Multisynthetase komplexní pomocná složka p38 - Multisynthetase complex auxiliary component p38

AIMP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4DPG, 4YCU, 4YCW, 5A34, 5A1N, 5A5H
Identifikátory
Aliasy	AIMP2, JTV-1, JTV1, P38, PRO0992, Multisynthetase komplex pomocná složka p38, aminoacyl tRNA syntetáza komplex interagující multifunkční protein 2, HLD17
Externí ID	OMIM: 600859 MGI: 2385237 HomoloGene: 4594 Genové karty: AIMP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	6,023,834 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	143,909,847 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita molekulárního adaptéru 0032947;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána; • buněčné jádro; • cytosol; • multienzymový komplex aminoacyl-tRNA syntetázy;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk; • Diferenciace pneumocytů typu II; • pozitivní regulace neuronové smrti; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • Aminoacylace tRNA pro translaci proteinu; • biosyntéza bílkovin; • negativní regulace buněčné proliferace; • apoptotický proces; • pozitivní regulace aktivity aminoacyl-tRNA ligázy; • sestava makromolekulárního komplexu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7965
	231872
	ENSG00000106305
	ENSMUSG00000029610
	Q13155
	Q8R010
NM_006303; NM_001326606; NM_001326607; NM_001326609; NM_001326611;
	NM_018570; NM_001326610; NM_001362785; NM_001362787
	NM_001172146; NM_146165
NP_001313535; NP_001313536; NP_001313538; NP_001313539; NP_001313540;
	NP_006294; NP_001349714; NP_001349716
	NP_001165617; NP_666277
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Multifunkční protein interagující s komplexem aminoacyl tRNA syntetáza 2 je enzym že u lidí je kódován AIMP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Gen JTV1 je lokalizován na chromozomu 7p22 ohraničeném dvěma geny, HRI a PMS2. JTV1 a HRI se mírně překrývají a jsou uspořádány způsobem „od ocasu“. JTV1 a PMS2 jsou odděleny přibližně 200 páry bází a jsou uspořádány head-to-head. JTV1 se přepisuje v opačném směru ve srovnání s HRI a PMS2. Funkce produktu genu JTV1 není známa.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že pomocná složka p38 s multisyntetázovým komplexem komunikovat s Parkin (ligáza),^[8] P53^[6] a KARS.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106305 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029610 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nicolaides NC, Kinzler KW, Vogelstein B (září 1995). „Analýza 5 'oblasti PMS2 odhaluje heterogenní transkripty a nový překrývající se gen“. Genomika. 29 (2): 329–34. doi:10.1006 / geno.1995.9997. PMID 8666379.
^ ^A ^b Han JM, Park BJ, Park SG, Oh YS, Choi SJ, Lee SW, Hwang SK, Chang SH, Cho MH, Kim S (srpen 2008). „AIMP2 / p38, kostra komplexu multi-tRNA syntetázy, reaguje na genotoxické stresy prostřednictvím p53“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (32): 11206–11. Bibcode:2008PNAS..10511206H. doi:10.1073 / pnas.0800297105. PMC 2516205. PMID 18695251.
^ ^A ^b „Entrez Gene: JTV1 gen JTV1“.
^ Corti O, Hampe C, Koutnikova H, Darios F, Jacquier S, Prigent A, Robinson JC, Pradier L, Ruberg M, Mirande M, Hirsch E, Rooney T, Fournier A, Brice A (červen 2003). „Podjednotka p38 komplexu aminoacyl-tRNA syntetáza je substrát Parkin: spojuje biosyntézu proteinů a neurodegeneraci.“. Lidská molekulární genetika. 12 (12): 1427–37. doi:10,1093 / hmg / ddg159. PMID 12783850.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (leden 1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. Journal of Molecular Biology. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.

Další čtení

Park SG, Ewalt KL, Kim S (říjen 2005). „Funkční expanze aminoacyl-tRNA syntetáz a jejich interakčních faktorů: nové pohledy na hospodyně“. Trendy v biochemických vědách. 30 (10): 569–74. doi:10.1016 / j.tibs.2005.08.004. PMID 16125937.
Raszewski W (1978). "Ochranné působení řady nových mono-pyridiniových solí a jejich účinek na" stárnutí "acetylcholinesterázy inhibované fluostigminem." Polský žurnál farmakologie a farmacie. 29 (6): 603–7. PMID 600859.
Norcum MT (srpen 1991). „Strukturní analýza komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy s vysokou molekulovou hmotností. Účinky neutrálních solí a detergentů“. The Journal of Biological Chemistry. 266 (23): 15398–405. PMID 1651330.
Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (leden 1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. Journal of Molecular Biology. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.
Kang J, Kim T, Ko YG, Rho SB, Park SG, Kim MJ, Kwon HJ, Kim S (říjen 2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. PMID 10913161.
Ahn HC, Kim S, Lee BJ (květen 2003). "Struktura řešení a vazba p43 motivu zipu leucinového p38: interakce mezi cívkou a cívkou zprostředkovávají asociaci mezi p38 a p43". FEBS Dopisy. 542 (1–3): 119–24. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00362-4. PMID 12729910. S2CID 39222196.
Corti O, Hampe C, Koutnikova H, Darios F, Jacquier S, Prigent A, Robinson JC, Pradier L, Ruberg M, Mirande M, Hirsch E, Rooney T, Fournier A, Brice A (červen 2003). „Podjednotka p38 komplexu aminoacyl-tRNA syntetáza je substrát Parkin: spojuje biosyntézu proteinů a neurodegeneraci.“. Lidská molekulární genetika. 12 (12): 1427–37. doi:10,1093 / hmg / ddg159. PMID 12783850.
Kim MJ, Park BJ, Kang YS, Kim HJ, Park JH, Kang JW, Lee SW, Han JM, Lee HW, Kim S (červenec 2003). „K diferenciaci plicních buněk je nutná downregulace proteinu vázajícího FUSE a c-myc kofaktorem t38NA tRNA syntetázy p38.“ Genetika přírody. 34 (3): 330–6. doi:10.1038 / ng1182. PMID 12819782. S2CID 41006480.
Sampath P, Mazumder B, Seshadri V, Gerber CA, Chavatte L, Kinter M, Ting SM, Dignam JD, Kim S, Driscoll DM, Fox PL (říjen 2004). "Nekanonická funkce glutamyl-prolyl-tRNA syntetázy: genově specifické umlčení translace". Buňka. 119 (2): 195–208. doi:10.1016 / j.cell.2004.09.030. PMID 15479637. S2CID 18944876.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106305 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029610 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8666379-5] Nicolaides NC, Kinzler KW, Vogelstein B (září 1995). „Analýza 5 'oblasti PMS2 odhaluje heterogenní transkripty a nový překrývající se gen“. Genomika. 29 (2): 329–34. doi:10.1006 / geno.1995.9997. PMID 8666379.

[pmid18695251-6] A ^b Han JM, Park BJ, Park SG, Oh YS, Choi SJ, Lee SW, Hwang SK, Chang SH, Cho MH, Kim S (srpen 2008). „AIMP2 / p38, kostra komplexu multi-tRNA syntetázy, reaguje na genotoxické stresy prostřednictvím p53“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (32): 11206–11. Bibcode:2008PNAS..10511206H. doi:10.1073 / pnas.0800297105. PMC 2516205. PMID 18695251.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: JTV1 gen JTV1“.

[pmid12783850-8] Corti O, Hampe C, Koutnikova H, Darios F, Jacquier S, Prigent A, Robinson JC, Pradier L, Ruberg M, Mirande M, Hirsch E, Rooney T, Fournier A, Brice A (červen 2003). „Podjednotka p38 komplexu aminoacyl-tRNA syntetáza je substrát Parkin: spojuje biosyntézu proteinů a neurodegeneraci.“. Lidská molekulární genetika. 12 (12): 1427–37. doi:10,1093 / hmg / ddg159. PMID 12783850.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid9878398-10] Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (leden 1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. Journal of Molecular Biology. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]