NDEL1 - NDEL1

NDEL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2V66
Identifikátory
Aliasy	NDEL1, EOPA, MITAP1, NDE1L1, NDE2, NUDEL, nudE neurodevelopment protein 1 jako 1
Externí ID	OMIM: 607538 MGI: 1932915 HomoloGene: 32567 Genové karty: NDEL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	8,490,411 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	68,871,858 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba alfa-tubulinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu; • aktivita oligopeptidázy; • vazba mikrotubulů; • identická vazba na protein; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné tělo; • kondenzovaný chromozomový kinetochor; • neurofilamentový cytoskelet; • jaderný obal; • synaptický váček; • vřeteno; • chromozóm; • organizační centrum mikrotubulů; • komplex spojený s mikrotubuly; • axon; • náběžná hrana buňky; • Axon Hillock; • mikrotubuly; • chromozom, centromerická oblast; • cytoskelet; • kinetochore; • axonová cytoplazma; • cytosol; • centrální oblast růstového kuželu; • centrosome; • kinesinový komplex;
Biologický proces	• retrográdní axonální transport; • diferenciace buněk; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 aktivace aktivity GTPázy; • segregace chromozomů; • migrace neuronů; • pozitivní regulace regenerace axonů; • vývoj nervového systému; • proteolýza; • rozšíření neuronové projekce; • proliferace buněk vnitřní hmoty; • vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace intracelulárního transportu proteinů; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • demontáž jaderného obalu; • pozitivní regulace prodloužení axonu; • organizace neurofilamentového cytoskeletu; • mozková kůra radiálně orientovaná migrace buněk; • vývoj neuronové projekce; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • axonogeneze neuronů centrálního nervového systému; • regulace aktivity mikrotubulů; • signální dráha inzulínového receptoru; • vytvoření orientace mitotického vřetena; • mikrotubulová nukleace; • separace mitotického centrosomu; • regulace vývoje neuronové projekce; • migrace buněk; • transport vezikul podél mikrotubulů; • stanovení lokalizace chromozomů; • lokalizace centrozomu; • lokalizace lysozomu; • pozitivní regulace sestavení volánku;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	81565
	83431
	ENSG00000166579
	ENSMUSG00000018736
	Q9GZM8
	Q9ERR1
	NM_001025579; NM_030808; NM_001330129
	NM_023668; NM_001363304; NM_001363305
	NP_001020750; NP_001317058; NP_110435
	NP_076157; NP_001350233; NP_001350234
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nukleární distribuce proteinu podobného nudE 1 je protein že u lidí je kódován NDEL1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje a thiol -aktivováno oligopeptidáza který je fosforylován v M fáze z buněčný cyklus. Fosforylace reguluje distribuci závislou na buněčném cyklu protein, přičemž část proteinu se silně váže na centrosomy v mezifáze a lokalizováno na mitotická vřetena v počáteční fázi M. Celkově tento protein hraje roli v nervový systém rozvoj. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

NDEL1 bylo prokázáno komunikovat s Cyklin-dependentní kináza 5,^[5] YWHAE,^[8] PAFAH1B1^[5]^[8] a DISC1.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166579 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018736 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Niethammer M, Smith DS, Ayala R, Peng J, Ko J, Lee MS, Morabito M, Tsai LH (prosinec 2000). „NUDEL je nový substrát Cdk5, který se asociuje s LIS1 a cytoplazmatickým dyneinem“. Neuron. 28 (3): 697–711. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 00147-1. PMID 11163260. S2CID 11154069.
^ Sasaki S, Shionoya A, Ishida M, Gambello MJ, Yingling J, Wynshaw-Boris A, Hirotsune S (prosinec 2000). "Komplex těžkého řetězce LIS1 / NUDEL / cytoplazmatický dynein ve vyvíjejícím se a nervovém systému dospělého". Neuron. 28 (3): 681–96. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 00146-X. PMID 11163259. S2CID 17738599.
^ ^A ^b „Entrezův gen: NDEL1 nudE gen pro jadernou distribuci E homolog (A. nidulans) podobný 1“.
^ ^A ^b Toyo-oka K, Shionoya A, Gambello MJ, Cardoso C, Leventer R, Ward HL, Ayala R, Tsai LH, Dobyns W, Ledbetter D, Hirotsune S, Wynshaw-Boris A (červenec 2003). „14-3-3epsilon je důležitý pro migraci neuronů navázáním na NUDEL: molekulární vysvětlení Miller-Diekerova syndromu“. Genetika přírody. 34 (3): 274–85. doi:10.1038 / ng1169. PMID 12796778. S2CID 10301633.
^ Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Lidská molekulární genetika. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
^ Ozeki Y, Tomoda T, Kleiderlein J, Kamiya A, Bord L, Fujii K, Okawa M, Yamada N, Hatten ME, Snyder SH, Ross CA, Sawa A (leden 2003). „Disrupted-in-Schizophrenia-1 (DISC-1): mutant truncation prevent binding to NudE-like (NUDEL) and inhibates neurit outgrowth“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (1): 289–94. Bibcode:2003PNAS..100..289O. doi:10.1073 / pnas.0136913100. PMC 140954. PMID 12506198.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (březen 2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.3491D. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Feng Y, Olson EC, Stukenberg PT, Flanagan LA, Kirschner MW, Walsh CA (prosinec 2000). „LIS1 reguluje laminaci CNS interakcí s mNudE, centrální složkou centrozomu“. Neuron. 28 (3): 665–79. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 00145-8. PMID 11163258. S2CID 15923472.
Ozeki Y, Tomoda T, Kleiderlein J, Kamiya A, Bord L, Fujii K, Okawa M, Yamada N, Hatten ME, Snyder SH, Ross CA, Sawa A (leden 2003). „Disrupted-in-Schizophrenia-1 (DISC-1): mutant truncation prevent binding to NudE-like (NUDEL) and inhibates neurit outgrowth“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (1): 289–94. Bibcode:2003PNAS..100..289O. doi:10.1073 / pnas.0136913100. PMC 140954. PMID 12506198.
Yan X, Li F, Liang Y, Shen Y, Zhao X, Huang Q, Zhu X (únor 2003). „Human Nudel and NudE as regulators of cytoplasmic dynein in poleward protein transport along the mitotic spindle“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (4): 1239–50. doi:10.1128 / MCB.23.4.1239-1250.2003. PMC 141156. PMID 12556484.
Cardoso C, Leventer RJ, Ward HL, Toyo-Oka K, Chung J, Gross A, Martin CL, Allanson J, Pilz DT, Olney AH, Mutchinick OM, Hirotsune S, Wynshaw-Boris A, Dobyns WB, Ledbetter DH (duben 2003). „Upřesnění kritické oblasti 400 kb umožňuje genotypovou diferenciaci mezi izolovanou lissencefalií, Miller-Diekerovým syndromem a dalšími fenotypy sekundárními k delecím 17p13.3“. American Journal of Human Genetics. 72 (4): 918–30. doi:10.1086/374320. PMC 1180354. PMID 12621583.
Toyo-oka K, Shionoya A, Gambello MJ, Cardoso C, Leventer R, Ward HL, Ayala R, Tsai LH, Dobyns W, Ledbetter D, Hirotsune S, Wynshaw-Boris A (červenec 2003). „14-3-3epsilon je důležitý pro migraci neuronů navázáním na NUDEL: molekulární vysvětlení Miller-Diekerova syndromu“. Genetika přírody. 34 (3): 274–85. doi:10.1038 / ng1169. PMID 12796778. S2CID 10301633.
Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Lidská molekulární genetika. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
Brandon NJ, Handford EJ, Schurov I, Rain JC, Pelling M, Duran-Jimeniz B, Camargo LM, Oliver KR, Beher D, Shearman MS, Whiting PJ (leden 2004). „Disrupted in Schizophrenia 1 and Nudel form a neurodevelopmentally regulovaný proteinový komplex: implikace pro schizofrenii a další významné neurologické poruchy“. Molekulární a buněčné neurovědy. 25 (1): 42–55. doi:10.1016 / j.mcn.2003.09.009. PMID 14962739. S2CID 21261573.
Liang Y, Yu W, Li Y, Yang Z, Yan X, Huang Q, Zhu X (únor 2004). „Nudel funguje v membránovém provozu hlavně prostřednictvím asociace s Lis1 a cytoplazmatickým dyneinem“. The Journal of Cell Biology. 164 (4): 557–66. doi:10.1083 / jcb.200308058. PMC 2171987. PMID 14970193.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Tarricone C, Perrina F, Monzani S, Massimiliano L, Kim MH, Derewenda ZS, Knapp S, Tsai LH, Musacchio A (prosinec 2004). „Vazba signalizace PAF na regulaci dyneinu: struktura LIS1 v komplexu s PAF-acetylhydrolázou“. Neuron. 44 (5): 809–21. doi:10.1016 / j.neuron.2004.11.019. PMID 15572112.
Hayashi MA, Portaro FC, Bastos MF, Guerreiro JR, Oliveira V, Gorrão SS, Tambourgi DV, Sant'Anna OA, Whiting PJ, Camargo LM, Konno K, Brandon NJ, Camargo AC (březen 2005). „Inhibice aktivity NUDEL (podobný jadernému distribučnímu prvku) -oligopeptidázy narušenou schizofrenií 1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (10): 3828–33. Bibcode:2005PNAS..102.3828H. doi:10.1073 / pnas.0500330102. PMC 553309. PMID 15728732.
Guerreiro JR, Winnischofer SM, Bastos MF, Portaro FC, Sogayar MC, de Camargo AC, Hayashi MA (červenec 2005). „Klonování a charakterizace humánních a králičích promotorů NUDEL-oligopeptidázy a jejich negativní regulace“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1730 (1): 77–84. doi:10.1016 / j.bbaexp.2005.06.001. PMID 16005531.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166579 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018736 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11163260-5] A ^b ^C Niethammer M, Smith DS, Ayala R, Peng J, Ko J, Lee MS, Morabito M, Tsai LH (prosinec 2000). „NUDEL je nový substrát Cdk5, který se asociuje s LIS1 a cytoplazmatickým dyneinem“. Neuron. 28 (3): 697–711. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 00147-1. PMID 11163260. S2CID 11154069.

[pmid11163259-6] Sasaki S, Shionoya A, Ishida M, Gambello MJ, Yingling J, Wynshaw-Boris A, Hirotsune S (prosinec 2000). "Komplex těžkého řetězce LIS1 / NUDEL / cytoplazmatický dynein ve vyvíjejícím se a nervovém systému dospělého". Neuron. 28 (3): 681–96. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 00146-X. PMID 11163259. S2CID 17738599.

[entrez-7] A ^b „Entrezův gen: NDEL1 nudE gen pro jadernou distribuci E homolog (A. nidulans) podobný 1“.

[pmid12796778-8] A ^b Toyo-oka K, Shionoya A, Gambello MJ, Cardoso C, Leventer R, Ward HL, Ayala R, Tsai LH, Dobyns W, Ledbetter D, Hirotsune S, Wynshaw-Boris A (červenec 2003). „14-3-3epsilon je důležitý pro migraci neuronů navázáním na NUDEL: molekulární vysvětlení Miller-Diekerova syndromu“. Genetika přírody. 34 (3): 274–85. doi:10.1038 / ng1169. PMID 12796778. S2CID 10301633.

[pmid12812986-9] Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Lidská molekulární genetika. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.

[pmid12506198-10] Ozeki Y, Tomoda T, Kleiderlein J, Kamiya A, Bord L, Fujii K, Okawa M, Yamada N, Hatten ME, Snyder SH, Ross CA, Sawa A (leden 2003). „Disrupted-in-Schizophrenia-1 (DISC-1): mutant truncation prevent binding to NudE-like (NUDEL) and inhibates neurit outgrowth“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (1): 289–94. Bibcode:2003PNAS..100..289O. doi:10.1073 / pnas.0136913100. PMC 140954. PMID 12506198.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]