Lee Altenberg - Lee Altenberg
Lee Altenberg | |
|---|---|
| narozený | Lee Altenberg |
| Státní občanství | USA |
| Alma mater | University of California, Berkeley |
| Známý jako | Vývoj evolučnosti Princip redukce |
| Ocenění | Onipa`a Award (2011) |
| Vědecká kariéra | |
| Pole | Evoluční teorie Populační genetika Lineární algebra |
| Instituce | University of Hawaii at Mānoa Institut Konrada Lorenza Duke University |
| Teze | Zevšeobecnění teorie o vývoji modifikujících genů (1984) |
| Doktorský poradce | Marcus W. Feldman[1] |
| Ostatní akademičtí poradci | Glenys Thomson |
| Vlivy | Marcus Feldman, Sam Karlin, Michael Conrad, Rupert Riedl, Lawrence Goodwyn, David M. Josephson |
| webová stránka | dynamika |
Lee Altenberg je teoretický biolog. Je docentem na katedře informačních a počítačových věd na VŠE University of Hawaii at Mānoa. On je nejlépe známý pro jeho práci, která pomohla založit vývoj evolučnosti a modularita v mapa genotyp-fenotyp jako oblasti výzkumu v evoluční biologii,[2][3] pro přesun teoretických konceptů mezi poli evoluční biologie a evoluční výpočet,[4][5][6] a za jeho matematické sjednocení a zobecnění modifikační genové modely pro vývoj přenosu biologických informací, čímž se pod jediný matematický rámec vyvinul vývoj rychlostí mutací, rychlostí rekombinací, rychlostí sexuální reprodukce a rychlostí šíření.[7][8]
Altenberg je editorem časopisu BioSystems, a slouží v redakčních radách časopisů Genetické programování a vyvíjející se stroje a Umělý život a na Společnost IEEE pro výpočetní inteligenci Pracovní skupina pro umělý život a složité adaptivní systémy.[9]
Vzdělávání
Altenberg získal titul B.A. v genetice v roce 1980 na University of California, Berkeley s diplomovou prací doporučenou Glenys Thomson o teorii výběr závislý na frekvenci.[10] Získal titul Ph.D. in Biological Sciences in 1985 at Stanfordská Univerzita s poradcem Marcus W. Feldman s disertační prací, která sjednotila modely evoluce modifikujícího genu.[11]
Kariéra
Altenberg absolvoval postgraduální stipendia na Stanford University, North Carolina State University a Duke University. Zatímco postdoktorandem v Duke University Altenberg nabídl první kurz dne evoluční výpočet být tam uveden. Když jeho otec onemocněl kryoglobulinémie, přestěhoval se s ním do Havaj pro teplé teploty.[12] V roce 2002 byl Altenberg jmenován docentem informačních a počítačových věd na University of Hawai`i v Mānoa. Znovu nabídl první kurzy evolučních výpočtů, které se tam budou konat. V roce 2013 byl Altenberg dlouhodobým návštěvníkem Matematický biologický institut na Ohio State University a v letech 2014–2016 působil jako Senior Fellow na Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research. The Board of Regents University of Hawai schválil jeho povýšení na řádného profesora v roce 2020.[13]
Výzkum
Altenbergův výzkum se zaměřuje na odhalování matematických vztahů v rámci dynamiky biologické evoluce a evoluční algoritmy. Zejména se zajímá o jevy vyššího řádu, jako je evoluce vyvíjitelnost, vývoj genetická informace přenos a vývoj systému mapa genotyp-fenotyp. Jeho hlavním úspěchem bylo (1) sjednotit teorii vývoje genetických systémů (rychlosti rekombinace a mutace) jejich začleněním do prostoru inkluzivního dědictví, které zahrnuje prostorové i kulturní informace, a (2) vyvinout koncept variační vlastnosti organismů jako jevy podléhající evoluční dynamice. To zahrnuje objev mechanismů, které vedou k vývoji vyvíjitelnost, a modularita na mapě genotyp-fenotyp.[14][7]
Matematická inkluzivnost jeho teoretické práce umožnila jeho uplatnění na problémy evolučních výpočtů.[8] Jeho práce na vývoji přenosu biologických informací vyžadovala vývoj nových spektrální věty pro lineární operátory, včetně sjednocení teorie reakce-difúze předpovídající vývoj pomalého rozptýlení s předpovědi principu redukce pro modely mutace, rekombinace a vývoje rychlosti migrace.[15] Aplikoval spektrální teorii k pochopení vývoje mutační robustnost.[16]
Altenberg představil řadu konceptů, které byly přijaty v několika oblastech:
- zavedení Cenová rovnice do evoluční výpočetní teorie[14][17]
- mechanismy pro vývoj evolučnosti a modularity[14][18][19][20][21]
- pojmové rozlišení generativních a variační vlastnosti mapy genotyp-fenotyp[20][22]
- výběr plodů v evolučních algoritmech[14][23]
- zobecnění Stuart Kauffman je NK krajiny,[18] aplikován na technologický vývoj[24]
- zobecnění principu redukce do nekonečných dimenzionálních prostorů, který sjednotil modely reakce a difúze pro vývoj rozptýlení,[15] a byl aplikován na epidemické modely.[25]
Environmentální a společenská práce
- Historie Leland Stanford zapomenuté prosazování dělnická družstva[26][27]
- Vyhláška o světelném znečištění pro Maui na Havaji[28]
- Zachování nížinatých suchých původních lesů na Maui na Hawai[29]
Ceny a vyznamenání
- Kalifornie delegát na Národní vědecký tábor mládeže v roce 1975[30]
- University of California Regents Učenec 1975-1979[30]
- Zvolen do Phi Beta Kappa v roce 1979[30]
- Bachelor of Arts with Distinction in General Scholarship, University of California, Berkeley, 1980
- Lékařská fakulta Stanfordské univerzity Děkanův postdoktorand Fellow 1985-1986[30]
- Předseda Native Hawaiian Plant Society on Maui 2005-2007
- Cena Onipa`a v roce 2011,[31] udělená Havajskou kapitolou Sierra Club, za jeho práci při přijímání legislativy, aby se zabránilo světelné znečištění na Maui,[28] a uchovat ohrožené havajské nížinné suché lesní stanoviště na Maui na věčnost.[29]
- Senior člen týmu Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research 2014-2016[7]
- Společnost IEEE pro výpočetní inteligenci Rozhovor o projektu orální historie v roce 2017[6]
- Člen Institut základních otázek (FQXi) v roce 2020[32]
Profesní společnosti
Altenberg je doživotním členem:
externí odkazy
Reference
- ^ Lee Altenberg na Matematický genealogický projekt
- ^ Baraniuk, Chris (2. března 2017). „Život se může ve skutečnosti zlepšovat ve vývoji“. BBC Země. Citováno 14. září 2019.
- ^ Nuño de la Rosa, Laura (2017). „Výpočet rozšířené syntézy: Mapování dynamiky a koncepční struktury fronty výzkumu evolvability“. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution. 328 (5): 395–411. doi:10.1002 / jez.b.22741. PMID 28488750.
- ^ Charles W. Petit (27. července 1998). „Touched by nature: uvedení evoluce do práce na montážní lince“. Genetické programování. US News & World Report. Citováno 19. září 2019.
- ^ Lee Altenberg (2016). Kliman, Richard M. (ed.). Encyclopedia of Evolutionary Biology. Elsevier. 40–47. ISBN 9780128000496.
- ^ A b Rudolf Seising; Lee Altenberg. „Interview with Lee Altenberg, 2017: CIS Oral History Project“ (Video). Společnost IEEE pro výpočetní inteligenci. Honolulu, Hawai: IEEE. Citováno 16. září 2019.
Rozhovor s členem CIS Lee Altenbergem, zaznamenaný na konferenci IEEE Symposium Series on Computational Intelligence (IEEE SSCI 2017) 2017. Rozhovor Rudolfa Seisinga.
- ^ A b C „Fellows Lee Altenberg“. Institut Konrada Lorenza. KLI. Citováno 16. září 2019.
- ^ A b "Životopis Lee Altenberga". 2017: Projekt orální historie CIS. IEEE.TV. Citováno 15. září 2019.
- ^ „Pracovní skupina pro umělý život a složité adaptivní systémy“. binghamton.edu. Citováno 18. září 2019.
- ^ Altenberg, Lee (1991). „Chaos z lineárního výběru závislého na frekvenci“. Americký přírodovědec. 138 (1): 51–68. doi:10.1086/285204.
- ^ Altenberg, Lee (1984). Zevšeobecnění teorie o vývoji modifikujících genů. Stanford University: Univerzitní mikrofilmy. p. 237. CiteSeerX 10.1.1.187.5507.
- ^ Hráz, Dr. Diane (22. února 2013). „Tátaova cesta s kryoglobulinemií, Dr. Lee Altenberg“ (Video). Blog Talk Radio. Eagle, CO 81631: Blog Talk Radio. Citováno 19. září 2019.CS1 maint: umístění (odkaz)
- ^ „Seznam držby a propagace UH 2020“. University of Hawai 'i News. University of Hawai 'i. 22. června 2020. Citováno 28. července 2020.
- ^ A b C d Lee Altenberg (1994). Kinnear, Kenneth (ed.). Evoluce evoluční schopnosti v genetickém programování. Cambridge, MA: MIT Press. 47–74. ISBN 9780262515535.
- ^ A b Altenberg, Lee (2012). „Lineární operátoři pozitivních na rozpouštědlo vykazují fenomén redukce“. Sborník Národní akademie věd. 109 (10): 3705–3710. arXiv:1108.4546. Bibcode:2012PNAS..109,3705A. doi:10.1073 / pnas.1113833109. PMC 3309728. PMID 22357763.
- ^ Altenberg, Lee (2015). "Základní vlastnosti vývoje mutační robustnosti". p. 1508.07866. arXiv:1508.07866 [q-bio.PE ].
- ^ Altenberg, Lee (1995). Whitley, Darrell L .; Vose, Michael D. (eds.). Věta o schématu a Priceova věta. San Mateo, Kalifornie: Morgan Kaufmann. 23–49. ISBN 978-1-55860-356-1. Citováno 24. listopadu 2019.
- ^ A b Altenberg, Lee (1994). "Vyvíjíme lepší reprezentace prostřednictvím selektivního růstu genomu". Sborník z 1. konference IEEE o evolučních výpočtech. 1: 182–187. doi:10.1109 / ICEC.1994.350019. ISBN 0-7803-1899-4.
- ^ Altenberg, Lee (1994). Sebald, A.V. (vyd.). Vznikající jevy v genetickém programování. World Scientific Publishing. 233–241. ISBN 9810218109.
- ^ A b Altenberg, Lee (1995). "Růst genomu a vývoj mapy genotyp-fenotyp". V Banzhaf, Wolfgang; Eeckman, Frank H. (eds.). Evoluce a biopočítání: výpočetní modely evoluce. Přednášky z informatiky. 899. Berlín; New York: Springer-Verlag Berlin Heidelberg. str. 205–259. doi:10.1007/3-540-59046-3_11. ISBN 978-3-540-59046-0.
- ^ Wagner, Günter P .; Altenberg, Lee (červen 1996). „Složité adaptace a vývoj evolučnosti“. Vývoj. 50 (3): 967–976. doi:10.1111 / j.1558-5646.1996.tb02339.x. ISSN 0014-3820. PMID 28565291.
- ^ Armbruster, W Scott (2014). „Integrované fenotypy: porozumění kovarianci znaků u rostlin a zvířat“. Filozofické transakce Královské společnosti B: Biologické vědy. 369 (1649): 20130245. doi:10.1098 / rstb.2013.0245. PMC 4084533. PMID 25002693.
- ^ Uy, Nguyen Quang (2011). „Sémanticky založený crossover v genetickém programování: aplikace na reálnou symbolickou regresi“ (PDF). Genetické programování a vyvíjející se stroje. Springer. 12 (2): 91–119. doi:10.1007 / s10710-010-9121-2. hdl:10197/3528.
- ^ Johann Peter Murmann; Koen Frenken (2006). „Směrem k systematickému rámci pro výzkum dominantních návrhů, technologických inovací a průmyslových změn“ (PDF). Politika výzkumu. Elsevier. 35 (7): 925–952. doi:10.1016 / j.respol.2006.04.011.
- ^ Gao, Daozhou; Dong, Chao-Ping (2020). "Rychlá difúze potlačuje propuknutí nemoci". Proceedings of the American Mathematical Society. 148 (4): 1709–1722. arXiv:1907.12229. doi:10.1090 / proc / 14868.
- ^ Altenberg, Lee (1990). „Beyond Capitalism: Leland Stanford's Forgotten Vision“. Pískovec a dlaždice. Stanford, Kalifornie: Stanfordská historická společnost. 14 (1): 8–20. Citováno 16. září 2019.
- ^ Schott-Rosenfield, Abigail (23. prosince 2014). „Historický koutek: Vize Lelanda Stanforda o Stanfordu“. Stanford denně. Citováno 14. září 2019.
- ^ A b Hurley, Timothy (24. ledna 2002). „Milovníci hvězd Maui chtějí temnou oblohu“. Inzerent v Honolulu. Citováno 14. září 2019.
- ^ A b San Nicolas, Claudine (16. května 2007). „Projekt Maui s 1 400 jednotkami je napaden“. Maui News. Citováno 16. září 2019.
- ^ A b C d Altenberg, Lee. "Životopis". dynamics.org. Citováno 16. září 2019.
- ^ „Šéf DLNR vystoupí na výročním zasedání Sierra Clubu“. Lahaina News. Citováno 14. září 2019.
- ^ „Členství FQXi“. Institut základních otázek. Citováno 21. dubna 2020.
