Lektinová doména typu L. - L-type lectin domain

Lectin_leg-like
PDB 1r1z EBI.jpg
krystalová struktura rozpoznávací domény sacharidů receptoru pro třídění glykoproteinů p58 / ergic-53 odhaluje nové vazebné místo pro kov a konformační změny spojené s vazbou iontů vápníku
Identifikátory
SymbolLectin_leg-like
PfamPF03388
Pfam klanCL0004
InterProIPR005052
SCOP21gv9 / Rozsah / SUPFAM
Membranome719

V molekulární biologii L-jako lektinová doména je proteinová doména nalezen v lektiny které jsou podobné lektiny z luštěnin.

Lektiny jsou strukturálně rozmanité bílkoviny že svázat na konkrétní sacharidy. Tato rodina zahrnuje VIP36 a ERGIC-53 lektiny.[1] Ačkoli proteiny obsahující tuto doménu byly původně identifikovány jako rodina zvířecích lektinů, existují také droždí zástupci.[1]

ERGIC-53 je protein 53 kDa, lokalizovaný v mezilehlé oblasti mezi endoplazmatické retikulum a Golgiho aparát (ER-Golgi-Intermediate Compartment, ERGIC). Bylo identifikováno jako vápník -závislý, manóza - specifický lektin.[2] Své dysfunkce byl spojen s kombinovaným faktory V a VIII nedostatek, což naznačuje důležitou a substrátově specifickou roli ERGIC-53 v glykoprotein - vylučující cesta.[2][3]

Lektinová doména podobná L má celkový kulovitý tvar složený z a beta sendvič dvou hlavních zkroucených antiparalelní beta-listy. Beta-sendvič zahrnuje hlavní konkávní beta-list a menší konvexní beta-list, ve variantě skládací želé.[4][5][6][7]

Reference

  1. ^ A b Fiedler K, Simons K (červen 1994). "Předpokládaná nová třída zvířecích lektinů v sekreční cestě homologní k luštěninovým lektinům". Buňka. 77 (5): 625–6. doi:10.1016/0092-8674(94)90047-7. PMID  8205612. S2CID  21111364.
  2. ^ A b Itin C, Roche AC, Monsigny M, Hauri HP (březen 1996). „ERGIC-53 je funkční manosový selektivní a na vápníku závislý lidský homolog luštěninových lektinů“. Mol. Biol. Buňka. 7 (3): 483–93. doi:10,1091 / mbc.7.3.483. PMC  275899. PMID  8868475.
  3. ^ Nichols WC, Terry VH, Wheatley MA, Yang A, Zivelin A, Ciavarella N, Stefanile C, Matsushita T, Saito H, de Bosch NB, Ruiz-Saez A, Torres A, Thompson AR, Feinstein DI, White GC, Negrier C Vinciguerra C, Aktan M, Kaufman RJ, Ginsburg D, Seligsohn U (duben 1999). „ERGIC-53 genová struktura a analýza mutací v 19 kombinovaných rodinách faktorů V a VIII s nedostatkem“. Krev. 93 (7): 2261–6. PMID  10090935.
  4. ^ Velloso LM, Svensson K, Schneider G, Pettersson RF, Lindqvist Y (květen 2002). „Krystalová struktura rozpoznávací domény sacharidů p58 / ERGIC-53, proteinu podílejícího se na exportu glykoproteinu z endoplazmatického retikula“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15979–84. doi:10,1074 / jbc.M112098200. PMID  11850423.
  5. ^ Velloso LM, Svensson K, Pettersson RF, Lindqvist Y (prosinec 2003). „Krystalová struktura domény rozpoznávající sacharidy receptoru pro třídění glykoproteinů p58 / ERGIC-53 odhaluje nepředvídané vazebné místo pro kov a konformační změny spojené s vazbou na ionty vápníku. J. Mol. Biol. 334 (5): 845–51. doi:10.1016 / j.jmb.2003.10.031. PMID  14643651.
  6. ^ Satoh T, Sato K, Kanoh A, Yamashita K, Yamada Y, Igarashi N, Kato R, Nakano A, Wakatsuki S (duben 2006). „Struktury domény rozpoznávání sacharidů Ca2 + nezávislých nákladních receptorů Emp46p a Emp47p“. J. Biol. Chem. 281 (15): 10410–9. doi:10,1074 / jbc.M512258200. PMID  16439369.
  7. ^ Satoh T, Cowieson NP, Hakamata W, Ideo H, Fukushima K, Kurihara M, Kato R, Yamashita K, Wakatsuki S (září 2007). „Strukturální základna pro rozpoznávání glykoproteinů s vysokým obsahem manózy typem transportního lektinu savců VIP36“ (PDF). J. Biol. Chem. 282 (38): 28246–55. doi:10,1074 / jbc.M703064200. PMID  17652092. S2CID  33042130.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR005052