LMO2 - LMO2

LMO2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XJY, 2XJZ, 2YPA, 4KFZ
Identifikátory
Aliasy	LMO2, RBTN2, RBTNL1, RHOM2, TTG2, pouze doména LIM 2, LMO-2
Externí ID	OMIM: 180385 MGI: 102811 HomoloGene: 4072 Genové karty: LMO2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	33,892,076 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	103,981,878 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivace transkripčního faktoru aktivující RNA polymerázu II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru bHLH; • Vazba e-boxu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • transkripce mRNA z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na stimul hormonu štítné žlázy; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4005
	16909
	ENSG00000135363
	ENSMUSG00000032698
	P25791
	P25801
	NM_001142315; NM_001142316; NM_005574
	NM_001142335; NM_001142336; NM_001142337; NM_008505
	NP_001135787; NP_001135788; NP_005565
	NP_001135807; NP_001135808; NP_001135809; NP_032531
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

LIM doména pouze 2 (rhombotin podobný 1), také známý jako LMO2, RBTNL1, RBTN2, RHOM2, LIM Domain Only Protein 2, TTG2, a Translokační protein T-buněk 2, je protein který je u lidí kódován LMO2 gen.^[5]

Funkce

LMO2 kóduje dva bohaté na cysteiny LIM doména bílkovina potřebná pro žloutkový váček erytropoéza.^[6] Protein LMO2 má ústřední a zásadní roli v krvetvorné je vysoce konzervativní.

Klinický význam

Aberantní LMO2 exprese je významným rysem akutní lymfoblastické leukémie T buněk s více popsanými mechanismy aktivace.^[7]^[8] Počáteční místo transkripce LMO2 je umístěno přibližně 25 kb za transklačním klastrem T-buněk 11p13 (11p13 ttc), kde řada Akutní lymfoblastická leukémie T-buněk - dochází ke specifickým translokacím.^[9] Proti proudu nekódující DNA prvek je také místem opakujících se mutací v Akutní lymfoblastická leukémie T buněk, což vede k náboru transkripčního faktoru MYB a významnému obohacení H3K27ac, a tím k tvorbě aberantního enhanceru, který reguluje expresi LMO2 ^[10] Dále rekurentní a somaticky získané mutace LMO2 intron 1 vedlo k jeho nadměrné expresi u dospělých i pediatrických pacientů Akutní lymfoblastická leukémie T buněk.^[11] Tyto mutace zavádějí nová vazebná místa pro transkripční faktory pro MYB, ETS1 a RUNX1, což umožňuje tvorbu aberantního promotoru, který řídí LMO2 výraz.

Interakce

LMO2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135363 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032698 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (květen 1991). „Rodina rhombotinů na cysteiny bohaté na onkogeny LIM-domény: odlišné členy se podílejí na translokacích T-buněk do lidských chromozomů 11p15 a 11p13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (10): 4367–71. doi:10.1073 / pnas.88.10.4367. PMC 51660. PMID 2034676.
^ Warren AJ, Colledge WH, Carlton MB, Evans MJ, Smith AJ, Rabbitts TH (červenec 1994). „Onkogenní protein rbtn2 bohatý na cysteiny LIM domény je nezbytný pro vývoj erytroidů“. Buňka. 78 (1): 45–57. doi:10.1016/0092-8674(94)90571-1. PMID 8033210. S2CID 7156927.
^ Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (květen 1991). „Rodina rhombotinů na cysteiny bohaté na onkogeny LIM-domény: odlišné členy se podílejí na translokacích T-buněk do lidských chromozomů 11p15 a 11p13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (10): 4367–71. doi:10.1073 / pnas.88.10.4367. PMC 51660. PMID 2034676.
^ Fisch P, Boehm T, Lavenir I, Larson T, Arno J, Forster A, Rabbitts TH (prosinec 1992). „Akutní lymfoblastický lymfom T-buněk indukovaný u transgenních myší geny RBTN1 a RBTN2 LIM-domény“. Onkogen. 7 (12): 2389–97. PMID 1461647.
^ EntrezGene 4005
^ Abraham BJ, Hnisz D, Weintraub AS, Kwiatkowski N, Li CH, Li Z a kol. (Únor 2017). „Malé genomové inzerce tvoří zesilovače, které nesprávně regulují onkogeny“. Příroda komunikace. 8: 14385. doi:10.1038 / ncomms14385. PMC 5309821. PMID 28181482.
^ Rahman S, Magnussen M, León TE, Farah N, Li Z, Abraham BJ a kol. (Červen 2017). „LMO2 onkogen prostřednictvím somaticky získaného neomorfního promotoru u akutní lymfoblastické leukémie T-buněk“. Krev. 129 (24): 3221–3226. doi:10.1182 / krev-2016-09-742148. PMC 5472898. PMID 28270453.
^ ^A ^b ^C Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (říjen 1995). „Sdružení transkripčních faktorů erytroidu: komplexy zahrnující protein LIM RBTN2 a protein zinek-prst GATA1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (21): 9585–9. doi:10.1073 / pnas.92.21.9585. PMC 40846. PMID 7568177.
^ Mao S, Neale GA, Goorha RM (duben 1997). „T-buněčný onkogen rhombotin-2 interaguje s proteinem vázajícím retinoblastom 2“. Onkogen. 14 (13): 1531–9. doi:10.1038 / sj.onc.1200988. PMID 9129143.
^ Bégay-Müller V, Ansieau S, Leutz A (červen 2002). „LIM doménový protein Lmo2 se váže na AF6, translokační partner onkogenu MLL“. FEBS Dopisy. 521 (1–3): 36–8. doi:10.1016 / s0014-5793 (02) 02814-4. PMID 12067721. S2CID 29461336.
^ Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (říjen 1994). „Specifická in vivo asociace mezi bHLH a LIM proteiny zapojenými do leukémie lidských T buněk“. Časopis EMBO. 13 (20): 4831–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. PMC 395422. PMID 7957052.
^ Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (srpen 1994). „LIM protein RBTN2 a základní protein helix-loop-helix TAL1 jsou přítomny v komplexu v erytroidních buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (18): 8617–21. doi:10.1073 / pnas.91.18.8617. PMC 44657. PMID 8078932.
^ Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P a kol. (Leden 2006). „ETO2 koordinuje buněčnou proliferaci a diferenciaci během erytropoézy“. Časopis EMBO. 25 (2): 357–66. doi:10.1038 / sj.emboj.7600934. PMC 1383517. PMID 16407974.

Další čtení

Royer-Pokora B, Loos U, Ludwig WD (říjen 1991). „TTG-2, nový gen kódující protein bohatý na cystein s motivem LIM, je nadměrně exprimován u akutní leukémie T-buněk s t (11; 14) (p13; q11)“. Onkogen. 6 (10): 1887–93. PMID 1923511.
Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (květen 1991). „Rodina rhombotinů na cysteiny bohaté na onkogeny LIM-domény: odlišné členy se podílejí na translokacích T-buněk do lidských chromozomů 11p15 a 11p13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (10): 4367–71. doi:10.1073 / pnas.88.10.4367. PMC 51660. PMID 2034676.
Boehm T, Spillantini MG, Sofroniew MV, Surani MA, Rabbitts TH (květen 1991). "Vývojově regulovaná a tkáňově specifická exprese mRNA kódující dvě alternativní formy onkogenu rhombotinu domény LIM: důkaz exprese brzlíku". Onkogen. 6 (5): 695–703. PMID 2052354.
Dong WF, Xu Y, Hu QL, Munroe D, Minowada J, Housman DE, Minden MD (listopad 1995). "Molekulární charakterizace bodu zlomu translokace chromozomu t (11; 14) (p13; q11) z buněčné linie KOPT-K1". Leukémie. 9 (11): 1812–7. PMID 7475267.
Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (říjen 1995). „Sdružení transkripčních faktorů erytroidu: komplexy zahrnující protein LIM RBTN2 a protein zinek-prst GATA1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (21): 9585–9. doi:10.1073 / pnas.92.21.9585. PMC 40846. PMID 7568177.
Sánchez-García I, Axelson H, Rabbitts TH (duben 1995). „Funkční rozmanitost proteinů LIM: aminoterminální aktivační domény v onkogenních proteinech RBTN1 a RBTN2“. Onkogen. 10 (7): 1301–6. PMID 7731680.
Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (říjen 1994). „Specifická in vivo asociace mezi bHLH a LIM proteiny zapojenými do leukémie lidských T buněk“. Časopis EMBO. 13 (20): 4831–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. PMC 395422. PMID 7957052.
Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (srpen 1994). „LIM protein RBTN2 a základní protein helix-loop-helix TAL1 jsou přítomny v komplexu v erytroidních buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (18): 8617–21. doi:10.1073 / pnas.91.18.8617. PMC 44657. PMID 8078932.
Wilkinson DA, Neale GA, Mao S, Naeve CW, Goorha RM (leden 1997). „Elf-2, vazba rhombotinu-2 na transkripční faktor: objev a potenciální role v leukémii T buněk“. Leukémie. 11 (1): 86–96. doi:10.1038 / sj.leu.2400516. PMID 9001422.
Mao S, Neale GA, Goorha RM (duben 1997). „T-buněčný onkogen rhombotin-2 interaguje s proteinem vázajícím retinoblastom 2“. Onkogen. 14 (13): 1531–9. doi:10.1038 / sj.onc.1200988. PMID 9129143.
Osada H, Grutz GG, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (duben 1997). „Pouze protein LIM Lmo2 tvoří proteinový komplex s erytroidním transkripčním faktorem GATA-1“. Leukémie. 11 Příloha 3: 307–12. PMID 9209374.
Wadman IA, Osada H, Grütz GG, Agulnick AD, Westphal H, Forster A, Rabbitts TH (červen 1997). „Protein Lmo2 obsahující pouze LIM je přemosťující molekula sestavující erytroidní komplex vázající DNA, který zahrnuje proteiny TAL1, E47, GATA-1 a Ldb1 / NLI“. Časopis EMBO. 16 (11): 3145–57. doi:10.1093 / emboj / 16.11.3145. PMC 1169933. PMID 9214632.
Visvader JE, Mao X, Fujiwara Y, Hahm K, Orkin SH (prosinec 1997). „Protein vázající LIM-doménu Ldb1 a jeho partner LMO2 působí jako negativní regulátory diferenciace erytroidů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (25): 13707–12. doi:10.1073 / pnas.94.25.13707. PMC 28370. PMID 9391090.
Jurata LW, Pfaff SL, Gill GN (únor 1998). „NLI nukleární interaktivace domény domény zprostředkovává homo- a heterodimerizaci transkripčních faktorů domény LIM“.. The Journal of Biological Chemistry. 273 (6): 3152–7. doi:10.1074 / jbc.273.6.3152. PMID 9452425.
Kenny DA, Jurata LW, Saga Y, Gill GN (září 1998). „Identifikace a charakterizace LMO4, genu LMO s novým vzorem exprese během embryogeneze“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (19): 11257–62. doi:10.1073 / pnas.95.19.11257. PMC 21629. PMID 9736723.
Ono Y, Fukuhara N, Yoshie O (prosinec 1998). „Proteiny pouze TAL1 a LIM synergicky indukují expresi retinaldehyddehydrogenázy 2 v akutní lymfoblastické leukémii T-buněk tím, že působí jako kofaktory pro GATA3“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (12): 6939–50. doi:10.1128 / MCB.18.12.6939. PMC 109277. PMID 9819382.
Bach I, Rodriguez-Esteban C, Carrière C, Bhushan A, Krones A, Rose DW a kol. (Srpen 1999). „RLIM inhibuje funkční aktivitu transkripčních faktorů LIM homeodomény prostřednictvím náboru komplexu histon-deacetylázy“. Genetika přírody. 22 (4): 394–9. doi:10.1038/11970. PMID 10431247. S2CID 22326394.
Vitelli L, Condorelli G, Lulli V, Hoang T, Luchetti L, Croce CM, Peschle C (červenec 2000). „Transkripční komplex pentameru včetně proteinu tal-1 a proteinu retinoblastomu downmoduluje expresi c-kitu v normálních erytroblastech“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (14): 5330–42. doi:10.1128 / MCB.20.14.5330-5342.2000. PMC 85982. PMID 10866689.
Davenport J, Neale GA, Goorha R (listopad 2000). „Identifikace genů potenciálně zapojených do leukemogeneze indukované LMO2“. Leukémie. 14 (11): 1986–96. doi:10.1038 / sj.leu.2401913. PMID 11069036.
Sum EY, Peng B, Yu X, Chen J, Byrne J, Lindeman GJ, Visvader JE (březen 2002). „Protein LMO4 domény LIM interaguje s kofaktorem CtIP a supresorem nádoru BRCA1 a inhibuje aktivitu BRCA1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (10): 7849–56. doi:10,1074 / jbc.M110603200. PMID 11751867.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P25791 (Lidský rhombotin-2) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P25801 (Myš Rhombotin-2) u PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135363 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032698 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2034676-5] Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (květen 1991). „Rodina rhombotinů na cysteiny bohaté na onkogeny LIM-domény: odlišné členy se podílejí na translokacích T-buněk do lidských chromozomů 11p15 a 11p13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (10): 4367–71. doi:10.1073 / pnas.88.10.4367. PMC 51660. PMID 2034676.

[pmid8033210-6] Warren AJ, Colledge WH, Carlton MB, Evans MJ, Smith AJ, Rabbitts TH (červenec 1994). „Onkogenní protein rbtn2 bohatý na cysteiny LIM domény je nezbytný pro vývoj erytroidů“. Buňka. 78 (1): 45–57. doi:10.1016/0092-8674(94)90571-1. PMID 8033210. S2CID 7156927.

[7] Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (květen 1991). „Rodina rhombotinů na cysteiny bohaté na onkogeny LIM-domény: odlišné členy se podílejí na translokacích T-buněk do lidských chromozomů 11p15 a 11p13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (10): 4367–71. doi:10.1073 / pnas.88.10.4367. PMC 51660. PMID 2034676.

[8] Fisch P, Boehm T, Lavenir I, Larson T, Arno J, Forster A, Rabbitts TH (prosinec 1992). „Akutní lymfoblastický lymfom T-buněk indukovaný u transgenních myší geny RBTN1 a RBTN2 LIM-domény“. Onkogen. 7 (12): 2389–97. PMID 1461647.

[entrez-9] EntrezGene 4005

[10] Abraham BJ, Hnisz D, Weintraub AS, Kwiatkowski N, Li CH, Li Z a kol. (Únor 2017). „Malé genomové inzerce tvoří zesilovače, které nesprávně regulují onkogeny“. Příroda komunikace. 8: 14385. doi:10.1038 / ncomms14385. PMC 5309821. PMID 28181482.

[11] Rahman S, Magnussen M, León TE, Farah N, Li Z, Abraham BJ a kol. (Červen 2017). „LMO2 onkogen prostřednictvím somaticky získaného neomorfního promotoru u akutní lymfoblastické leukémie T-buněk“. Krev. 129 (24): 3221–3226. doi:10.1182 / krev-2016-09-742148. PMC 5472898. PMID 28270453.

[pmid7568177-12] A ^b ^C Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (říjen 1995). „Sdružení transkripčních faktorů erytroidu: komplexy zahrnující protein LIM RBTN2 a protein zinek-prst GATA1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (21): 9585–9. doi:10.1073 / pnas.92.21.9585. PMC 40846. PMID 7568177.

[pmid9129143-13] Mao S, Neale GA, Goorha RM (duben 1997). „T-buněčný onkogen rhombotin-2 interaguje s proteinem vázajícím retinoblastom 2“. Onkogen. 14 (13): 1531–9. doi:10.1038 / sj.onc.1200988. PMID 9129143.

[pmid12067721-14] Bégay-Müller V, Ansieau S, Leutz A (červen 2002). „LIM doménový protein Lmo2 se váže na AF6, translokační partner onkogenu MLL“. FEBS Dopisy. 521 (1–3): 36–8. doi:10.1016 / s0014-5793 (02) 02814-4. PMID 12067721. S2CID 29461336.

[pmid7957052-15] Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (říjen 1994). „Specifická in vivo asociace mezi bHLH a LIM proteiny zapojenými do leukémie lidských T buněk“. Časopis EMBO. 13 (20): 4831–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. PMC 395422. PMID 7957052.

[pmid8078932-16] Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (srpen 1994). „LIM protein RBTN2 a základní protein helix-loop-helix TAL1 jsou přítomny v komplexu v erytroidních buňkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (18): 8617–21. doi:10.1073 / pnas.91.18.8617. PMC 44657. PMID 8078932.

[pmid16407974-17] Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P a kol. (Leden 2006). „ETO2 koordinuje buněčnou proliferaci a diferenciaci během erytropoézy“. Časopis EMBO. 25 (2): 357–66. doi:10.1038 / sj.emboj.7600934. PMC 1383517. PMID 16407974.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]