NAB2 - NAB2 - Wikipedia

NAB2
Identifikátory
Aliasy	NAB2, MADER, protein vázající NGFI-A 2
Externí ID	OMIM: 602381 MGI: 107563 HomoloGene: 4353 Genové karty: NAB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	57,095,476 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	127,668,568 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• transkripční faktor vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • identická vazba na protein; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• Diferenciace Schwannových buněk; • myelinizace; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • buněčná proliferace; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • endochondrální osifikace; • regulace vývoje epidermis; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • pozitivní regulace aktivity tau-protein kinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4665
	17937
	ENSG00000166886
	ENSMUSG00000025402
	Q15742
	Q61127
	NM_005967; NM_001330305
	NM_001122895; NM_008668
	NP_001317234; NP_005958
	NP_001116367; NP_032694
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající NGFI-A 2 také známý jako Protein vázající EGR-1 2 nebo protein zpožděné časné odpovědi související s melanomem (MADER) je a protein že u lidí je kódován NAB2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů vázajících NGFI-A (NAB), které v jádře fungují tak, že potlačují nebo aktivují transkripce vyvolané některými členy EGR (časná reakce na růst) rodina transaktivátory. NAB proteiny mohou homo- nebo hetero-multimerizovat s jinými proteiny EGR nebo NAB prostřednictvím konzervované N-terminální domény a potlačovat transkripci prostřednictvím dvou částečně redundantních C-terminálních domén. Transkripční represe kódovaným proteinem je částečně zprostředkována interakcemi s nukleosom komplex remodelace a deaktylázy (NuRD). Alternativně sestřih byly popsány varianty transkriptu, ale jejich biologická platnost nebyla stanovena.^[7]

Patologie

Opakované somatické fúze dvou genů, NGFI-A – vazebného proteinu 2 (NAB2) a STAT6, lokalizované v chromozomální oblasti 12q13, byly identifikovány v solitární vláknité nádory.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166886 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025402 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Svaren J, Sevetson BR, Apel ED, Zimonjic DB, Popescu NC, Milbrandt J. (srpen 1996). „NAB2, základní represor NGFI-A (Egr-1) a Krox20, je indukován proliferativními a diferenciačními podněty“. Mol Cell Biol. 16 (7): 3545–53. doi:10.1128 / MCB.16.7.3545. PMC 231349. PMID 8668170.
^ Kirsch KH, Korradi Y, Johnson JP (červenec 1996). „Mader: nový jaderný protein nadměrně exprimovaný v lidských melanomech“. Onkogen. 12 (5): 963–71. PMID 8649813.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NAB2 NGFI-A binding protein 2 (EGR1 binding protein 2)“.
^ Kabbinavar, F. F .; Hambleton, J; Mass, R. D .; Hurwitz, H. I .; Bergsland, E; Sarkar, S (2005). „Kombinovaná analýza účinnosti: Přidání bevacizumabu k fluorouracilu / leucovorinu zlepšuje přežití u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem.“ Journal of Clinical Oncology. 23 (16): 3706–12. doi:10.1200 / JCO.2005.00.232. PMID 15867200.

Další čtení

Svaren J, Apel ED, Simburger KS a kol. (1997). "Geny Nab2 a Stat6 sdílejí společnou oblast terminace transkripce". Genomika. 41 (1): 33–9. doi:10.1006 / geno.1997.4609. PMID 9126479.
Qu Z, Wolfraim LA, Svaren J a kol. (1998). „Transkripční corepresor NAB2 inhibuje diferenciaci buněk PC12 vyvolanou NGF“. J. Cell Biol. 142 (4): 1075–82. doi:10.1083 / jcb.142.4.1075. PMC 2132876. PMID 9722618.
Svaren J, Sevetson BR, Golda T a kol. (1998). „Nové mutanty NAB korepresorů zvyšují aktivaci Egr transaktivátory“. EMBO J.. 17 (20): 6010–9. doi:10.1093 / emboj / 17.20.6010. PMC 1170927. PMID 9774344.
Abdulkadir SA, Qu Z, Garabedian E a kol. (2001). "Porucha tumorigeneze prostaty u myší s deficitem Egr1". Nat. Med. 7 (1): 101–7. doi:10.1038/83231. PMID 11135623. S2CID 7191051.
Abdulkadir SA, Carbone JM, Naughton CK a kol. (2001). "Častá a časná ztráta koronorpresoru EGR1 NAB2 u lidského karcinomu prostaty". Hučení. Pathol. 32 (9): 935–9. doi:10.1053 / hupa.2001.27102. PMID 11567222.
Venken K, Di Maria E, Bellone E a kol. (2003). "Hledání mutací v EGR2 korepresorových proteinech, NAB1 a NAB2, v lidských periferních neuropatiích". Neurogenetika. 4 (1): 37–41. doi:10.1007 / s10048-001-0124-2. PMID 12030330. S2CID 1928229.
Lucerna M, Mechtcheriakova D, Kadl A a kol. (2003). „NAB2, korepresor EGR-1, inhibuje indukci genu zprostředkovanou vaskulárním endoteliálním růstovým faktorem a angiogenní odpovědi endoteliálních buněk“. J. Biol. Chem. 278 (13): 11433–40. doi:10,1074 / jbc.M204937200. PMID 12427750.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kumbrink J, Gerlinger M, Johnson JP (2005). „Egr-1 indukuje expresi svého corepressoru nab2 aktivací promotoru nab2, čímž vytváří smyčku negativní zpětné vazby“. J. Biol. Chem. 280 (52): 42785–93. doi:10,1074 / jbc.M511079200. PMID 16260776.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Srinivasan R, Mager GM, Ward RM a kol. (2006). „NAB2 potlačuje transkripci interakcí s podjednotkou CHD4 komplexu remodelace nukleosomů a deacetylázy (NuRD)“. J. Biol. Chem. 281 (22): 15129–37. doi:10,1074 / jbc.M600775200. PMID 16574654.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166886 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025402 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8668170-5] Svaren J, Sevetson BR, Apel ED, Zimonjic DB, Popescu NC, Milbrandt J. (srpen 1996). „NAB2, základní represor NGFI-A (Egr-1) a Krox20, je indukován proliferativními a diferenciačními podněty“. Mol Cell Biol. 16 (7): 3545–53. doi:10.1128 / MCB.16.7.3545. PMC 231349. PMID 8668170.

[pmid8649813-6] Kirsch KH, Korradi Y, Johnson JP (červenec 1996). „Mader: nový jaderný protein nadměrně exprimovaný v lidských melanomech“. Onkogen. 12 (5): 963–71. PMID 8649813.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: NAB2 NGFI-A binding protein 2 (EGR1 binding protein 2)“.

[8] Kabbinavar, F. F .; Hambleton, J; Mass, R. D .; Hurwitz, H. I .; Bergsland, E; Sarkar, S (2005). „Kombinovaná analýza účinnosti: Přidání bevacizumabu k fluorouracilu / leucovorinu zlepšuje přežití u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem.“ Journal of Clinical Oncology. 23 (16): 3706–12. doi:10.1200 / JCO.2005.00.232. PMID 15867200.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]