Interaktor N-myc - N-myc-interactor

NMI
Identifikátory
Aliasy	NMI, N-myc a STAT interagující
Externí ID	OMIM: 603525 MGI: 1928368 HomoloGene: 3441 Genové karty: NMI
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	151,289,894 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	51,973,494 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • pozitivní regulace ubikvitinace spojené s proteinem K48; • Kaskáda JAK-STAT; • negativní regulace produkce interferonu typu I.; • zánětlivá reakce; • negativní regulace vrozené imunitní odpovědi;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9111
	64685
	ENSG00000123609
	ENSMUSG00000026946
	Q13287
	O35309
	NM_004688
	NM_001141948; NM_001141949; NM_019401
	NP_004679
	NP_001135420; NP_001135421; NP_062274
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interaktor N-myc také známý jako Interakce N-myc a STAT je protein že u lidí je kódován NMI gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Interaktor NMYC (NMI) interaguje s NMYC a CMYC (dva členové onkogenu Moje C rodina) a další transkripční faktory obsahující a Zip, HLH nebo HLH-Zip motiv. NMI protein také interaguje se všemi STATY až na STAT2 a zvyšuje STAT zprostředkovanou transkripci v reakci na cytokiny IL-2 a IFN-gama. NMI mRNA má nízkou hladinu exprese ve všech testovaných lidských fetálních a dospělých tkáních kromě mozku a má vysokou expresi v linii rakovinných buněkmyeloidní leukémie.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že NMI (gen) komunikovat s BRCA1,^[8] IFI35,^[9] Moje C,^[8] a STAT5A,^[6] a TUBA3C.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123609 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026946 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bao J, Zervos AS (srpen 1996). "Izolace a charakterizace Nmi, nového partnera proteinů Myc". Onkogen. 12 (10): 2171–6. PMID 8668343.
^ ^A ^b Zhu M, John S, Berg M, Leonard WJ (březen 1999). "Funkční asociace Nmi se Stat5 a Stat1 v IL-2 a IFNgamma zprostředkované signalizaci". Buňka. 96 (1): 121–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80965-4. PMID 9989503. S2CID 14758136.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NMI N-myc (and STAT) interaktor“.
^ ^A ^b Li H, Lee TH, Avraham H (červen 2002). „Nový trikomplex BRCA1, Nmi a c-Myc inhibuje aktivitu promotoru genu lidské telomerasové genu pro reverzní transkriptázu (hTERT) indukovanou c-Myc u rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20965–73. doi:10,1074 / jbc.M112231200. PMID 11916966.
^ Chen J, Shpall RL, Meyerdierks A, Hagemeier M, Böttger EC, Naumovski L (listopad 2000). „Interferonem indukovatelný protein Nmi interagující s Myc / STAT se asociuje s IFP 35 do komplexu s vysokou molekulovou hmotností a inhibuje proteazomem zprostředkovanou degradaci IFP 35“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36278–84. doi:10,1074 / jbc.M006975200. PMID 10950963.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

Lebrun SJ, Shpall RL, Naumovski L (1998). "Interferonem indukovaná upregulace a cytoplazmatická lokalizace proteinu Nmi interagujícího s Myc". J. Interferon Cytokine Res. 18 (9): 767–71. doi:10.1089 / jir.1998.18.767. PMID 9781816.
Lee ND, Chen J, Shpall RL, Naumovski L (1999). „Subcelulární lokalizace interferonem indukovatelného proteinu Nmi interagujícího s Myc / stat je regulována novou homologní doménou IFP 35“. J. Interferon Cytokine Res. 19 (11): 1245–52. doi:10.1089/107999099312902. PMID 10574616.
Bannasch D, Weis I, Schwab M (2000). „Nmi protein interaguje s oblastmi, které se liší mezi MycN a Myc a je lokalizován v cytoplazmě neuroblastomových buněk na rozdíl od jaderného MycN“. Onkogen. 18 (48): 6810–7. doi:10.1038 / sj.onc.1203090. PMID 10597290.
Zhou X, Liao J, Meyerdierks A, et al. (2000). „Interferon-alfa indukuje tvorbu heterodimerního komplexu nmi-IFP35, který je ovlivněn fosforylací IFP35“. J. Biol. Chem. 275 (28): 21364–71. doi:10,1074 / jbc.M003177200. PMID 10779520.
Chen J, Shpall RL, Meyerdierks A, et al. (2000). „Interferonem indukovatelný protein Nmi interagující s Myc / STAT se asociuje s IFP 35 do komplexu s vysokou molekulovou hmotností a inhibuje proteazomem zprostředkovanou degradaci IFP 35“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36278–84. doi:10,1074 / jbc.M006975200. PMID 10950963.
Chen J, Naumovski L (2002). „Intracelulární redistribuce interferonem indukovatelných proteinů Nmi a IFP 35 v apoptotických buňkách“. J. Interferon Cytokine Res. 22 (2): 237–43. doi:10.1089/107999002753536211. PMID 11911807.
Li H, Lee TH, Avraham H (2002). „Nový trikomplex BRCA1, Nmi a c-Myc inhibuje aktivitu promotoru genu lidské telomerasové genu pro reverzní transkriptázu (hTERT) indukovanou c-Myc u rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20965–73. doi:10,1074 / jbc.M112231200. PMID 11916966.
Sun GJ, Tong X, Dong Y a kol. (2002). "[Identifikace proteinu interagujícího s apoptinem z knihovny cDNA lidských leukocytů pomocí kvasinkového dvouhybridního screeningu]". Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao. 34 (3): 369–72. PMID 12019454.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Jung HH, Lee J, Kim JH a kol. (2005). „STAT1 a Nmi jsou downstream cíle transkripčního faktoru Ets-1 v buňce lidské rakoviny prsu MCF-7“. FEBS Lett. 579 (18): 3941–6. doi:10.1016 / j.febslet.2005.06.011. PMID 15996661. S2CID 23206849.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Schlierf B, Lang S, Kosian T a kol. (2005). „Transkripční faktor skupiny s vysokou mobilitou Sox10 interaguje s proteinem Nmi interagujícím s N-myc“. J. Mol. Biol. 353 (5): 1033–42. doi:10.1016 / j.jmb.2005.09.013. PMID 16214168.
Zhang L, Tang Y, Tie Y a kol. (2007). „Protein CKIP-1 obsahující doménu PH se váže na IFP35 a Nmi a podílí se na cytokinové signalizaci.“ Buňka. Signál. 19 (5): 932–44. doi:10.1016 / j.cellsig.2006.11.002. PMID 17197158.
Albihn A, Mo H, Yang Y, Henriksson M (2007). „Apoptóza vyvolaná kamptothecinem je zvýšena pomocí Myc a zahrnuje signalizaci PKCdelta“. Int. J. Cancer. 121 (8): 1821–9. doi:10.1002 / ijc.22866. PMID 17565738. S2CID 22194144.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123609 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026946 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8668343-5] Bao J, Zervos AS (srpen 1996). "Izolace a charakterizace Nmi, nového partnera proteinů Myc". Onkogen. 12 (10): 2171–6. PMID 8668343.

[pmid9989503-6] A ^b Zhu M, John S, Berg M, Leonard WJ (březen 1999). "Funkční asociace Nmi se Stat5 a Stat1 v IL-2 a IFNgamma zprostředkované signalizaci". Buňka. 96 (1): 121–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80965-4. PMID 9989503. S2CID 14758136.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: NMI N-myc (and STAT) interaktor“.

[pmid11916966-8] A ^b Li H, Lee TH, Avraham H (červen 2002). „Nový trikomplex BRCA1, Nmi a c-Myc inhibuje aktivitu promotoru genu lidské telomerasové genu pro reverzní transkriptázu (hTERT) indukovanou c-Myc u rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20965–73. doi:10,1074 / jbc.M112231200. PMID 11916966.

[pmid10950963-9] Chen J, Shpall RL, Meyerdierks A, Hagemeier M, Böttger EC, Naumovski L (listopad 2000). „Interferonem indukovatelný protein Nmi interagující s Myc / STAT se asociuje s IFP 35 do komplexu s vysokou molekulovou hmotností a inhibuje proteazomem zprostředkovanou degradaci IFP 35“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36278–84. doi:10,1074 / jbc.M006975200. PMID 10950963.

[pmid16189514-10] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]