LACTB - LACTB

LACTB
Identifikátory
AliasyLACTB, G24, MRPL56, laktamáza beta
Externí IDOMIM: 608440 MGI: 1933395 HomoloGene: 12755 Genové karty: LACTB
Umístění genu (člověk)
Chromozom 15 (lidský)
Chr.Chromozom 15 (lidský)[1]
Chromozom 15 (lidský)
Genomické umístění pro LACTB
Genomické umístění pro LACTB
Kapela15q22.2Start63,121,833 bp[1]
Konec63,142,061 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001288585
NM_032857
NM_171846

NM_030717

RefSeq (protein)

NP_001275514
NP_116246
NP_741982

NP_109642

Místo (UCSC)Chr 15: 63,12 - 63,14 MbChr 9: 66,96 - 66,98 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Serinový beta-laktamázový protein LACTB, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován LACTB gen.[5][6] Tento gen kóduje protein 54 kDa sdílející významnou sekvenční podobnost se serinovými proteázami protein vázající penicilin a beta-laktamáza nadčeleď vyskytující se v bakteriích.[7] Podílí se na regulaci metabolických obvodů. Byla nalezena příčinná souvislost mezi LACTB a obezita.[8] U rakoviny prsu má LACTB funkci potlačující nádory modulací metabolismu lipidů.[9]

Struktura

Gen

The LACTB gen se nachází na chromozom 15q 22.1, skládající se z 8 exony. Alternativní sestřih vede k více variantám transkriptu kódujících odlišný protein izoformy.

Protein

LACTB sdílí sekvenční podobnost s beta-laktamázou /penicilin rodina vazebných proteinů serin proteázy které se účastní bakteriálních buněčná stěna metabolismus. The N-terminál 97 aminokyselina Segment LACTB netvoří součást konzervované domény proteinu vázajícího penicilin, a proto za něj může být zodpovědný organela cílení.[7][10]

Funkce

LACTB je široce vyjádřen v různých savčí tkáně s převládající expresí v člověku kosterní sval. Lokalizuje se v mitochondriální mezimembránový prostor.[10] LACTB může polymerovat na stabilní vlákna zabírat mitochondriální mezimembránový prostor. Předpokládá se, že tato vlákna hrají roli v organizaci submochondrií a proto možná ovlivňují organizaci mitochondriálních metabolonů.[10]

Klinický význam

Bylo zjištěno, že LACTB může způsobit obezitu prostřednictvím analýzy genové koexprese založené na datech integrovaných z více zdrojů. To bylo ověřeno in vivo prostřednictvím nadměrné exprese LACTB v transgenní myši, který vyústil v obézní fenotyp.[8] Bylo také zjištěno, že LACTB je a supresor nádoru svým účinkem na metabolismus mitochondriálních fosfolipidů a modulaci stavu diferenciace buněk.[11]

Interakce

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103642 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032370 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Smith TS, Southan C, Ellington K, Campbell D, Tew DG, Debouck C (listopad 2001). "Identifikace, genomová organizace a exprese mRNA LACTB, kódující protein podobný serin beta-laktamáze s aminoterminální transmembránovou doménou". Genomika. 78 (1–2): 12–4. doi:10.1006 / geno.2001.6643. PMID  11707067.
  6. ^ „Entrez Gene: LACTB lactamase, beta“.
  7. ^ A b Peitsaro N, Polianskyte Z, Tuimala J, Pörn-Ares I, Liobikas J, Speer O, Lindholm D, Thompson J, Eriksson O (2008). „Vývoj rodiny metazoanových aktivních serinových enzymů z proteinů vázajících penicilin: nový aspekt bakteriálního dědictví“. BMC Evoluční biologie. 8: 26. doi:10.1186/1471-2148-8-26. PMC  2266909. PMID  18226203.
  8. ^ A b Chen Y, Zhu J, Lum PY, Yang X, Pinto S, MacNeil DJ, Zhang C, Lamb J, Edwards S, Sieberts SK, Leonardson A, Castellini LW, Wang S, Champy MF, Zhang B, Emilsson V, Doss S Ghazalpour A, Horvath S, Drake TA, Lusis AJ, Schadt EE (březen 2008). „Rozdíly v DNA objasňují molekulární sítě, které způsobují onemocnění“. Příroda. 452 (7186): 429–35. doi:10.1038 / nature06757. PMC  2841398. PMID  18344982.
  9. ^ Eriksson, Ove; Lalowski, Maciej; Lindholm, Dan (2017). „Komentář: LACTB je nádorový supresor, který moduluje metabolismus lipidů a stav buněk“. Hranice ve fyziologii. 8: 396. doi:10.3389 / fphys.2017.00396. ISSN  1664-042X. PMC  5462942. PMID  28642719.
  10. ^ A b C Polianskyte Z, Peitsaro N, Dapkunas A, Liobikas J, Soliymani R, Lalowski M, Speer O, Seitsonen J, Butcher S, Cereghetti GM, Linder MD, Merckel M, Thompson J, Eriksson O (listopad 2009). „LACTB je protein tvořící vlákna lokalizovaný v mitochondriích“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (45): 18960–5. doi:10.1073 / pnas.0906734106. PMC  2767363. PMID  19858488.
  11. ^ Keckesova et al. 2017. LACTB je nádorový supresor, který moduluje metabolismus lipidů a stav buněk. Nature 543: 681-686
  12. ^ Lu JB, Yao XX, Xiu JC, Hu YW (leden 2016). „MicroRNA-125b-5p tlumí produkci proteinu-1 monocytů chemoatraktantu monocytů indukovanou lipopolysacharidy cílením inhibice LACTB v makrofágech THP-1“. Archivy biochemie a biofyziky. 590: 64–71. doi:10.1016 / j.abb.2015.11.007. PMID  26603571.

Další čtení