NDUFB5 - NDUFB5
NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 5, 16 kDa je protein že u lidí je kódován NDUFB5 gen.[5] Protein NDUFB5 je podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon), který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[6]
Struktura
Gen NDUFB5 nacházející se na q rameni chromozom 3 na pozici 26,33 je dlouhý 19 713 párů bází. NDUFB5 protein váží 21,7 kDa a je složen ze 189 aminokyselin.[7][8] NDUFB5 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů. Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.[6] NDUFB5 je jednou z přibližně 31 hydrofobních podjednotek, které tvoří transmembránovou oblast komplexu I a je nekatalytickou podjednotkou komplexu. Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně.[5]
Funkce
Lidský gen NDUFB5 kóduje podjednotku Komplex I. z dýchací řetězec, který přenáší elektrony z NADH na ubichinon.[5] NDUFB5 je však doplňkovou podjednotkou komplexu, o které se předpokládá, že se nepodílí na katalýze.[9] Zpočátku, NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH2. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetickém rameni a nakonec na koenzym Q10 (CoQ), který je redukován na ubichinol (CoQH2). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který pumpuje čtyři vodíkové ionty z mitochondriální matrice.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136521 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027673 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C „Entrez Gene: NDUFB5 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 5, 16 kDa“.
- ^ A b C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ „NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 5“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
- ^ „NDUFB5 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 5“. UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Citováno 2. dubna 2015.