Lysidin (nukleosid) - Lysidine (nucleoside)
 | |
| Jména | |
|---|---|
| Název IUPAC 2-Amino-6- [4-amino-1- (3,4-dihydroxy-5-hydroxymethyloxolan-2-yl) -1H-pyrimidin-2-ylidenamino] hexanová kyselina | |
| Ostatní jména 4-Amino-2- (N (6) -lysino) -1-ribofuranosylpyrimidin | |
| Identifikátory | |
3D model (JSmol ) | |
| ChemSpider | |
PubChem CID | |
Řídicí panel CompTox (EPA) | |
| |
| |
| Vlastnosti | |
| C15H25N5Ó6 | |
| Molární hmotnost | 371,39 g / mol |
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
 ověřit (co je   ?) | |
| Reference Infoboxu | |
Lysidin je neobvyklý nukleosid, zřídka viděný mimo tRNA. Je to derivát cytidin ve kterém je karbonyl nahrazen aminokyselina lysin. Třetí pozice v antikodon izoleucinově specifické tRNA se obvykle mění z cytidinu, který by se pároval s guanosin na lysidin, který bude základní pár s adenosin. Uridin nelze použít v této pozici, i když je to běžný partner pro adenosin, protože také "kolísavý pár bází "s guanosinem. Takže lysidin umožňuje lepší věrnost překladu."[1][2]
Lysidinové páry bází s adenosinem v kontextu páru bází Cytidin-guanosin. R = ribóza. Šipky označují vodíkové vazby přecházející z vodíku na akceptor vazby. Zápis pro lysidin, L, je zobrazen výše.
Reference
- ^ Nakanishi K, Fukai S, Ikeuchi Y a kol. (Květen 2005). "Strukturální základ pro tvorbu lysidinu pomocí ATP pyrofosfatázy doprovázené smyčkou specifickou pro lysin a doménou rozpoznávající tRNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (21): 7487–7492. doi:10.1073 / pnas.0501003102. PMC 1140429. PMID 15894617.
- ^ Salowe SP, Wiltsie J, Hawkins JC, Sonatore LM (10. dubna 2009). „Katalytická flexibilita tRNAIle-lysidinsyntetázy může generovat alternativní tRNA substráty pro isoleucyl-tRNA syntetázu“. J Biol Chem. 284 (15): 9656–9662. doi:10,1074 / jbc.M809013200. PMC 2665086. PMID 19233850.