MED24 - MED24 - Wikipedia

MED24
Identifikátory
Aliasy	MED24, ARC100, CRSP100, CRSP4, DRIP100, THRAP4, TRAP100, MED5, podjednotka komplexu mediátorů 24
Externí ID	OMIM: 607000 MGI: 1344385 HomoloGene: 40795 Genové karty: MED24
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	40,061,215 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	98,729,435 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • vazba na receptory hormonů štítné žlázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu; • vazba na receptory vitaminu D.; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • komplex mediátorů;
Biologický proces	• signální dráha androgenového receptoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • signalizační dráha pro intracelulární steroidní hormonový receptor; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9862
	23989
	ENSG00000008838
	ENSMUSG00000017210
	O75448
	Q99K74
	NM_001079518; NM_001267797; NM_014815; NM_001330211
NM_011869; NM_001361993; NM_001361994; NM_001361995; NM_001378926;
	NM_001378927
	NP_001072986; NP_001254726; NP_001317140; NP_055630
NP_035999; NP_001348922; NP_001348923; NP_001348924; NP_001365855;
	NP_001365856
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Mediátor transkripční podjednotky RNA polymerázy II 24 je enzym že u lidí je kódován MED24 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje složku mediátorového komplexu (také známého jako TRAP, SMCC, DRIP nebo ARC), komplex transkripčního koaktivátoru, který je považován za nezbytný pro expresi téměř všech genů. Komplex mediátoru je přijímán transkripčními aktivátory nebo jadernými receptory k indukci genové exprese, pravděpodobně interakcí s RNA polymerázou II a podporou tvorby transkripčního preiniciačního komplexu. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že MED24 komunikovat s Estrogenový receptor alfa,^[6]^[7] Cyklin-dependentní kináza 8,^[7]^[8] Kalcitriolový receptor^[6]^[8] a BRCA1.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000008838 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017210 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: THRAP4 protein štítné žlázy spojený s proteinem 4".
^ ^A ^b Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (Červen 2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
^ ^A ^b Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (březen 2002). „Komplex koaktivátoru TRAP / Mediator interaguje přímo s estrogenovými receptory alfa a beta prostřednictvím podjednotky TRAP220 a přímo zvyšuje funkci estrogenových receptorů in vitro“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (5): 2642–7. doi:10.1073 / pnas.261715899. PMC 122401. PMID 11867769.
^ ^A ^b Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (březen 1999). „Identita mezi komplexy TRAP a SMCC naznačuje nové cesty pro funkci jaderných receptorů a různých savčích aktivátorů“. Molekulární buňka. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID 10198638.
^ Wada O, Oishi H, Takada I, Yanagisawa J, Yano T, Kato S (srpen 2004). „Funkce BRCA1 zprostředkovává komplex TRAP / DRIP přímou interakcí s TRAP220“. Onkogen. 23 (35): 6000–5. doi:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID 15208681.

Další čtení

Gustafsson CM, Samuelsson T (červenec 2001). "Mediátor - univerzální komplex v transkripční regulaci". Molekulární mikrobiologie. 41 (1): 1–8. doi:10.1046 / j.1365-2958.2001.02481.x. PMID 11454195. S2CID 30224146.
Malik S, Roeder RG (květen 2005). "Dynamická regulace transkripce pol II savčím mediátorovým komplexem". Trendy v biochemických vědách. 30 (5): 256–63. doi:10.1016 / j.tibs.2005.03.009. PMID 15896744.
Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (srpen 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
Fondell JD, Ge H, Roeder RG (srpen 1996). „Ligandová indukce transkripčně aktivního komplexu koaktivátoru receptoru hormonu štítné žlázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (16): 8329–33. doi:10.1073 / pnas.93.16.8329. PMC 38670. PMID 8710870.
Rachez C, Suldan Z, Ward J, Chang CP, Burakov D, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (červen 1998). „Nový proteinový komplex, který interaguje s receptorem vitaminu D3 způsobem závislým na ligandu a zvyšuje transaktivaci VDR v bezbuněčném systému“. Geny a vývoj. 12 (12): 1787–800. doi:10.1101 / gad.12.12.1787. PMC 316901. PMID 9637681.
Yuan CX, Ito M, Fondell JD, Fu ZY, Roeder RG (červenec 1998). „Složka TRAP220 komplexu koaktivátoru s proteinem spojeným s receptorem štítné žlázy (TRAP) interaguje přímo s jadernými receptory způsobem závislým na ligandu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (14): 7939–44. doi:10.1073 / pnas.95.14.7939. PMC 20908. PMID 9653119.
Gu W, Malik S, Ito M, Yuan CX, Fondell JD, Zhang X, Martinez E, Qin J, Roeder RG (leden 1999). "Nový lidský komplex kofaktorů obsahujících SRB / MED, SMCC, zapojený do regulace transkripce". Molekulární buňka. 3 (1): 97–108. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80178-1. PMID 10024883.
Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (březen 1999). „Identita mezi komplexy TRAP a SMCC naznačuje nové cesty pro funkci jaderných receptorů a různých savčích aktivátorů“. Molekulární buňka. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID 10198638.
Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (duben 1999). „Aktivace transkripce závislá na ligandu jadernými receptory vyžaduje komplex DRIP“. Příroda. 398 (6730): 824–8. doi:10.1038/19783. PMID 10235266. S2CID 204992765.
Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (duben 1999). "Kompozitní koaktivátor ARC zprostředkovává transkripční aktivaci zaměřenou na chromatin". Příroda. 398 (6730): 828–32. doi:10.1038/19789. PMID 10235267. S2CID 23646963.
Ryu S, Tjian R (červen 1999). „Čištění komplexu transkripčních kofaktorů CRSP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (13): 7137–42. doi:10.1073 / pnas.96.13.7137. PMC 22029. PMID 10377381.
Zhang J, Fondell JD (červenec 1999). „Identifikace myší TRAP100: transkripční koregulační faktor pro receptory hormonu štítné žlázy a vitaminu D“. Molekulární endokrinologie. 13 (7): 1130–40. doi:10.1210 / me.13.7.1130. PMID 10406464.
Taatjes DJ, Näär AM, Andel F, Nogales E, Tjian R (únor 2002). "Struktura, funkce a aktivátorem vyvolané konformace CRSP koaktivátoru". Věda. 295 (5557): 1058–62. doi:10.1126 / science.1065249. PMID 11834832. S2CID 23446878.
Surapureddi S, Yu S, Bu H, Hashimoto T, Yeldandi AV, Kashireddy P, Cherkaoui-Malki M, Qi C, Zhu YJ, Rao MS, Reddy JK (září 2002). "Identifikace transkripčně aktivního peroxisomového proliferátoru aktivovaného receptorového komplexu alfa-interakčního kofaktoru v játrech potkanů a charakterizace PRIC285 jako koaktivátoru". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (18): 11836–41. doi:10.1073 / pnas.182426699. PMC 129355. PMID 12189208.
Wang Q, Sharma D, Ren Y, Fondell JD (listopad 2002). „Koregulační role komplexu TRAP-mediátor v genové expresi zprostředkované androgenovým receptorem“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (45): 42852–8. doi:10,1074 / jbc.M206061200. PMID 12218053.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Parmely TJ, Sorokina I, Brower CS, Conaway RC, Conaway JW (prosinec 2003). „Savčí homolog transkripčního koaktivátoru intersexu Drosophila melanogaster je podjednotkou savčího mediátorového komplexu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (50): 49671–4. doi:10,1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, Banks CA, Sorokina I, Florens L, Zybailov B, Washburn MP, Brower CS, Conaway RC, Conaway JW (únor 2004). "Savčí podjednotka mediátoru, která sdílí vlastnosti s podjednotkou mediátoru Saccharomyces cerevisiae Cse2". The Journal of Biological Chemistry. 279 (7): 5846–51. doi:10,1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000008838 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017210 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: THRAP4 protein štítné žlázy spojený s proteinem 4".

[pmid12837248-6] A ^b Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (Červen 2003). „Komplex WINAC remodelační komplex WINAC se zaměřuje na jaderný receptor na promotory a je narušen Williamsovým syndromem“. Buňka. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

[pmid11867769-7] A ^b Kang YK, Guermah M, Yuan CX, Roeder RG (březen 2002). „Komplex koaktivátoru TRAP / Mediator interaguje přímo s estrogenovými receptory alfa a beta prostřednictvím podjednotky TRAP220 a přímo zvyšuje funkci estrogenových receptorů in vitro“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (5): 2642–7. doi:10.1073 / pnas.261715899. PMC 122401. PMID 11867769.

[pmid10198638-8] A ^b Ito M, Yuan CX, Malik S, Gu W, Fondell JD, Yamamura S, Fu ZY, Zhang X, Qin J, Roeder RG (březen 1999). „Identita mezi komplexy TRAP a SMCC naznačuje nové cesty pro funkci jaderných receptorů a různých savčích aktivátorů“. Molekulární buňka. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID 10198638.

[pmid15208681-9] Wada O, Oishi H, Takada I, Yanagisawa J, Yano T, Kato S (srpen 2004). „Funkce BRCA1 zprostředkovává komplex TRAP / DRIP přímou interakcí s TRAP220“. Onkogen. 23 (35): 6000–5. doi:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID 15208681.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]