ManA RNA motiv - ManA RNA motif - Wikipedia
| manA RNA | |
|---|---|
 Konsensuální sekundární struktura manA RNA | |
| Identifikátory | |
| Symbol | manA RNA |
| Rfam | RF01745 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Cis-regulační prvek |
| Domény | Photobacterium |
| PDB struktur | PDBe |
The manA RNA motiv (také zvaný manA) odkazuje na konzervovaný RNA struktura, která byla identifikována pomocí bioinformatika.[1][2] Instance manA RNA motiv byl detekován v bakterie v rod Photobacterium a fágy které infikují určité druhy sinice. Většina však předpovídala manA Sekvence RNA jsou odvozeny z DNA shromážděné od nekultivovaných mořské bakterie. Téměř všechny manA RNA jsou umístěny tak, aby mohly být v 5 'nepřekládané oblasti z protein -kódování geny, a proto se předpokládalo, že manA RNA fungují jako cis-regulační prvky. Vzhledem k jejich relativní složitosti sekundární struktura a jejich hypotéza cis- regulační role, mohou být riboswitche.
Geny, o kterých se předpokládalo, že jsou regulovány manA RNA jsou nejčastěji ty, které se podílejí na metabolismus cukrů fruktóza a manóza, syntéza nukleotidy bakteriální fotosyntéza a třída bílkovin chaperony známý jako ibpA. manA RNA také často sousedí s přenos RNA a pravděpodobně jsou s nimi přepsány. Ačkoli tyto geny nejsou považovány za typické pro fágy, dříve bylo pozorováno, že fágy infikující sinice tyto geny běžně začleňují.[3][4][5]
Reference
- ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (prosinec 2009). „Výjimečná strukturovaná nekódující RNA odhalená analýzou bakteriálních metagenomů“. Příroda. 462 (7273): 656–659. doi:10.1038 / nature08586. PMC 4140389. PMID 19956260.
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
- ^ Sullivan MB, Coleman ML, Weigele P, Rohwer F, Chisholm SW (květen 2005). „Tři genomy cyanofága Prochlorococcus: charakteristické rysy a ekologické interpretace“. PLOS Biol. 3 (5): e144. doi:10.1371 / journal.pbio.0030144. PMC 1079782. PMID 15828858.
- ^ Rohwer F, Thurber RV (květen 2009). "Viry manipulují s mořským prostředím". Příroda. 459 (7244): 207–212. doi:10.1038 / nature08060. PMID 19444207. S2CID 4397295.
- ^ Lindell D, Jaffe JD, Coleman ML a kol. (Září 2007). „Dynamika exprese mořského viru a hostitele v celém genomu odhaluje vlastnosti společné evoluce“. Příroda. 449 (7158): 83–86. doi:10.1038 / nature06130. PMID 17805294.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |