Malá cytoplazmatická RNA spojená s MALAT1 - MALAT1-associated small cytoplasmic RNA

Malá cytoplazmatická RNA spojená s MALAT1
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence mascRNA-menRNA
Identifikátory
Symbol	mascRNA-menRNA
Rfam	RF01684
Další údaje
RNA typ	Gen
Domény	Eukaryota
JÍT	GO: 2000147
TAK	SO: 0001263
PDB struktur	PDBe

Malá cytoplazmatická RNA spojená s MALAT1, také známý jako mascRNA, je nekódující RNA nalezen v cytosol. Jedná se o malou RNA o délce přibližně 53–61 nukleotidů, která je zpracována z mnohem delší ncRNA zvané MALAT1 enzymem zvaným RNáza P.^[1] Tato RNA je exprimována v mnoha různých lidských tkáních, je vysoce konzervována evolucí a sdílí pozoruhodnou podobnost s tRNA který je také produkován RNázou P, přesto tato RNA není aminoacylována v HeLa buňkách. Zdá se, že primární transkript MALAT1 (transkript 1 plicního adenokarcinomu spojený s metastázami) je upregulován u několika maligních rakoviny.^[2]Další malá RNA, která je homologní na mascRNA, zvanou menRNA, se zpracovává z další dlouhé ncRNA zvané MEN beta.^[3]

Zdá se, že MALAT1 je zapojen do regulace alternativní sestřih. MALAT1 interaguje s SR proteiny, ovlivňující jejich distribuci v domény jaderných skvrn.^[4]

Viz také

Reference

^ Wilusz JE, Freier SM, Spector DL (2008). "3 'konec zpracování dlouhé nukleárně zadržené nekódující RNA poskytuje cytoplazmatickou RNA podobnou tRNA". Buňka. 135 (5): 919–932. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.012. PMC 2722846. PMID 19041754.
^ Ji P, Diederichs S, Wang W, Böing S, Metzger R, Schneider PM, Tidow N, Brandt B, Buerger H, Bulk E, Thomas M, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (2003). „MALAT-1, nová nekódující RNA a thymosin beta4 předpovídají metastázy a přežití u nemalobuněčného karcinomu plic v rané fázi“. Onkogen. 22 (39): 8031–8041. doi:10.1038 / sj.onc.1206928. PMID 12970751.
^ Sunwoo H, Dinger ME, Wilusz JE, Amaral PP, Mattick JS, Spector DL (2009). „MUŽI nekódující RNA s epsilonem / beta s nukleárním retence jsou při diferenciaci svalů up-regulovány a jsou nezbytnou součástí parazitů“. Genome Res. 19 (3): 347–359. doi:10.1101 / gr.087775.108. PMC 2661813. PMID 19106332.
^ Tripathi V, Ellis JD, Shen Z, Song DY, Pan Q, Watt AT, Freier SM, Bennett CF, Sharma A, Bubulya PA, Blencowe BJ, Prasanth SG, Prasanth KV (2010). „Nekódující RNA MALAT1 s retencí v jádru reguluje alternativní sestřih modulací fosforylace faktoru sestřihu SR“. Mol Cell. 39 (6): 925–938. doi:10.1016 / j.molcel.2010.08.011. PMC 4158944. PMID 20797886.

Další čtení

Bernard D, Prasanth KV, Tripathi V, Colasse S, Nakamura T, Xuan Z, Zhang MQ, Sedel F, Jourdren L, Coulpier F, Triller A, Spector DL, Bessis A (2010). "Dlouhá nukleární retence nekódující RNA reguluje synaptogenezi modulací genové exprese". EMBO J.. 29 (18): 3082–3093. doi:10.1038 / emboj.2010.199. PMC 2944070. PMID 20729808.
Tano K, Mizuno R, Okada T, Rakwal R, Shibato J, Masuo Y, Ijiri K, Akimitsu N (2010). „MALAT-1 zvyšuje buněčnou motilitu buněk plicního adenokarcinomu ovlivněním exprese genů souvisejících s motilitou“. FEBS Lett. 584 (22): 4575–4580. doi:10.1016 / j.febslet.2010.10.008. PMID 20937273.

externí odkazy

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid19041754-1] Wilusz JE, Freier SM, Spector DL (2008). "3 'konec zpracování dlouhé nukleárně zadržené nekódující RNA poskytuje cytoplazmatickou RNA podobnou tRNA". Buňka. 135 (5): 919–932. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.012. PMC 2722846. PMID 19041754.

[pmid12970751-2] Ji P, Diederichs S, Wang W, Böing S, Metzger R, Schneider PM, Tidow N, Brandt B, Buerger H, Bulk E, Thomas M, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (2003). „MALAT-1, nová nekódující RNA a thymosin beta4 předpovídají metastázy a přežití u nemalobuněčného karcinomu plic v rané fázi“. Onkogen. 22 (39): 8031–8041. doi:10.1038 / sj.onc.1206928. PMID 12970751.

[pmid19106332-3] Sunwoo H, Dinger ME, Wilusz JE, Amaral PP, Mattick JS, Spector DL (2009). „MUŽI nekódující RNA s epsilonem / beta s nukleárním retence jsou při diferenciaci svalů up-regulovány a jsou nezbytnou součástí parazitů“. Genome Res. 19 (3): 347–359. doi:10.1101 / gr.087775.108. PMC 2661813. PMID 19106332.

[pmid20797886-4] Tripathi V, Ellis JD, Shen Z, Song DY, Pan Q, Watt AT, Freier SM, Bennett CF, Sharma A, Bubulya PA, Blencowe BJ, Prasanth SG, Prasanth KV (2010). „Nekódující RNA MALAT1 s retencí v jádru reguluje alternativní sestřih modulací fosforylace faktoru sestřihu SR“. Mol Cell. 39 (6): 925–938. doi:10.1016 / j.molcel.2010.08.011. PMC 4158944. PMID 20797886.

[1]

[2]

[3]

[4]