MtDNA kontrolní oblast - mtDNA control region - Wikipedia

Sekundární struktura regulační oblasti mitochondriální DNA A
MtDNA control SS.png
Konsenzus sekundární struktura pro všechny haplotypy kontrolní oblasti mtDNA.
Identifikátory
SymbolmtDNA ssA
RfamRF01853
Další údaje
RNA typAntisense RNA
DoményMammalia
PDB strukturPDBe

Umístění kontrolní oblasti (CR) v lidském mitochondriálním genomu (šedý rámeček) se třemi hypervariabilními oblastmi (HV: zelené rámečky).

The mtDNA kontrolní oblast je oblast mitochondriální genom který je nekódující DNA. Tato oblast řídí syntézu RNA a DNA.[1] To je nejvíce polymorfní oblast lidského genomu mtDNA,[2] s polymorfismem koncentrovaným v hypervariabilní oblasti. Průměrný rozmanitost nukleotidů v těchto regionech je 1,7%.[3] Přes tuto variabilitu, an RNA přepis z této oblasti je zachován sekundární struktura (na obrázku), o kterém bylo zjištěno, že je pod selektivní tlak.[4]

Kontrolní oblast mtDNA obsahuje původ replikace jednoho vlákna a původ transkripce pro oba prameny.[5] K dispozici je také otevřený čtecí rámec myšlenka na kód na 7 s ribozomální RNA v lidé ale ne u myší nebo krav, kde to bylo smazáno.[6]

Rozlišení od D-smyčky

Kontrolní oblast a mtDNA D-smyčka jsou někdy v literatuře používány jako synonyma;[3] konkrétně kontrolní oblast zahrnuje D-smyčku spolu se sousední transkripcí promotor regiony. Z tohoto důvodu je kontrolní oblast známa také pod akronym DLP, stojící za D-Loop a související Promoters.[7]

Studie vytrvalosti

mtDNA kontrolní oblast haplotypy byly spojeny s vytrvalost kapacita u lidských subjektů.[8] Studie z roku 2002 seřazeno kontrolní oblast 55 subjektů a porovnal jejich haplotyp s nárůstem VO2 max po osmi týdnech tréninkový program. Zjistili, že různé haplotypy jsou výrazně spojené s vytrvalostí subjektů. Spekulovalo se, že to bylo proto, že kontrolní oblast ovlivňuje replikaci a transkripci v mitochondriích.[4][8]

Viz také

Reference

  1. ^ Struktura mitochondriálního genomu DNA Learning Center, Cold Spring Harbor Laboratory
  2. ^ Stoneking M, Hedgecock D, Higuchi RG, Vigilant L, Erlich HA (únor 1991). „Populační variace sekvencí lidské oblasti mtDNA detekovaných enzymatickou amplifikací a sekvenčně specifickými oligonukleotidovými sondami“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 48 (2): 370–82. PMC  1683035. PMID  1990843.
  3. ^ A b Aquadro CF, Greenberg BD (únor 1983). „Variace a vývoj lidské mitochondriální DNA: Analýza nukleotidových sekvencí od sedmi jedinců“. Genetika. 103 (2): 287–312. PMC  1219980. PMID  6299878. Citováno 2010-07-29.
  4. ^ A b Pereira F, Soares P, Carneiro J a kol. (Prosinec 2008). „Důkazy o variabilních selektivních tlacích na velkou sekundární strukturu kontrolní oblasti lidské mitochondriální DNA“. Mol. Biol. Evol. 25 (12): 2759–70. doi:10,1093 / molbev / msn225. PMID  18845547. Citováno 2010-07-28.
  5. ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG a kol. (Duben 1981). "Pořadí a organizace lidského mitochondriálního genomu". Příroda. 290 (5806): 457–65. doi:10.1038 / 290457a0. PMID  7219534.
  6. ^ Ojala D, Montoya J, Attardi G (duben 1981). "interpunkční model tRNA zpracování RNA v lidských mitochondriích". Příroda. 290 (5806): 470–4. doi:10.1038 / 290470a0. PMID  7219536.
  7. ^ Michikawa Y, Mazzucchelli F, Bresolin N, Scarlato G, Attardi G (říjen 1999). "Stárnutí závislá velká akumulace bodových mutací v lidské mtDNA kontrolní oblasti pro replikaci". Věda. 286 (5440): 774–9. doi:10.1126 / science.286.5440.774. PMID  10531063.
  8. ^ A b Murakami H, Ota A, Simojo H, Okada M, Ajisaka R, Kuno S (červen 2002). „Polymorfismy v kontrolní oblasti mtDNA souvisí s individuálními rozdíly ve vytrvalostní kapacitě nebo trénovatelnosti“. Jpn. J. Physiol. 52 (3): 247–56. doi:10,2170 / jjphysiol.52.247. PMID  12230801.

Další čtení

externí odkazy