Liprin-alfa-1 - Liprin-alpha-1

PPFIA1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N7F
Identifikátory
Aliasy	PPFIA1„LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF interagující protein alfa 1
Externí ID	OMIM: 611054 MGI: 1924750 HomoloGene: 20802 Genové karty: PPFIA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	70,385,312 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	144,553,729 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita převodníku signálu;
Buněčná složka	• presynaptická aktivní zóna; • ohnisková adheze; • cytoplazma; • cytosol; • axon; • dendrit; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• buněčná matice adheze; • negativní regulace sestavy napěťových vláken; • signální transdukce; • negativní regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • GO: Sekvence neurotransmiteru 0010554; • sekrece glutamátu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8500
	233977
	ENSG00000131626
	ENSMUSG00000037519
	Q13136
	n / a
	NM_003626; NM_177423; NM_001378006
	NM_001033319; NM_001195086
	NP_003617; NP_803172; NP_001364935
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Liprin-alfa-1 je protein že u lidí je kódován PPFIA1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem LAR protein tyrosin fosfatáza rodina interakčních proteinů (liprin). Lipriny interagují s členy rodiny LAR transmembránových proteinových tyrosin fosfatáz, o nichž je známo, že jsou důležité pro vedení axonů a vývoj mléčné žlázy. Tento protein se váže na intracelulární membránovou distální doménu fosfatázy tyrosin fosfatázy LAR a zdá se, že lokalizuje LAR na fokální adheze buněk. Tato interakce může regulovat demontáž ohniskové adheze a tak pomáhat organizovat interakce buňka-matice. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že protein tyrosin fosfatáza, typ receptoru, f polypeptid (PTPRF), interagující protein (liprin), alfa 1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131626 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037519 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (srpen 1995). „LAR transmembránový protein tyrosin fosfatáza a spirálovitě vinutý LAR interagující protein se společně lokalizují v ohniskových adhezích“. EMBO J.. 14 (12): 2827–2838. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. PMC 398401. PMID 7796809.
^ ^A ^b ^C ^d Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (červenec 1998). „Liprins, rodina proteinů interagujících s LAR transmembránový protein-tyrosin fosfatáza“. J Biol Chem. 273 (25): 15611–15620. doi:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PPFIA1 protein tyrosin fosfatáza, typ receptoru, f polypeptid (PTPRF), interagující protein (liprin), alfa 1“.
^ ^A ^b ^C Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (říjen 2003). „Interakce rodiny ERC proteinů vázajících RIM s rodinou liprin-alfa proteinů více domén“. J. Biol. Chem. 278 (43): 42377–85. doi:10,1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.
^ ^A ^b Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (březen 2003). „Pro cílení na AMPA receptory je nutná interakce mezi liprin-alfa a GIT1“. J. Neurosci. 23 (5): 1667–77. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMC 6741975. PMID 12629171.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ ^A ^b ^C Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (prosinec 1995). „Podrodina LAR / PTP delta / PTP sigma transmembránových proteinů-tyrosin-fosfatáz: více lidských izoforem LAR, PTP delta a PTP sigma je exprimováno tkáňově specifickým způsobem a spojuje se s proteinem LIP interagujícím LIP.1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (25): 11686–90. doi:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.

Další čtení

Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (1996). „Podrodina LAR / PTP delta / PTP sigma transmembránových proteinů-tyrosin-fosfatáz: více lidských izoforem LAR, PTP delta a PTP sigma je exprimováno tkáňově specifickým způsobem a spojuje se s proteinem LIP interagujícím LIP.1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (25): 11686–11690. doi:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.
Wyszynski M, Kim E, Dunah AW, Passafaro M, Valtschanoff JG, Serra-Pagès C, Streuli M, Weinberg RJ, Sheng M (2002). „Pro cílení na AMPA receptory je nutná interakce mezi GRIP a liprin-alfa / SYD2“. Neuron. 34 (1): 39–52. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00640-2. PMID 11931740.
Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (2003). „Pro cílení na AMPA receptory je nutná interakce mezi liprin-alfa a GIT1“. J. Neurosci. 23 (5): 1667–1677. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMID 12629171.
Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (2004). „Interakce rodiny ERC proteinů vázajících RIM s rodinou liprin-alfa proteinů více domén“. J. Biol. Chem. 278 (43): 42377–42385. doi:10,1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). „Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace“. Curr. Biol. 14 (16): 1436–1450. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–1178. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Serra-Pagès C, Streuli M, Medley QG (2006). „Fosforylace liprinu reguluje vazbu na LAR: důkazy o autofosforylaci liprinu“. Biochemie. 44 (48): 15715–15724. doi:10.1021 / bi051434f. PMC 2529169. PMID 16313174.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–814. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–648. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Hoogenraad CC, Feliu-Mojer MI, Spangler SA, Milstein AD, Dunah AW, Hung AY, Sheng M (2007). „Odbourávání Liprinalpha1 vápníkovou / kalmodulinem závislou proteinkinázou II reguluje distribuci tyrosin fosfatázy LAR receptoru a vývoj dendritů“. Dev. Buňka. 12 (4): 587–602. doi:10.1016 / j.devcel.2007.02.006. PMID 17419996.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q13136 (Liprin-alfa-1) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131626 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037519 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7796809-5] A ^b Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (srpen 1995). „LAR transmembránový protein tyrosin fosfatáza a spirálovitě vinutý LAR interagující protein se společně lokalizují v ohniskových adhezích“. EMBO J.. 14 (12): 2827–2838. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. PMC 398401. PMID 7796809.

[pmid9624153-6] A ^b ^C ^d Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (červenec 1998). „Liprins, rodina proteinů interagujících s LAR transmembránový protein-tyrosin fosfatáza“. J Biol Chem. 273 (25): 15611–15620. doi:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PPFIA1 protein tyrosin fosfatáza, typ receptoru, f polypeptid (PTPRF), interagující protein (liprin), alfa 1“.

[pmid12923177-8] A ^b ^C Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (říjen 2003). „Interakce rodiny ERC proteinů vázajících RIM s rodinou liprin-alfa proteinů více domén“. J. Biol. Chem. 278 (43): 42377–85. doi:10,1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.

[pmid12629171-9] A ^b Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (březen 2003). „Pro cílení na AMPA receptory je nutná interakce mezi liprin-alfa a GIT1“. J. Neurosci. 23 (5): 1667–77. doi:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMC 6741975. PMID 12629171.

[pmid16189514-10] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid8524829-11] A ^b ^C Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (prosinec 1995). „Podrodina LAR / PTP delta / PTP sigma transmembránových proteinů-tyrosin-fosfatáz: více lidských izoforem LAR, PTP delta a PTP sigma je exprimováno tkáňově specifickým způsobem a spojuje se s proteinem LIP interagujícím LIP.1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (25): 11686–90. doi:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]