PPFIBP1 - PPFIBP1

PPFIBP1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, protein vázající PPFIA 1
Externí IDOMIM: 603141 MGI: 1914783 HomoloGene: 2685 Genové karty: PPFIBP1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 12 (lidský)
Chr.Chromozom 12 (lidský)[1]
Chromozom 12 (lidský)
Genomická poloha pro PPFIBP1
Genomická poloha pro PPFIBP1
Kapela12p11.23-p11.22Start27,523,431 bp[1]
Konec27,695,564 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PPFIBP1 203735 x at fs.png

PBB GE PPFIBP1 214374 s na fs.png

PBB GE PPFIBP1 203736 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001198915
NM_001198916
NM_003622
NM_177444

NM_001170433
NM_026221
NM_001355728
NM_001355729

RefSeq (protein)

NP_001185844
NP_001185845
NP_003613
NP_803193

NP_001163904
NP_080497
NP_001342657
NP_001342658

Místo (UCSC)Chr 12: 27,52 - 27,7 MbChr 6: 146,89 - 147,03 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Liprin-beta-1 je protein že u lidí je kódován PPFIBP1 gen.[5][6][7]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů LAR protein-tyrosin fosfatáza (liprin). Lipriny interagují s členy rodiny LAR transmembránových proteinových tyrosin fosfatáz, o nichž je známo, že jsou důležité pro vedení axonů a vývoj mléčné žlázy. Bylo navrženo, že lipriny jsou multivalentní proteiny, které tvoří složité struktury a působí jako lešení pro nábor a ukotvení rodiny LAR tyrosin fosfatáz. Bylo zjištěno, že tento protein interaguje s S100A4, proteinem vázajícím vápník souvisejícím s invazivitou nádoru a metastázami. In vitro experiment prokázal, že interakce inhibovala fosforylaci tohoto proteinu pomocí proteinové kinázy C a proteinové kinázy CK2. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že PPFIBP1 komunikovat s liprin-alfa-1.[5]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110841 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016487 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Serra-Pages C, Medley QG, ​​Tang M, Hart A, Streuli M (červenec 1998). „Liprins, rodina proteinů interagujících s LAR transmembránový protein-tyrosin fosfatáza“. J Biol Chem. 273 (25): 15611–20. doi:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID  9624153.
  6. ^ Kriajevska M, Fischer-Larsen M, Moertz E, Vorm O, Tulchinsky E, Grigorian M, Ambartsumian N, Lukanidin E (únor 2002). „Liprin beta 1, člen rodiny proteinů interagujících s transmembránovou tyrosin fosfatázou LAR, je novým cílem proteinu S100A4 (Mts1) spojeného s metastázami“. J Biol Chem. 277 (7): 5229–35. doi:10,1074 / jbc.M110976200. PMID  11836260.
  7. ^ A b „Entrez Gene: PPFIBP1 PTPRF interagující protein, vázající protein 1 (liprin beta 1)“.

Další čtení