MED27 - MED27

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Med27
Identifikátory
Symbol	Med27
Pfam	PF11571
InterPro	IPR021627
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

MED27
Identifikátory
Aliasy	MED27, CRAP34, CRSP34, CRSP8, TRAP37, MED3, podjednotka komplexu mediátoru 27
Externí ID	OMIM: 605044 MGI: 1916225 HomoloGene: 3152 Genové karty: MED27
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	132,079,867 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	29,524,793 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• komplex mediátorů; • jádro; • buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • komplex ubikvitin ligázy; • cytosol;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • udržování populace kmenových buněk; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • ubikvitinace bílkovin; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9442
	68975
	ENSG00000160563
	ENSMUSG00000026799
	Q6P2C8
	Q9DB40
	NM_001253881; NM_001253882; NM_004269
	NM_001290489; NM_026896; NM_029615; NM_001290490
	NP_001240810; NP_001240811; NP_004260
	NP_001277418; NP_001277419; NP_081172; NP_083891
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Mediátor transkripční podjednotky RNA polymerázy II 27 je enzym že u lidí je kódován MED27 gen.^[5]^[6] Je součástí Komplex mediátorů.

Všudypřítomný výraz Med27 mRNA naznačuje univerzální požadavek na Med27 při iniciaci transkripce. Ztráta Crsp34 / Med27 snižuje amakrin buňka počet, ale zvyšuje počet prutů fotoreceptorové buňky.^[7]

Aktivace genové transkripce je vícestupňový proces, který je spouštěn faktory, které rozpoznávají místa zesilovače transkripce v DNA. Tyto faktory spolupracují s koaktivátory k přímé iniciaci transkripce pomocí zařízení RNA polymerázy II. Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou komplexu CRSP (kofaktor vyžadovaný pro aktivaci SP1), který je spolu s TFIID nezbytný pro účinnou aktivaci pomocí SP1. Tento protein je také součástí dalších multisubunitových komplexů, např. proteiny spojené s receptorem hormonu štítné žlázy (TR-), které interagují s TR a usnadňují funkci TR na šablonách DNA ve spojení s iniciačními faktory a kofaktory.^[6]

Viz také

Komplex mediátorů

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160563 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026799 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (únor 1999). „Transkripční kofaktorový komplex CRSP je vyžadován pro aktivitu proteinu Sp1 vázajícího enhancer“. Příroda. 397 (6718): 446–50. Bibcode:1999 Natur.397..446R. doi:10.1038/17141. PMID 9989412. S2CID 4405569.
^ ^A ^b „Entrez Gene: pro aktivaci transkripce Sp1 je vyžadován kofaktor CRSP8, podjednotka 8, 34 kDa“.
^ Dürr K, Holzschuh J, Filippi A, Ettl AK, Ryu S, Shepherd IT, Driever W (říjen 2006). „Diferenciální role transkripčních podjednotek komplexu mediátorů Crsp34 / Med27, Crsp150 / Med14 a Trap100 / Med24 během vývoje sítnice zebrafish“. Genetika. 174 (2): 693–705. doi:10.1534 / genetika.105.055152. PMC 1602071. PMID 16582438.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR021627

Další čtení

Roth J, Krause M (1977). „[Vztah mezi zjevnou bronchiální obstrukcí a bronchiální hyperreaktivitou (autorův překlad)]“. Zeitschrift für Erkrankungen der Atmungsorgane. 146 (1): 12–6. PMID 1020353.
Gress TM, Müller-Pillasch F, Geng M a kol. (1996). "Profil exprese specifický pro rakovinu pankreatu". Onkogen. 13 (8): 1819–30. PMID 8895530.
Malik S, Gu W, Wu W a kol. (2000). „Transkripční koaktivátor odvozený od USA PC2 je submodul TRAP / SMCC a působí synergicky s jinými PC“. Mol. Buňka. 5 (4): 753–60. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80254-3. PMID 10882111.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2003). "Identifikace savčích podjednotek Mediator s podobnostmi s kvasinkami Mediator podjednotek Srb5, Srb6, Med11 a Rox3". J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–7. doi:10,1074 / jbc.C300054200. PMID 12584197.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2004). „Savčí homolog transkripčního koaktivátoru intersexu Drosophila melanogaster je podjednotkou savčího mediátorového komplexu“. J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. doi:10,1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ a kol. (2004). "Savčí podjednotka mediátoru, která sdílí vlastnosti s podjednotkou mediátoru Saccharomyces cerevisiae Cse2". J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. doi:10,1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. Bibcode:2004 Natur.429..369H. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ a kol. (2004). „Sada konsensuálních podjednotek savčích mediátorů identifikovaných multidimenzionální technologií identifikace proteinů“. Mol. Buňka. 14 (5): 685–91. doi:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160563 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026799 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9989412-5] Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (únor 1999). „Transkripční kofaktorový komplex CRSP je vyžadován pro aktivitu proteinu Sp1 vázajícího enhancer“. Příroda. 397 (6718): 446–50. Bibcode:1999 Natur.397..446R. doi:10.1038/17141. PMID 9989412. S2CID 4405569.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: pro aktivaci transkripce Sp1 je vyžadován kofaktor CRSP8, podjednotka 8, 34 kDa“.

[pmid16582438-7] Dürr K, Holzschuh J, Filippi A, Ettl AK, Ryu S, Shepherd IT, Driever W (říjen 2006). „Diferenciální role transkripčních podjednotek komplexu mediátorů Crsp34 / Med27, Crsp150 / Med14 a Trap100 / Med24 během vývoje sítnice zebrafish“. Genetika. 174 (2): 693–705. doi:10.1534 / genetika.105.055152. PMC 1602071. PMID 16582438.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]