NACA (gen) - NACA (gene)

NACA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3LKX, 3 MB, 3 mil
Identifikátory
Aliasy	NACA, NACA1, skNAC, HSD48, NAC-alfa, rodící se komplex alfa podjednotky související s rodícím se polypeptidem, rodící se komplex podjednotky spojené s polypeptidem
Externí ID	OMIM: 601234 MGI: 106095 HomoloGene: 136025 Genové karty: NACA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	56,731,628 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	128,048,637 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • vznikající komplex spojený s polypeptidem; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transport bílkovin; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do vývoje srdce; • regulace vývoje vláken kosterního svalstva; • vývoj srdeční komory; • morfogeneze srdeční trabekuly; • pozitivní regulace buněčné proliferace podílející se na morfogenezi srdce; • GO: virový proces 0022415; • regenerace tkáně kosterního svalstva; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II podílejícího se na vývoji srdce; • biosyntéza bílkovin; • pozitivní regulace růstu tkáně kosterního svalstva; • negativní regulace apoptotického procesu pruhovaných svalových buněk; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4666
	17938
	ENSG00000196531
	ENSMUSG00000061315
	Q13765
	P70670; Q60817
NM_001113201; NM_001113202; NM_001113203; NM_005594; NM_001320193;
	NM_001320194; NM_001365896
	NM_001113199; NM_001282976; NM_013608
NP_001106672; NP_001106673; NP_001106674; NP_001307122; NP_001307123;
	NP_005585; NP_001106672; NP_001106673; NP_001106674; NP_001307122; NP_001307123; NP_005585
	NP_001106670; NP_001269905; NP_038636; NP_001269905.1; NP_038636.2
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vznikající polypeptid asociovaný s polypeptidem alfa, také známý jako NACA, je protein který je u lidí kódován NACA gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

NACA brání krátkým nedávno syntetizovaným (tj. Rodícím se) ribozom - spojené polypeptidy z nevhodných interakcí s cytosolický bílkoviny. NACA váže rodící se polypeptidové domény vycházející z ribozomů, pokud neobsahuje a signální peptid který je plně vystaven. Vyčerpání NACA z ribozomů nesoucích rodící se polypeptidy umožňuje částice pro rozpoznávání signálu (SRP) k zesíťování na polypeptidy bez ohledu na to, zda obsahují signální peptidy či nikoli. Při absenci NACA mohou být proteiny bez signálních peptidů chybněpřemístěn do endoplazmatické retikulum.^[6]^[8]

NACA protein je exprimován v kostech během rozvoj a funguje jako transkripce koaktivátor ve spojení s kyselými aktivátory.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NACA komunikovat s BTF3, FADD,^[9] C-jun,^[10] a 3 členové taxilin rodina.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196531 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061315 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: NACA rodící se polypeptid asociovaný komplexní alfa polypeptid".
^ ^A ^b Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (srpen 1994). "Proteinový komplex potřebný pro třídění a translokaci specifické pro signální sekvenci". Příroda. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994 Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.
^ ^A ^b Yotov WV, St-Arnaud R (únor 1996). "Mapování lidského genu pro alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripční koaktivátor na chromozom 12q23-24.1". Mamm. Genom. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429. Archivovány od originál dne 16. 9. 2000.
^ Rospert S, Dubaquié Y, Gautschi M (říjen 2002). "Komplex spojený s rodícím se polypeptidem". Buňka. Mol. Life Sci. 59 (10): 1632–9. doi:10.1007 / PL00012490. PMID 12475173. S2CID 8874233.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}
^ Stilo R, Liguoro D, di Jeso B, Leonardi A, Vito P (duben 2003). „Alfa řetězec rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem se váže na a reguluje funkci FADD“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.
^ Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (březen 1998). „Kostně specifická exprese alfa řetězce rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem, koaktivátor potencující transkripci zprostředkovanou c-Jun“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.
^ Yoshida K, Nogami S, Satoh S, Tanaka-Nakadate S, Hiraishi H, Terano A, Shirataki H (květen 2005). „Interakce rodiny taxilinů s rodícím se komplexem spojeným s polypeptidem, který se účastní transkripčních a translačních procesů“. Geny buňky. 10 (5): 465–76. doi:10.1111 / j.1365-2443.2005.00848.x. PMID 15836775. S2CID 19426810.

Další čtení

Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (1994). "Proteinový komplex potřebný pro třídění a translokaci specifické pro signální sekvenci". Příroda. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994 Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Yotov WV, St-Arnaud R (1996). "Mapování lidského genu pro alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripční koaktivátor na chromozom 12q23-24.1". Mamm. Genom. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Yotov WV, Moreau A, St-Arnaud R (1998). „Alfa řetězec rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem funguje jako transkripční koaktivátor“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1303–11. doi:10.1128 / MCB.18.3.1303. PMC 108843. PMID 9488445.
Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (1998). „Kostně specifická exprese alfa řetězce rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem, koaktivátor potencující transkripci zprostředkovanou c-Jun“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.
Munz B, Wiedmann M, Lochmüller H, Werner S (1999). „Klonování nových genů regulovaných poškozením. Důsledky pro důležitou roli svalového proteinu skNAC při opravě svalů“. J. Biol. Chem. 274 (19): 13305–10. doi:10.1074 / jbc.274.19.13305. PMID 10224091.
Beatrix B, Sakai H, Wiedmann M (2001). „Alfa a beta podjednotka rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem má odlišné funkce“. J. Biol. Chem. 275 (48): 37838–45. doi:10,1074 / jbc.M006368200. PMID 10982809.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Sims RJ, Weihe EK, Zhu L a kol. (2002). „m-Bop, represorový protein nezbytný pro kardiogenezi, interaguje s skNAC, transkripčním faktorem specifickým pro srdce a sval“. J. Biol. Chem. 277 (29): 26524–9. doi:10,1074 / jbc.M204121200. PMID 12011100.
Kim SH, Shim KS, Lubec G (2002). "Komplex alfa podjednotky vznikajícího lidského mozku s polypeptidem je snížen u pacientů s Alzheimerovou chorobou a Downovým syndromem". J. Investig. Med. 50 (4): 293–301. doi:10.2310/6650.2002.33287. PMID 12109594.
Behrends U, Jandl T, Golbeck A a kol. (2002). „Nové produkty genů HUD, HUC, NNP-1 a alfa-internexinu identifikované autologním screeningem protilátek v knihovně pediatrických neuroblastomů“. Int. J. Cancer. 100 (6): 669–77. doi:10.1002 / ijc.10550. PMID 12209604. S2CID 35369661.
Mossabeb R, Seiberler S, Mittermann I a kol. (2002). "Charakterizace nové izoformy komplexu spojeného s alfa-rodícím se polypeptidem jako IgE-definovaného autoantigenu". J. Invest. Dermatol. 119 (4): 820–9. doi:10.1046 / j.1523-1747.2002.00518.x. PMID 12406326.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Stilo R, Liguoro D, di Jeso B a kol. (2003). "Alfa řetězec rodícího se komplexu asociovaného s polypeptidem se váže a reguluje funkci FADD". Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.
Papachristou DJ, Batistatou A, Sykiotis GP a kol. (2003). „Aktivace dráhy přenosu signálu JNK-AP-1 je spojena s patogenezí a progresí lidských osteosarkomů.“ Kost. 32 (4): 364–71. doi:10.1016 / S8756-3282 (03) 00026-7. PMID 12689679.
Hämmerle K, Shayan P, Niemeyer CM, Flotho C (2003). „Expresní analýza alfa-NAC a ANX2 u juvenilní myelomonocytické leukémie pomocí SMART polymerázové řetězové reakce a„ virtuální severní “hybridizace. Genetika rakoviny. Cytogenet. 142 (2): 149–52. doi:10.1016 / S0165-4608 (02) 00841-5. PMID 12699894.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Al-Shanti N, Steward CG, Garland RJ, Rowbottom AW (2004). „Vyšetřování komplexu alfa-vznikajícího polypeptidu asociovaného s komplexním ex vivo expanzním modelem lidské CD8 (+) T buňky s použitím antisense oligonukleotidů“. Imunologie. 112 (3): 397–403. doi:10.1111 / j.1365-2567.2004.01893.x. PMC 1782496. PMID 15196207.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196531 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061315 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: NACA rodící se polypeptid asociovaný komplexní alfa polypeptid".

[pmid8047162-6] A ^b Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (srpen 1994). "Proteinový komplex potřebný pro třídění a translokaci specifické pro signální sekvenci". Příroda. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994 Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.

[pmid8835540-7] A ^b Yotov WV, St-Arnaud R (únor 1996). "Mapování lidského genu pro alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripční koaktivátor na chromozom 12q23-24.1". Mamm. Genom. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429. Archivovány od originál dne 16. 9. 2000.

[pmid12475173-8] Rospert S, Dubaquié Y, Gautschi M (říjen 2002). "Komplex spojený s rodícím se polypeptidem". Buňka. Mol. Life Sci. 59 (10): 1632–9. doi:10.1007 / PL00012490. PMID 12475173. S2CID 8874233.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}

[pmid12684039-9] Stilo R, Liguoro D, di Jeso B, Leonardi A, Vito P (duben 2003). „Alfa řetězec rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem se váže na a reguluje funkci FADD“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.

[pmid9488446-10] Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (březen 1998). „Kostně specifická exprese alfa řetězce rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem, koaktivátor potencující transkripci zprostředkovanou c-Jun“. Mol. Buňka. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.

[pmid15836775-11] Yoshida K, Nogami S, Satoh S, Tanaka-Nakadate S, Hiraishi H, Terano A, Shirataki H (květen 2005). „Interakce rodiny taxilinů s rodícím se komplexem spojeným s polypeptidem, který se účastní transkripčních a translačních procesů“. Geny buňky. 10 (5): 465–76. doi:10.1111 / j.1365-2443.2005.00848.x. PMID 15836775. S2CID 19426810.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]