9][10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179915 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024109 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b „Entrez Gene: NRXN1 neurexin 1“.
- ^ A b Grayton H .; Missler M .; Collier D .; Fernandes C. (2013). „Změněné sociální chování u vyřazovacích myší s neuroxinem 1α připomíná klíčové příznaky u poruch neurového vývoje“. PLOS ONE. 8 (6): e67114. doi:10.1371 / journal.pone.0067114. PMC 3696036. PMID 23840597.
- ^ Yan J .; Noltner K .; Feng J .; Li W .; Schroer R .; Skinner C .; Zeng W .; Schwartz C.E .; Sommer S.S. (2008). "Neurexin 1alfa strukturální varianty spojené s autismem". Neurosci Lett. 438 (3): 368–70. doi:10.1016 / j.neulet.2008.04.074. PMID 18490107. S2CID 7520448.
- ^ Missler M .; Zhang W .; Rohlmann A .; Kattenstroth G .; Hammer R.E .; Gottmann K .; Sudhof T.C. (2003). „Alfa-neurexiny spojují kanály Ca2 + s exocytózou synaptických vezikul“. Příroda. 423 (6943): 939–948. doi:10.1038 / nature01755. PMID 12827191. S2CID 10315093.
- ^ Comoletti, Davide; Flynn Robyn; Jennings Lori L; Chubykin Alexander; Matsumura Takehito; Hasegawa Hana; Südhof Thomas C; Taylor Palmer (prosinec 2003). "Charakterizace interakce rekombinantního rozpustného neuroliginu-1 s neurexinem-1beta". J. Biol. Chem. Spojené státy. 278 (50): 50497–50505. doi:10,1074 / jbc.M306803200. ISSN 0021-9258. PMID 14522992.
- ^ Ichtchenko, K; Nguyen T; Südhof T C (únor 1996). „Struktury, alternativní sestřih a neurexinová vazba více neuroliginů“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 271 (5): 2676–2682. doi:10.1074 / jbc.271.5.2676. ISSN 0021-9258. PMID 8576240.
Další čtení
- Missler M, Südhof TC (1998). "Neurexiny: tři geny a 1001 produktů". Trendy Genet. 14 (1): 20–26. doi:10.1016 / S0168-9525 (97) 01324-3. PMID 9448462.
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
- Ushkaryov YA, Petrenko AG, Geppert M, Südhof TC (1992). „Neurexiny: synaptické buněčné povrchové proteiny související s alfa-latrotoxinovým receptorem a lamininem“. Věda. 257 (5066): 50–56. Bibcode:1992Sci ... 257 ... 50U. doi:10.1126 / science.1621094. PMID 1621094.
- Ichtchenko K, Nguyen T, Südhof TC (1996). „Struktury, alternativní sestřih a neurexinová vazba více neuroliginů“. J. Biol. Chem. 271 (5): 2676–2682. doi:10.1074 / jbc.271.5.2676. PMID 8576240.
- Petrenko AG, Ullrich B, Missler M a kol. (1996). "Struktura a vývoj neurexofilinu". J. Neurosci. 16 (14): 4360–9. doi:10.1523 / JNEUROSCI.16-14-04360.1996. PMC 6578849. PMID 8699246.
- Hata Y, Butz S, Südhof TC (1996). „CASK: nový homolog dlg / PSD95 s N-koncovou kalmodulin-dependentní doménou protein kinázy identifikovanou interakcí s neurexiny“. J. Neurosci. 16 (8): 2488–94. doi:10.1523 / JNEUROSCI.16-08-02488.1996. PMC 6578772. PMID 8786425.
- Perin MS (1996). "Zrcadlové obrazové motivy zprostředkovávají interakci COOH konce více synaptotagminů s neurexiny a kalmodulinem". Biochemie. 35 (43): 13808–13816. doi:10.1021 / bi960853x. PMID 8901523.
- Nguyen T, Südhof TC (1997). „Vazebné vlastnosti neuroliginu 1 a neurexinu 1 beta odhalují funkci jako heterofilní molekuly adheze buněk“. J. Biol. Chem. 272 (41): 26032–26039. doi:10.1074 / jbc.272.41.26032. PMID 9325340.
- Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N a kol. (1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (1): 31–39. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.
- Missler M, Hammer RE, Südhof TC (1999). „Vazba neurexofilinu na alfa-neurexiny. Jedna doména LNS funguje jako samostatně skládající se jednotka vázající ligand“. J. Biol. Chem. 273 (52): 34716–34723. doi:10.1074 / jbc.273.52.34716. PMID 9856994.
- Kleiderlein JJ, Nisson PE, Jessee J a kol. (1999). "CCG se opakuje v cDNA z lidského mozku". Hučení. Genet. 103 (6): 666–673. doi:10,1007 / s004390050889. PMID 9921901. S2CID 23696667.
- Biederer T, Südhof TC (2001). "Mincovny jako adaptéry. Přímá vazba na neurexiny a nábor munc18". J. Biol. Chem. 275 (51): 39803–39806. doi:10,1074 / jbc.C000656200. PMID 11036064.
- Koroll M, Rathjen FG, Volkmer H (2001). „Molekula neurofascinu pro rozpoznávání neurálních buněk interaguje se synteninem-1, ale ne se synteninem-2, přičemž obě tyto látky odhalují samoasociovací aktivitu.“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10646–10654. doi:10,1074 / jbc.M010647200. PMID 11152476.
- Fukuda M, Mikoshiba K (2001). "Charakterizace proteinu KIAA1427 jako atypického synaptotagminu (Syt XIII)". Biochem. J. 354 (Pt 2): 249–57. doi:10.1042/0264-6021:3540249. PMC 1221650. PMID 11171101.
- Fukuda M, Mikoshiba K (2001). „Protein podobný synaptotagminu 1-3: nová rodina tandemových proteinů C2 terminálního typu C2“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281 (5): 1226–1233. doi:10.1006 / bbrc.2001.4512. PMID 11243866.
- Rowen L, Young J, Birditt B a kol. (2002). „Analýza lidských neurexinových genů: alternativní sestřih a generování proteinové rozmanitosti“. Genomika. 79 (4): 587–597. doi:10.1006 / geno.2002.6734. PMID 11944992.
- Tabuchi K, Südhof TC (2002). "Struktura a vývoj genů neurexinu: vhled do mechanismu alternativního sestřihu". Genomika. 79 (6): 849–859. doi:10.1006 / geno.2002.6780. PMID 12036300.
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–1784. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P58400 (Neurexin-1-beta) na PDBe-KB.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |